MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 2672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017278	GGA	2	6	867185	867190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017278	C	6	6	867196	867201	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1004	NC_017278	GGC	2	6	867236	867241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017278	G	8	8	867257	867264	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017278	CCGG	2	8	867349	867356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_017278	GCCTG	2	10	867363	867372	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1008	NC_017278	GGCC	2	8	867375	867382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_017278	G	7	7	867383	867389	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1011	NC_017278	AGG	2	6	873165	873170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017278	GGGT	2	8	875881	875888	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017278	GC	3	6	876727	876732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1020	NC_017278	GGC	2	6	881748	881753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017278	AGG	2	6	881815	881820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017278	GCCC	2	8	882208	882215	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1023	NC_017278	GGC	2	6	882220	882225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017278	GCC	2	6	882232	882237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_017278	T	6	6	882262	882267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017278	G	6	6	891213	891218	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1030	NC_017278	G	7	7	894857	894863	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1047	NC_017278	AGG	2	6	917901	917906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1056	NC_017278	CCGCC	2	10	928386	928395	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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1061	NC_017278	CGT	2	6	936699	936704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1064	NC_017278	AGG	2	6	945384	945389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1100	NC_017278	AGGCT	2	10	1007513	1007522	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1101	NC_017278	CCT	3	9	1007551	1007559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_017278	GCC	2	6	1007561	1007566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_017278	CCCT	2	8	1007593	1007600	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1104	NC_017278	CCT	2	6	1007605	1007610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_017278	TCC	3	9	1007616	1007624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_017278	GCGG	2	8	1007677	1007684	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_017278	TCC	2	6	1007691	1007696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_017278	CCTT	2	8	1007703	1007710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1110	NC_017278	G	6	6	1007844	1007849	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1113	NC_017278	GCA	2	6	1007920	1007925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1116	NC_017278	GCC	2	6	1008047	1008052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_017278	CTC	2	6	1008062	1008067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_017278	AGGG	2	8	1009536	1009543	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017278	C	6	6	1009763	1009768	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1121	NC_017278	CCTC	2	8	1009826	1009833	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1122	NC_017278	CTTCC	2	10	1009847	1009856	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1123	NC_017278	AGGGG	2	10	1011544	1011553	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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1130	NC_017278	GCG	2	6	1011905	1011910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017278	GCC	2	6	1011912	1011917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_017278	GGCCTC	2	12	1011923	1011934	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_017278	GGCCAG	2	12	1011935	1011946	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_017278	CAG	2	6	1011998	1012003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1136	NC_017278	GGC	2	6	1012021	1012026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1403	NC_017278	AGT	2	6	1208750	1208755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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