MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016844	G	6	6	8819	8824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016844	T	6	6	9669	9674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016844	A	7	7	10331	10337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016844	A	6	6	10352	10357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016844	T	6	6	12435	12440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016844	G	9	9	12477	12485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016844	T	7	7	13931	13937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016844	G	6	6	24745	24750	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016844	A	6	6	24825	24830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016844	G	6	6	24872	24877	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016844	A	6	6	25010	25015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016844	G	6	6	29057	29062	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016844	T	9	9	38244	38252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016844	T	6	6	59480	59485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016844	G	7	7	72680	72686	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016844	T	6	6	73396	73401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016844	C	6	6	73840	73845	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_016844	T	6	6	78575	78580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016844	T	6	6	78596	78601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016844	C	9	9	94720	94728	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_016844	A	6	6	111762	111767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016844	T	6	6	113745	113750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016844	A	6	6	122148	122153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016844	A	6	6	122208	122213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016844	C	10	10	122228	122237	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_016844	T	6	6	132832	132837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016844	C	10	10	136736	136745	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_016844	C	9	9	140950	140958	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_016844	A	6	6	142974	142979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016844	C	9	9	154137	154145	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_016844	G	6	6	158398	158403	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016844	G	8	8	158471	158478	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016844	G	8	8	158567	158574	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016844	A	7	7	159298	159304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016844	A	6	6	169742	169747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016844	T	8	8	170165	170172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016844	T	6	6	170311	170316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016844	T	7	7	182534	182540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016844	T	6	6	191235	191240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016844	G	9	9	199732	199740	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016844	T	6	6	204509	204514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016844	G	8	8	208640	208647	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016844	A	6	6	219159	219164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016844	T	6	6	230262	230267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016844	A	6	6	233958	233963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016844	T	6	6	244346	244351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016844	T	8	8	246540	246547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016844	G	6	6	246784	246789	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016844	T	7	7	254671	254677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016844	A	6	6	282403	282408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016844	T	6	6	299153	299158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016844	T	6	6	304983	304988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016844	T	6	6	305870	305875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016844	T	6	6	323931	323936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016844	T	6	6	326773	326778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016844	T	7	7	326788	326794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016844	G	7	7	326811	326817	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016844	T	6	6	328056	328061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016844	C	9	9	333577	333585	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_016844	C	10	10	335886	335895	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_016844	G	6	6	336020	336025	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016844	T	6	6	341078	341083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016844	G	9	9	374000	374008	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016844	T	6	6	383815	383820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016844	T	6	6	395913	395918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016844	T	6	6	402043	402048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016844	A	7	7	406393	406399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016844	C	10	10	406429	406438	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_016844	C	12	12	409159	409170	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_016844	T	6	6	422971	422976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016844	T	6	6	422984	422989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016844	T	8	8	423013	423020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016844	T	6	6	448977	448982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016844	T	6	6	477952	477957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016844	T	6	6	480052	480057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016844	G	6	6	491384	491389	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016844	C	6	6	511509	511514	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_016844	G	6	6	542663	542668	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016844	A	6	6	547049	547054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016844	A	7	7	550841	550847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016844	T	6	6	562514	562519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016844	T	6	6	563240	563245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016844	T	6	6	563637	563642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016844	A	6	6	569285	569290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016844	A	6	6	577104	577109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016844	T	6	6	583531	583536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016844	A	7	7	600791	600797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016844	T	7	7	635700	635706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016844	T	6	6	642940	642945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016844	A	6	6	644515	644520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016844	T	8	8	644553	644560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016844	C	6	6	648849	648854	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_016844	C	6	6	661648	661653	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
94	NC_016844	T	6	6	662299	662304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016844	T	6	6	662801	662806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016844	C	8	8	674853	674860	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
97	NC_016844	C	10	10	677167	677176	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_016844	A	6	6	688797	688802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016844	T	9	9	699579	699587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016844	A	6	6	726160	726165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016844	A	6	6	736064	736069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016844	C	6	6	748733	748738	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_016844	C	6	6	768328	768333	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_016844	A	6	6	768341	768346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016844	C	6	6	769162	769167	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_016844	A	6	6	777230	777235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016844	T	6	6	795823	795828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016844	C	6	6	795848	795853	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_016844	A	7	7	823984	823990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016844	A	6	6	850324	850329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016844	A	7	7	853986	853992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016844	A	6	6	862612	862617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016844	A	8	8	865134	865141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016844	T	6	6	882430	882435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016844	T	8	8	882487	882494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016844	A	6	6	883298	883303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016844	T	6	6	884557	884562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016844	A	6	6	884584	884589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016844	A	6	6	902051	902056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016844	T	6	6	918639	918644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016844	A	6	6	922239	922244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016844	T	7	7	951324	951330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016844	T	7	7	954452	954458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016844	A	6	6	960680	960685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016844	C	6	6	1004643	1004648	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_016844	C	9	9	1007323	1007331	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_016844	T	7	7	1026024	1026030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016844	A	6	6	1026032	1026037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016844	A	7	7	1026062	1026068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016844	A	6	6	1039998	1040003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016844	T	6	6	1045218	1045223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016844	C	6	6	1051124	1051129	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_016844	A	7	7	1055953	1055959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016844	G	8	8	1072505	1072512	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016844	T	6	6	1082913	1082918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016844	T	6	6	1083620	1083625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016844	A	6	6	1084243	1084248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016844	A	6	6	1090491	1090496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016844	A	6	6	1122080	1122085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016844	C	6	6	1125916	1125921	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_016844	G	11	11	1126007	1126017	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016844	T	7	7	1126064	1126070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016844	T	6	6	1126116	1126121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016844	C	6	6	1128364	1128369	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
145	NC_016844	C	6	6	1129348	1129353	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
146	NC_016844	T	6	6	1133321	1133326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016844	A	6	6	1133392	1133397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016844	A	6	6	1137344	1137349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016844	T	7	7	1137397	1137403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016844	T	6	6	1137464	1137469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.