MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 plasmid pTHTHE1601

Total Repeats: 1638

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017273	CCCCTG	2	12	138538	138549	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_017273	GA	3	6	138604	138609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017273	CCT	2	6	138672	138677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_017273	CTC	2	6	138759	138764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_017273	AGCG	2	8	138775	138782	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
506	NC_017273	CCT	2	6	138804	138809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_017273	GGGA	2	8	138813	138820	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017273	GAG	2	6	141530	141535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017273	GAGG	2	8	141620	141627	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017273	GCC	2	6	141649	141654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_017273	CGC	2	6	141697	141702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_017273	GGC	2	6	141772	141777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017273	CTC	2	6	141791	141796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_017273	GGC	2	6	141823	141828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017273	CCT	2	6	141831	141836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_017273	GAG	2	6	141883	141888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017273	TGG	2	6	141945	141950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017273	ACC	2	6	141984	141989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_017273	A	7	7	142012	142018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017273	CTC	2	6	142046	142051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_017273	GAT	2	6	142057	142062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017273	GGC	2	6	142065	142070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017273	TAC	2	6	142079	142084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017273	CA	3	6	142191	142196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_017273	CAC	2	6	142211	142216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_017273	TCCC	2	8	142218	142225	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
527	NC_017273	CTCC	2	8	142278	142285	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
528	NC_017273	C	6	6	142284	142289	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
529	NC_017273	CCT	3	9	142326	142334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_017273	CCA	2	6	142335	142340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_017273	ACC	2	6	143479	143484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_017273	GGT	2	6	143533	143538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017273	CCCT	2	8	146997	147004	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
534	NC_017273	AC	4	8	147036	147043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_017273	GCC	2	6	147065	147070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_017273	ACCTC	2	10	147074	147083	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
537	NC_017273	TCC	2	6	147112	147117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_017273	CCT	2	6	147170	147175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_017273	GAA	2	6	147247	147252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017273	GGAG	2	8	147255	147262	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017273	GCC	2	6	147275	147280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_017273	C	6	6	147279	147284	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
543	NC_017273	TCC	2	6	147285	147290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_017273	GAA	2	6	147323	147328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017273	CCGTG	2	10	147336	147345	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
546	NC_017273	CTT	2	6	147875	147880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_017273	TCC	2	6	147881	147886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_017273	GGC	2	6	147911	147916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017273	GCC	2	6	147927	147932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_017273	TTC	2	6	147946	147951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017273	TCC	2	6	148766	148771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_017273	GCC	2	6	148786	148791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_017273	G	7	7	148845	148851	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017273	C	7	7	148854	148860	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
555	NC_017273	TCA	2	6	148861	148866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_017273	GGC	2	6	148934	148939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017273	GCC	2	6	148948	148953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_017273	A	6	6	148994	148999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017273	GAA	2	6	149052	149057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017273	CGC	2	6	150116	150121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_017273	AGGC	2	8	150176	150183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
562	NC_017273	TCC	2	6	150990	150995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_017273	CCT	2	6	151008	151013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_017273	CCGG	2	8	152481	152488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_017273	AAG	2	6	152496	152501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017273	GAG	2	6	155699	155704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017273	CTT	2	6	155807	155812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017273	CTA	2	6	155840	155845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017273	AGG	2	6	155850	155855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017273	ACC	2	6	155862	155867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_017273	CAGGGA	2	12	155894	155905	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
572	NC_017273	TGG	2	6	155950	155955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017273	G	6	6	155960	155965	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017273	GCC	2	6	156005	156010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_017273	GTCA	2	8	156014	156021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
576	NC_017273	GGC	2	6	156028	156033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_017273	GAC	2	6	156106	156111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_017273	GGC	2	6	156127	156132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017273	GAG	2	6	156161	156166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017273	TGGGA	2	10	156318	156327	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017273	GCG	2	6	156361	156366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017273	AAG	2	6	156405	156410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017273	GTG	2	6	156452	156457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017273	CTG	2	6	156506	156511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017273	GGA	2	6	156514	156519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017273	G	6	6	156549	156554	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017273	GGA	2	6	156571	156576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017273	GGC	2	6	156583	156588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017273	GTG	2	6	156611	156616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017273	GGT	2	6	156625	156630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017273	CGG	2	6	156754	156759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017273	AGGCGG	2	12	156791	156802	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
593	NC_017273	GCT	2	6	156838	156843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017273	CAGAA	2	10	156875	156884	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
595	NC_017273	AGG	2	6	156908	156913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017273	C	6	6	156944	156949	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
597	NC_017273	GAC	2	6	157061	157066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_017273	AAG	2	6	157067	157072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017273	G	7	7	157072	157078	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017273	AGG	2	6	157086	157091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017273	G	6	6	157162	157167	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017273	GAC	2	6	157203	157208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017273	GCC	2	6	157242	157247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_017273	CCT	2	6	157305	157310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_017273	CTT	2	6	157323	157328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017273	CTC	2	6	157357	157362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_017273	TTCCC	2	10	157384	157393	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
608	NC_017273	TTCC	2	8	157499	157506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_017273	CAC	2	6	157769	157774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_017273	TAG	2	6	157812	157817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017273	CAC	2	6	157833	157838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_017273	GGA	2	6	157839	157844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017273	AGC	2	6	157865	157870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_017273	CAC	2	6	157899	157904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_017273	TAG	2	6	157942	157947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017273	CAC	2	6	157963	157968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_017273	GGA	2	6	157969	157974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017273	AGC	2	6	157995	158000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017273	GGC	2	6	158037	158042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017273	CAA	2	6	158073	158078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017273	GT	3	6	158098	158103	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017273	GCT	2	6	158108	158113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017273	GAA	2	6	158142	158147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017273	GGT	2	6	158152	158157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017273	AGC	2	6	158203	158208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017273	TA	3	6	158242	158247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017273	GGCC	2	8	159295	159302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
628	NC_017273	TTG	2	6	159384	159389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017273	GCGA	2	8	159780	159787	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
630	NC_017273	CCAG	2	8	159823	159830	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
631	NC_017273	CCA	2	6	159836	159841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_017273	TGC	2	6	159856	159861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_017273	ACC	2	6	159873	159878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_017273	AG	4	8	159882	159889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017273	GGT	2	6	159928	159933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017273	CCT	2	6	160025	160030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_017273	CGC	2	6	160067	160072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_017273	CTGGAG	2	12	160143	160154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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775	NC_017273	CCT	2	6	186118	186123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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