MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Tistrella mobilis KA081020-065 plasmid pTM3

Total Repeats: 456

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017958	GGGT	2	8	2308	2315	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017958	GAGC	2	8	4229	4236	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017958	AACC	2	8	4834	4841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017958	GGGC	2	8	5308	5315	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017958	TCGC	2	8	5826	5833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017958	GCAA	2	8	5886	5893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017958	CGCC	2	8	6171	6178	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_017958	GAAA	2	8	9324	9331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017958	CCCG	2	8	11740	11747	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_017958	TGGC	2	8	11765	11772	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017958	GATG	2	8	12218	12225	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017958	TCGG	2	8	12601	12608	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017958	GTCC	2	8	18027	18034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017958	CGGC	2	8	18076	18083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017958	CTGC	2	8	18266	18273	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017958	CCCG	2	8	18498	18505	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_017958	CGGG	2	8	18628	18635	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017958	GCAC	2	8	18661	18668	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017958	GGCA	2	8	21832	21839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017958	CCAC	2	8	25683	25690	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_017958	AGCG	2	8	27704	27711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017958	GTTG	2	8	27796	27803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017958	GAAC	2	8	37264	37271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017958	CATC	2	8	37278	37285	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017958	ATGG	2	8	38123	38130	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017958	CTCA	2	8	48151	48158	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017958	GGCG	2	8	48198	48205	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017958	CGAT	2	8	48308	48315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017958	GCGA	2	8	50086	50093	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017958	GCGA	2	8	56204	56211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017958	GGAA	2	8	61913	61920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017958	ATGA	2	8	63881	63888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017958	CCGC	2	8	64601	64608	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_017958	ACCG	2	8	70525	70532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017958	GGTG	2	8	70694	70701	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017958	CCCG	2	8	74747	74754	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_017958	TGGA	2	8	74782	74789	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017958	CTGC	2	8	74916	74923	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017958	GCGG	2	8	77531	77538	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017958	GAGT	2	8	78401	78408	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017958	TCTT	2	8	82290	82297	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017958	AGCG	2	8	82612	82619	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017958	CGGC	2	8	82654	82661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017958	CATC	2	8	82897	82904	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017958	GGAA	2	8	82910	82917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017958	TCGC	2	8	88432	88439	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017958	CAGT	2	8	88481	88488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017958	GCAG	2	8	89967	89974	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017958	CCTC	2	8	90663	90670	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_017958	GACG	2	8	94670	94677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017958	CTTG	2	8	94741	94748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017958	GGCT	2	8	95545	95552	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017958	CTGC	2	8	95693	95700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017958	GAGC	2	8	95702	95709	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017958	TGGA	2	8	95787	95794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017958	GCCG	3	12	99477	99488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017958	CGGC	2	8	99491	99498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017958	CCGG	2	8	99511	99518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017958	TCAA	2	8	99580	99587	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017958	GGCG	2	8	99874	99881	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017958	CTTC	2	8	99967	99974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017958	TCCC	2	8	99979	99986	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_017958	CAGG	2	8	100033	100040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017958	CAGG	2	8	100044	100051	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017958	CCGC	2	8	101449	101456	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_017958	GGCG	2	8	103262	103269	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017958	ACGC	2	8	105741	105748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017958	GTCC	2	8	108514	108521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017958	ACGC	2	8	108553	108560	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017958	TGCC	3	12	108586	108597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017958	GCCG	3	12	108670	108681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017958	GGCC	2	8	113941	113948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017958	GGCC	2	8	113963	113970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017958	CGTG	2	8	117541	117548	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017958	GACC	2	8	117780	117787	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017958	GCAG	2	8	117805	117812	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017958	GGAC	2	8	121023	121030	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017958	CGCC	2	8	124583	124590	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_017958	CGGG	2	8	125947	125954	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017958	GGCC	2	8	125962	125969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017958	CGGA	2	8	131757	131764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017958	GCCC	2	8	136259	136266	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_017958	CGCC	2	8	140365	140372	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_017958	CGCC	2	8	140388	140395	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_017958	