MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 1747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017268	GTG	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017268	TTC	2	6	1506	1511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017268	TAT	2	6	1582	1587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017268	TAA	2	6	1621	1626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017268	GGA	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017268	GCT	2	6	9830	9835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017268	AGT	2	6	10142	10147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017268	CAC	2	6	10160	10165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017268	GAT	2	6	12430	12435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017268	TAT	2	6	13848	13853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017268	GTG	2	6	13907	13912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017268	ACG	2	6	19390	19395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017268	GAA	2	6	19413	19418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017268	GAA	2	6	19553	19558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017268	ATT	2	6	19587	19592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017268	GTT	2	6	19607	19612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017268	GAT	2	6	19614	19619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017268	GCT	2	6	19634	19639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017268	ATG	2	6	19774	19779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017268	AGG	2	6	19936	19941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017268	TTG	2	6	19954	19959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017268	AGA	2	6	19999	20004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017268	ATG	2	6	20125	20130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017268	GAG	2	6	20202	20207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017268	TGC	2	6	20483	20488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017268	ATC	2	6	20526	20531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017268	CTT	2	6	20584	20589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017268	TGC	2	6	20660	20665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017268	AGA	2	6	20717	20722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017268	ACT	2	6	20836	20841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017268	TGG	2	6	20899	20904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017268	TGC	2	6	20923	20928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017268	TTC	2	6	21118	21123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017268	GGT	2	6	21164	21169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017268	GCG	2	6	21204	21209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017268	CGG	2	6	21333	21338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017268	ACT	2	6	21438	21443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017268	TAA	2	6	21460	21465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017268	ATT	2	6	21516	21521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017268	GAA	2	6	21729	21734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017268	TGT	2	6	21809	21814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017268	TAT	2	6	21923	21928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017268	AAC	2	6	21979	21984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017268	CTG	2	6	22036	22041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017268	TGC	2	6	22111	22116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017268	ATT	2	6	22283	22288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017268	GCA	2	6	22451	22456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017268	TTG	2	6	22473	22478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017268	ACA	2	6	22527	22532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017268	CTG	2	6	22655	22660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017268	GAT	2	6	22679	22684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017268	GCG	2	6	22773	22778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017268	GGA	2	6	22813	22818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017268	GTT	2	6	22835	22840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017268	GGA	2	6	22954	22959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017268	TTG	2	6	23120	23125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017268	AAC	2	6	23227	23232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017268	CAG	2	6	23331	23336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017268	TCT	2	6	23399	23404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017268	TCT	2	6	23502	23507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017268	GTG	2	6	23525	23530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017268	GGC	2	6	23955	23960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017268	ATC	2	6	23991	23996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017268	GAG	2	6	24029	24034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017268	GTG	2	6	24041	24046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017268	GGC	2	6	24331	24336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017268	CAA	2	6	24482	24487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017268	CAA	3	9	24578	24586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017268	ACC	2	6	24606	24611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017268	CCA	2	6	24941	24946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017268	AGC	2	6	25003	25008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017268	CAA	2	6	25239	25244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017268	TGA	2	6	25298	25303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017268	TGT	2	6	25325	25330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017268	GCT	2	6	25358	25363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017268	AGA	2	6	25423	25428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017268	TGA	2	6	28897	28902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017268	CTC	2	6	29027	29032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017268	AGG	2	6	29054	29059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017268	CTC	2	6	32947	32952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017268	TAT	2	6	38201	38206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017268	TGA	2	6	38216	38221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017268	CCT	2	6	41734	41739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017268	CCT	2	6	45573	45578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017268	ACA	2	6	45590	45595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017268	TCT	2	6	52579	52584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017268	AGA	2	6	54508	54513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017268	AGG	2	6	55587	55592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017268	ACG	2	6	55641	55646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017268	CAG	2	6	55660	55665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017268	CAC	2	6	55701	55706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017268	GTG	2	6	55749	55754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017268	GAT	2	6	57627	57632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017268	TGC	2	6	57649	57654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017268	ATA	2	6	57718	57723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017268	CAC	2	6	57759	57764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017268	GGC	2	6	57999	58004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017268	CAT	2	6	58109	58114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017268	CTG	2	6	58250	58255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017268	CTT	2	6	58256	58261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017268	CCG	2	6	58310	58315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017268	AGA	2	6	58387	58392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017268	GTA	2	6	58414	58419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017268	GCG	2	6	58483	58488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017268	GGA	2	6	58810	58815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017268	CAT	2	6	59491	59496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017268	TTG	2	6	59539	59544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017268	CCT	3	9	62811	62819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017268	GTA	2	6	62835	62840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017268	GCG	2	6	62868	62873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017268	GGA	2	6	67576	67581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017268	TCC	2	6	67618	67623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017268	CCT	2	6	68971	68976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017268	AGG	2	6	68992	68997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017268	GGT	2	6	69001	69006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017268	CCT	2	6	69665	69670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017268	AAC	2	6	69738	69743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017268	TCT	2	6	70707	70712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017268	ATA	2	6	70994	70999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017268	AGG	2	6	71049	71054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017268	TGC	2	6	71138	71143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017268	CGT	2	6	71155	71160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017268	TTG	2	6	71999	72004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017268	GTG	2	6	72182	72187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017268	TTC	2	6	73854	73859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017268	TCC	2	6	73967	73972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017268	TCG	2	6	73976	73981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017268	GGT	2	6	73984	73989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017268	CGA	2	6	74001	74006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017268	GTC	2	6	79063	79068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017268	GCA	2	6	84257	84262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017268	CTG	2	6	90700	90705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017268	TGC	2	6	90758	90763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017268	TGA	2	6	90774	90779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017268	ACC	2	6	90786	90791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017268	TTC	2	6	90800	90805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017268	AGT	2	6	90911	90916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017268	AAG	2	6	90980	90985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017268	GCA	2	6	90987	90992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017268	TCT	2	6	91140	91145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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