MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 311

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016843	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016843	GA	4	8	24348	24355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016843	CA	3	6	24386	24391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016843	TC	3	6	24427	24432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016843	GA	4	8	24492	24499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016843	TC	3	6	24572	24577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016843	AT	3	6	28938	28943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016843	CG	3	6	34001	34006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016843	GC	3	6	35441	35446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016843	GA	3	6	46727	46732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016843	CA	3	6	47032	47037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016843	CA	3	6	55780	55785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016843	GT	3	6	55792	55797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016843	TG	3	6	62904	62909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016843	GT	3	6	79030	79035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016843	GC	3	6	80789	80794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016843	AG	3	6	82363	82368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016843	CA	3	6	94407	94412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016843	TG	3	6	97414	97419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016843	CG	3	6	102776	102781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016843	GC	3	6	105844	105849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016843	CT	3	6	106666	106671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016843	GA	3	6	106677	106682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016843	TG	3	6	108182	108187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016843	TA	3	6	113751	113756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016843	GT	3	6	113771	113776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016843	CA	3	6	122241	122246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016843	GC	3	6	124676	124681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016843	TG	3	6	124742	124747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016843	TG	4	8	124938	124945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016843	GT	3	6	125164	125169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016843	TG	3	6	129807	129812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016843	GT	3	6	129871	129876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016843	AG	3	6	132780	132785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016843	GT	3	6	139635	139640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016843	CG	3	6	140967	140972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016843	CT	3	6	141012	141017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016843	GC	3	6	142946	142951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016843	CT	3	6	143043	143048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016843	CG	3	6	147593	147598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016843	CT	3	6	154269	154274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016843	CG	3	6	157585	157590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016843	GC	3	6	157637	157642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016843	GC	3	6	157692	157697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016843	CG	4	8	157706	157713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016843	GT	3	6	157898	157903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016843	TC	3	6	169154	169159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016843	GC	3	6	169435	169440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016843	TG	3	6	169984	169989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016843	GC	3	6	170047	170052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016843	GC	3	6	170304	170309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016843	CT	3	6	176947	176952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016843	CG	3	6	184360	184365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016843	GC	3	6	204198	204203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016843	GT	3	6	205652	205657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016843	GT	4	8	206019	206026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016843	TC	3	6	218980	218985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016843	GC	3	6	219767	219772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016843	TG	3	6	221766	221771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016843	TG	4	8	221923	221930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016843	TG	3	6	228543	228548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016843	TG	3	6	230176	230181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016843	TG	4	8	231052	231059	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016843	GC	3	6	231075	231080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016843	AC	3	6	231488	231493	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016843	CA	3	6	231984	231989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016843	AC	3	6	232402	232407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016843	AC	3	6	232571	232576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016843	TC	3	6	232810	232815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016843	AG	3	6	233255	233260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016843	CG	3	6	233327	233332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016843	AG	3	6	233395	233400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016843	AG	3	6	234331	234336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016843	GA	3	6	234744	234749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016843	AC	3	6	234776	234781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016843	AC	3	6	237695	237700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016843	GA	3	6	241386	241391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016843	GT	3	6	242076	242081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016843	GT	3	6	242144	242149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016843	TG	3	6	242905	242910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016843	TG	3	6	246442	246447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016843	TG	3	6	254516	254521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016843	GT	3	6	263947	263952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016843	GT	3	6	263999	264004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016843	GT	3	6	266590	266595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016843	GT	3	6	268177	268182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016843	GC	3	6	271810	271815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016843	CA	3	6	271863	271868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016843	GC	3	6	273322	273327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016843	TG	3	6	275227	275232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016843	TG	4	8	279456	279463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016843	GC	3	6	279479	279484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016843	AC	3	6	279892	279897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016843	CA	3	6	280388	280393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016843	AC	3	6	280806	280811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016843	AC	3	6	280975	280980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016843	TC	3	6	281214	281219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016843	AG	3	6	281649	281654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016843	CG	3	6	281721	281726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016843	AG	3	6	281789	281794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016843	AG	3	6	282725	282730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016843	GA	3	6	283138	283143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016843	AC	3	6	283170	283175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016843	GA	3	6	291231	291236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016843	GC	3	6	293427	293432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016843	TC	3	6	293467	293472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016843	GC	3	6	295189	295194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016843	GT	3	6	297877	297882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016843	GT	3	6	298008	298013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016843	AG	3	6	298903	298908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016843	TC	3	6	312044	312049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016843	GA	3	6	312138	312143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016843	CG	3	6	323739	323744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016843	TG	3	6	323796	323801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016843	GC	4	8	323820	323827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016843	GT	3	6	326617	326622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016843	GT	3	6	327811	327816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016843	GA	3	6	327844	327849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016843	CA	3	6	336383	336388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016843	GT	3	6	337722	337727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016843	CG	3	6	353545	353550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016843	GT	3	6	378583	378588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016843	TG	3	6	380627	380632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016843	TG	3	6	381218	381223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016843	GT	3	6	381231	381236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016843	CG	3	6	396026	396031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016843	AG	3	6	396378	396383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016843	CG	4	8	398032	398039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016843	CA	5	10	406876	406885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016843	GC	3	6	408784	408789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016843	GT	3	6	424369	424374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016843	GC	3	6	431562	431567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016843	TG	4	8	432513	432520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016843	TG	3	6	432523	432528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016843	AG	3	6	432542	432547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016843	GC	3	6	436628	436633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016843	CG	4	8	436635	436642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016843	CG	3	6	440129	440134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016843	CT	3	6	449420	449425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016843	GT	3	6	453434	453439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016843	TG	3	6	473251	473256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016843	CG	3	6	476330	476335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016843	CG	3	6	494066	494071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_016843	TC	3	6	509237	509242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016843	GC	4	8	511634	511641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016843	CG	3	6	525495	525500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016843	CG	3	6	525827	525832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016843	CT	3	6	532676	532681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016843	TA	3	6	532858	532863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016843	AT	3	6	532867	532872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016843	TC	3	6	541034	541039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_016843	GC	3	6	546982	546987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_016843	TG	3	6	547032	547037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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307	NC_016843	CG	4	8	1127350	1127357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
308	NC_016843	GC	3	6	1127359	1127364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
309	NC_016843	GA	3	6	1136139	1136144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
310	NC_016843	GT	3	6	1136188	1136193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
311	NC_016843	CG	3	6	1139362	1139367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.