MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Terriglobus roseus DSM 18391 chromosome

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018014	TGGCGT	2	12	90662	90673	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018014	TGAGAC	2	12	122169	122180	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_018014	TTGTGT	2	12	150593	150604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018014	CTTTTT	2	12	165298	165309	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018014	CTGTGC	2	12	183815	183826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018014	TTTGTT	2	12	268510	268521	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018014	GCAAAA	2	12	300973	300984	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018014	CAAAGA	2	12	353251	353262	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018014	GTTTTG	2	12	385992	386003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018014	GACTGC	2	12	393448	393459	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018014	ATGGGA	2	12	404048	404059	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018014	AAAGCA	2	12	417829	417840	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018014	AGCGCC	2	12	494615	494626	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018014	CCCAAT	2	12	495429	495440	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018014	GACAGC	2	12	496760	496771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018014	TGAGAC	4	24	500556	500579	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018014	CTGAGA	2	12	500580	500591	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018014	ACGCCG	2	12	540153	540164	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018014	CGAAAA	2	12	604471	604482	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018014	ACGCTG	2	12	615882	615893	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018014	CAGAAA	2	12	617851	617862	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018014	CCTGTC	2	12	669410	669421	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018014	TTGGTC	2	12	708783	708794	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018014	GCATCG	2	12	773184	773195	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018014	TGCGAT	2	12	793805	793816	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018014	CTCTGT	2	12	855572	855583	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018014	CACGGT	2	12	855669	855680	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018014	CTGCGC	2	12	922106	922117	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018014	AGTCGC	2	12	923263	923274	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018014	CTATGG	2	12	928207	928218	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018014	CATAAA	2	12	929938	929949	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018014	CTTTTT	2	12	1069574	1069585	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018014	CTTTTT	2	12	1069630	1069641	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018014	AGCGGC	2	12	1109210	1109221	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018014	AACCGT	2	12	1119529	1119540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018014	CGATTG	2	12	1121791	1121802	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018014	GGTCGC	2	12	1176087	1176098	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018014	GCAAGC	2	12	1283348	1283359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018014	CTTGCT	2	12	1308557	1308568	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018014	CGTGAA	2	12	1321577	1321588	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018014	AAAGTT	2	12	1324264	1324275	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018014	GTTGTG	2	12	1338185	1338196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018014	CGCCCG	2	12	1338463	1338474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_018014	ACCGAG	2	12	1358769	1358780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018014	CTTGTC	2	12	1372016	1372027	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018014	CTCCAC	2	12	1492035	1492046	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_018014	TGAGGG	2	12	1579187	1579198	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018014	GGATGC	2	12	1581663	1581674	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018014	AACGAC	2	12	1590679	1590690	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018014	TGGCCG	2	12	1604065	1604076	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018014	AGGGGG	2	12	1604715	1604726	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018014	CTGTTT	2	12	1647252	1647263	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018014	ATTCTT	2	12	1670681	1670692	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018014	CAATCG	2	12	1775435	1775446	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018014	TGGCGC	2	12	1813089	1813100	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018014	GCCATG	2	12	1887730	1887741	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018014	AGGTTC	2	12	1957507	1957518	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018014	GAGGCC	2	12	1989590	1989601	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018014	CTATGG	2	12	2078309	2078320	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018014	CATAAA	2	12	2080040	2080051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018014	CGTTGC	2	12	2085217	2085228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018014	CCGTCG	2	12	2122162	2122173	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018014	GCGTCG	2	12	2363927	2363938	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018014	CAGTTC	2	12	2388979	2388990	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018014	GGGCGT	2	12	2391855	2391866	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018014	TCCCGT	2	12	2392428	2392439	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018014	TTGCAT	2	12	2393875	2393886	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018014	TCTCCG	2	12	2427403	2427414	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018014	AGCTGA	2	12	2453834	2453845	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018014	CTCCAC	2	12	2461927	2461938	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_018014	TCTCTG	2	12	2462611	2462622	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018014	GGCAAA	2	12	2484168	2484179	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018014	CACCGG	2	12	2485693	2485704	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018014	CAAGGC	2	12	2486020	2486031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018014	TGCAGC	2	12	2486092	2486103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018014	GATCCG	2	12	2491349	2491360	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018014	ATCGCA	2	12	2515258	2515269	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018014	GTGCCC	2	12	2547675	2547686	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018014	TCACGG	2	12	2547943	2547954	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018014	TCAACA	2	12	2548277	2548288	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018014	CATGCT	2	12	2584599	2584610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018014	GAAGCA	2	12	2585640	2585651	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_018014	CCCTCT	2	12	2617738	2617749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_018014	CAAAGC	2	12	2695064	2695075	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018014	GCTGGT	2	12	2726988	2726999	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018014	