GGGC	2	8	144006	144013	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017958	CCGC	2	8	145407	145414	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_017958	CGGC	2	8	149563	149570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017958	TCGC	2	8	151476	151483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017958	ATCC	2	8	157698	157705	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017958	CCGG	2	8	157817	157824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017958	AGAT	2	8	163873	163880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017958	TCTT	2	8	171339	171346	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017958	CCGC	2	8	175251	175258	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_017958	CCGG	2	8	177967	177974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017958	CCGG	2	8	179458	179465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017958	GAAA	2	8	181609	181616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017958	GCGT	2	8	181658	181665	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017958	CTTC	2	8	181947	181954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017958	GGAG	2	8	182271	182278	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017958	TTGC	2	8	186008	186015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017958	TGGC	2	8	190495	190502	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017958	CGGC	2	8	190583	190590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017958	GCCG	2	8	190591	190598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017958	GGCG	2	8	190864	190871	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017958	GACG	2	8	191186	191193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017958	GCCT	2	8	199042	199049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017958	ATGG	2	8	200203	200210	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017958	GTCT	2	8	202351	202358	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017958	ATCC	2	8	203231	203238	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017958	AGAA	2	8	212538	212545	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017958	ATCC	2	8	212581	212588	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017958	AGGG	2	8	224625	224632	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017958	CCGG	2	8	225710	225717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017958	CGTG	2	8	225999	226006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017958	TACC	2	8	226117	226124	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017958	TCGA	2	8	226203	226210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017958	CTGC	2	8	227005	227012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017958	TTTC	2	8	227055	227062	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017958	GCCG	2	8	229988	229995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017958	TTCA	2	8	231640	231647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017958	TGAT	2	8	237404	237411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017958	CTGA	2	8	238630	238637	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017958	TCAA	2	8	238727	238734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017958	CGGC	2	8	238760	238767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017958	CGGG	2	8	239582	239589	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017958	GACC	2	8	239629	239636	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017958	CGGG	2	8	239691	239698	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017958	ACGC	2	8	241566	241573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017958	GGCT	2	8	242953	242960	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017958	GCGG	2	8	243140	243147	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017958	GTCC	2	8	243148	243155	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017958	GCCG	2	8	243179	243186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017958	AACG	2	8	244187	244194	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017958	GGGT	2	8	248153	248160	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017958	TGGC	2	8	270876	270883	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017958	CCGC	2	8	270976	270983	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
137	NC_017958	GCAC	2	8	271660	271667	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017958	CCGG	2	8	271865	271872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017958	GACG	2	8	275579	275586	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017958	GCCG	2	8	275637	275644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017958	CGCA	2	8	277686	277693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017958	CCGG	2	8	277872	277879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017958	CGCC	2	8	280987	280994	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_017958	ACCC	2	8	281030	281037	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_017958	CGGG	2	8	285304	285311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017958	ATGA	2	8	285350	285357	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017958	TGCC	2	8	289135	289142	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017958	CGTG	2	8	289329	289336	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017958	TCAG	2	8	297312	297319	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017958	GCCC	2	8	298790	298797	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151	NC_017958	GGCC	2	8	300178	300185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017958	TGCG	2	8	300192	300199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_017958	CGGC	2	8	300216	300223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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442	NC_017958	TCAG	2	8	1051030	1051037	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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445	NC_017958	ATGC	2	8	1082537	1082544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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447	NC_017958	CCGG	2	8	1085941	1085948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
448	NC_017958	CCCG	2	8	1086294	1086301	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
449	NC_017958	GGCA	2	8	1086370	1086377	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
450	NC_017958	CCCG	2	8	1093501	1093508	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
451	NC_017958	GGGT	2	8	1096800	1096807	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
452	NC_017958	CCGG	2	8	1107920	1107927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
453	NC_017958	GAAG	2	8	1108884	1108891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017958	CGGC	2	8	1116471	1116478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
455	NC_017958	GGCG	2	8	1118426	1118433	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
456	NC_017958	GCGA	2	8	1118926	1118933	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.