MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 3342

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017268	CGCGC	2	10	432372	432381	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1502	NC_017268	AGA	2	6	432396	432401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017268	GGC	2	6	432503	432508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_017268	TCC	2	6	432540	432545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_017268	G	6	6	432566	432571	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017268	GC	3	6	432573	432578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_017268	GAG	2	6	432604	432609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017268	GAA	2	6	432676	432681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017268	GC	3	6	432719	432724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_017268	GCA	2	6	432727	432732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_017268	TG	3	6	432748	432753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017268	GC	3	6	436204	436209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_017268	CG	4	8	436211	436218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_017268	AGA	2	6	436226	436231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017268	T	6	6	436253	436258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017268	GC	3	6	436273	436278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_017268	GT	3	6	436281	436286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017268	GC	3	6	436290	436295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_017268	GGT	2	6	438441	438446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017268	TTGA	2	8	438562	438569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017268	CCT	2	6	438586	438591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_017268	TC	4	8	438596	438603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_017268	T	6	6	438631	438636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017268	AAG	2	6	438748	438753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017268	GGA	2	6	438870	438875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017268	GGA	2	6	438894	438899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017268	GGT	2	6	438933	438938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017268	CAG	2	6	438940	438945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_017268	GC	3	6	438954	438959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_017268	TCC	2	6	439006	439011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_017268	GGA	2	6	439027	439032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017268	GTG	2	6	439093	439098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017268	GC	3	6	439113	439118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_017268	GTT	3	9	439197	439205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017268	T	7	7	439229	439235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017268	GGT	2	6	439256	439261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017268	ATG	2	6	439295	439300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017268	TCAT	2	8	439315	439322	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_017268	TGGTT	2	10	439327	439336	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017268	GGT	2	6	439401	439406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017268	GAC	2	6	439458	439463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_017268	GAC	2	6	439518	439523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_017268	GCT	2	6	439524	439529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_017268	TGT	2	6	439541	439546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017268	GAGG	2	8	439558	439565	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017268	TGG	2	6	439592	439597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017268	GCG	2	6	439607	439612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_017268	GCT	2	6	439680	439685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_017268	CG	3	6	439705	439710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_017268	TG	3	6	439713	439718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017268	AGGAA	2	10	439720	439729	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017268	GA	3	6	439732	439737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017268	AG	3	6	439742	439747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017268	CCTT	2	8	440083	440090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1555	NC_017268	GGA	2	6	441998	442003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017268	GAAG	2	8	442016	442023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017268	GGT	3	9	442033	442041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017268	AAG	2	6	443553	443558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017268	AAG	2	6	443597	443602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017268	GAT	2	6	443606	443611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017268	AGC	2	6	443628	443633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_017268	TG	3	6	443646	443651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017268	GAA	2	6	443714	443719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017268	AAGG	2	8	443735	443742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017268	CCG	2	6	443752	443757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_017268	GGC	2	6	443771	443776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_017268	TCT	2	6	443850	443855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_017268	GC	3	6	443856	443861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_017268	GGC	2	6	443903	443908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_017268	AGT	2	6	452977	452982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1572	NC_017268	GAG	2	6	453067	453072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017268	GAG	2	6	453141	453146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017268	GAG	2	6	453177	453182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017268	GAG	2	6	453210	453215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017268	GAG	2	6	453243	453248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1579	NC_017268	TAT	2	6	453307	453312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1581	NC_017268	TAT	2	6	453347	453352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017268	CT	3	6	453459	453464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_017268	CTG	2	6	453466	453471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_017268	TGC	2	6	453500	453505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1588	NC_017268	CTG	2	6	453676	453681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_017268	TCT	2	6	453733	453738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1594	NC_017268	TAGA	2	8	453879	453886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017268	GC	3	6	453931	453936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_017268	T	6	6	454054	454059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017268	ACG	2	6	454062	454067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_017268	CG	3	6	454066	454071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_017268	TAT	2	6	454211	454216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017268	GTG	2	6	457304	457309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017268	G	6	6	461161	461166	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017268	GAG	2	6	461752	461757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017268	CGC	2	6	461862	461867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_017268	TG	3	6	461875	461880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017268	CTG	2	6	461964	461969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_017268	TCT	2	6	462040	462045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_017268	GCT	2	6	462062	462067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_017268	GCA	2	6	462068	462073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_017268	CGTA	2	8	462112	462119	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_017268	GGAC	2	8	462157	462164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_017268	GC	3	6	462197	462202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_017268	CCG	2	6	462230	462235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_017268	GGA	2	6	462316	462321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1615	NC_017268	GGA	2	6	462376	462381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017268	GAGG	2	8	462416	462423	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017268	GGA	2	6	462436	462441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017268	GAGG	2	8	462476	462483	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017268	GGA	2	6	462496	462501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017268	AGGT	2	8	462510	462517	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017268	GAGG	2	8	462537	462544	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017268	GGA	2	6	462558	462563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_017268	GAGG	2	8	462597	462604	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017268	GGA	2	6	462617	462622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_017268	AGG	2	6	462659	462664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017268	GGA	2	6	462677	462682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017268	AGG	2	6	462719	462724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017268	AGC	2	6	462754	462759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_017268	GGA	2	6	462863	462868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017268	TAC	2	6	462936	462941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_017268	AAGGT	2	10	463039	463048	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017268	CGCGG	2	10	463089	463098	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1633	NC_017268	GAT	2	6	463153	463158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017268	CTC	2	6	463169	463174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_017268	GTG	2	6	463189	463194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_017268	GA	3	6	463810	463815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1914	NC_017268	GCG	2	6	526688	526693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_017268	A	6	6	577073	577078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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