ACCGAG	2	12	2735270	2735281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018014	CGGCCC	2	12	2746599	2746610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_018014	GCGTCG	2	12	2824445	2824456	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018014	CAGTTC	2	12	2849496	2849507	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018014	GGGCGT	2	12	2852372	2852383	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_018014	TCCCGT	2	12	2852945	2852956	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018014	TTGCAT	2	12	2854393	2854404	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018014	TCTCCG	2	12	2887926	2887937	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018014	AGCTGA	2	12	2914357	2914368	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018014	GCGCAA	2	12	2959313	2959324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018014	CGCTGG	2	12	2998498	2998509	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018014	GAAGCA	2	12	3046157	3046168	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018014	CGGCAC	2	12	3049510	3049521	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018014	CCCTCT	2	12	3078257	3078268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018014	CAAAGC	2	12	3155582	3155593	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018014	TGCCGG	2	12	3171688	3171699	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018014	CTGGTC	2	12	3183515	3183526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018014	TCGGCA	2	12	3183571	3183582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018014	CGGCCC	2	12	3207114	3207125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_018014	AAACTT	2	12	3242818	3242829	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018014	ATCAGG	2	12	3252580	3252591	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018014	AGCCAG	2	12	3277420	3277431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018014	AAAGAG	2	12	3312610	3312621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018014	ATAGAG	2	12	3331160	3331171	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018014	GGTAGA	2	12	3342753	3342764	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018014	GTATTT	2	12	3428195	3428206	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018014	GGTGCG	2	12	3532884	3532895	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018014	TGCACC	2	12	3537785	3537796	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018014	ACGTTA	2	12	3543901	3543912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018014	CTGGTG	2	12	3549028	3549039	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018014	TACGAT	2	12	3607838	3607849	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018014	ATTGCC	2	12	3610731	3610742	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018014	TGCCTT	2	12	3622833	3622844	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018014	CCTTCG	2	12	3647328	3647339	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018014	GGGCCA	2	12	3693852	3693863	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018014	TTGAAG	2	12	3727907	3727918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018014	GCAATA	2	12	3754958	3754969	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018014	ATCGCT	2	12	3771181	3771192	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018014	AGCTGT	2	12	3785074	3785085	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_018014	TAAGAG	2	12	3803234	3803245	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018014	AGATCT	2	12	3816714	3816725	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_018014	AATGCG	2	12	3818480	3818491	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_018014	GGGCCA	2	12	3825584	3825595	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018014	GCAGCG	2	12	3831347	3831358	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018014	CAGCGA	2	12	3839035	3839046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018014	GAACCC	2	12	3848945	3848956	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018014	CGCTTT	2	12	3853454	3853465	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018014	CATCGC	2	12	3926109	3926120	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018014	CCAAGT	2	12	3968727	3968738	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018014	GCAATG	2	12	4011742	4011753	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_018014	CAAATC	2	12	4028404	4028415	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018014	CCAAAG	2	12	4090832	4090843	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018014	TGCGGA	2	12	4119418	4119429	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_018014	ATCGAT	2	12	4154231	4154242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_018014	CCCCCT	3	18	4157127	4157144	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
141	NC_018014	CAAAAG	2	12	4211706	4211717	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_018014	CCCTCG	2	12	4225626	4225637	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_018014	GACAGG	2	12	4240331	4240342	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_018014	GAAAAG	2	12	4275935	4275946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018014	CCCTCT	2	12	4276513	4276524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_018014	CAGCCG	2	12	4348943	4348954	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018014	AACAGG	2	12	4389817	4389828	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_018014	TTTCGC	2	12	4405972	4405983	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018014	ACGCAA	2	12	4409548	4409559	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_018014	CGGATC	2	12	4419462	4419473	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_018014	TGATCC	2	12	4428399	4428410	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_018014	CGCAAA	2	12	4456355	4456366	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_018014	CGCAAA	2	12	4456645	4456656	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_018014	ACCCAA	2	12	4462008	4462019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_018014	AGGGGG	2	12	4465398	4465409	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018014	GGTTTG	2	12	4586556	4586567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018014	CAGACT	2	12	4666610	4666621	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_018014	GGGGCC	2	12	4705973	4705984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_018014	GAAGCT	2	12	4710382	4710393	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_018014	CACCGC	2	12	4812319	4812330	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_018014	AGGCGT	2	12	4899295	4899306	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_018014	AGACGA	2	12	4921762	4921773	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_018014	GAGCCG	2	12	4965772	4965783	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_018014	CCCTTT	2	12	5025424	5025435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
165	NC_018014	TCCCTC	2	12	5025591	5025602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_018014	GCTGGA	2	12	5062392	5062403	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
167	NC_018014	TTCGTT	2	12	5067647	5067658	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
168	NC_018014	AGCTAC	2	12	5072285	5072296	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_018014	AACCGC	2	12	5074527	5074538	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
170	NC_018014	AAAAGG	2	12	5133737	5133748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.