MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016843	GTG	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016843	GAA	2	6	10248	10253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016843	GTG	2	6	10292	10297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016843	AGT	2	6	10326	10331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016843	TAT	2	6	13850	13855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016843	GTG	2	6	13909	13914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016843	GGC	2	6	24333	24338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016843	CAA	3	9	24580	24588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016843	ACC	2	6	24608	24613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_016843	CCA	2	6	24943	24948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016843	AGC	2	6	25005	25010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016843	AGA	2	6	25425	25430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016843	TGA	2	6	28899	28904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016843	CTC	2	6	29029	29034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016843	AGG	2	6	29056	29061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016843	CTC	2	6	32949	32954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_016843	TAT	2	6	38197	38202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016843	TGA	2	6	38212	38217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016843	CCT	2	6	45569	45574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_016843	ACA	2	6	45586	45591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016843	CTG	2	6	47020	47025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016843	CCT	2	6	47052	47057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_016843	TCT	2	6	52574	52579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016843	AGA	2	6	54503	54508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016843	GTG	2	6	55744	55749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016843	GGA	2	6	58805	58810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016843	CAT	2	6	59486	59491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016843	TTG	2	6	59534	59539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016843	CCT	3	9	62806	62814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016843	GTA	2	6	62830	62835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016843	GCG	2	6	62863	62868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016843	GGA	2	6	67571	67576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016843	TCC	2	6	67613	67618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_016843	CCT	2	6	69660	69665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016843	AAC	2	6	69733	69738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016843	TCT	2	6	70702	70707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016843	TTC	2	6	73840	73845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016843	AGT	2	6	78618	78623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016843	GTC	2	6	79049	79054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016843	TCT	3	9	82347	82355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016843	GCA	2	6	84243	84248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016843	TTG	2	6	94390	94395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016843	ACC	2	6	94707	94712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_016843	TCG	2	6	98683	98688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016843	CTT	2	6	99865	99870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016843	GTA	2	6	102757	102762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016843	AAT	2	6	102765	102770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016843	TTC	2	6	105850	105855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016843	CTG	2	6	106349	106354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016843	AGC	2	6	106700	106705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016843	CCG	2	6	108139	108144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016843	CGT	2	6	113763	113768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016843	GGA	2	6	113848	113853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016843	TGC	2	6	115753	115758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016843	GAG	2	6	122252	122257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016843	TCC	2	6	123664	123669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_016843	TCC	2	6	124655	124660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_016843	GCT	2	6	124777	124782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016843	TCC	2	6	124956	124961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_016843	AGA	2	6	125021	125026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016843	GAG	2	6	125074	125079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016843	CCT	2	6	129754	129759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_016843	CCT	2	6	132718	132723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_016843	TAC	2	6	132813	132818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016843	TAA	2	6	132839	132844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016843	CTC	2	6	136706	136711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_016843	AGA	2	6	136743	136748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016843	GCA	2	6	139663	139668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016843	GGA	2	6	140891	140896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016843	GGT	2	6	140905	140910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016843	CCG	2	6	140933	140938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_016843	CGC	2	6	142882	142887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016843	TGC	2	6	142904	142909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016843	GTT	2	6	143064	143069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016843	TGA	2	6	143082	143087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016843	TCG	2	6	148314	148319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016843	GTT	2	6	150586	150591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016843	GCT	2	6	150686	150691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016843	GTT	2	6	151776	151781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016843	GCT	2	6	152314	152319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016843	CTC	2	6	154150	154155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016843	CGG	2	6	154318	154323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016843	AGG	2	6	154328	154333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016843	CCG	2	6	157594	157599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016843	GAC	2	6	157842	157847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016843	CCT	2	6	157875	157880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_016843	CTG	2	6	159402	159407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016843	TGC	2	6	166924	166929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016843	TGG	2	6	168950	168955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016843	CGC	2	6	168974	168979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_016843	GCG	2	6	169016	169021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016843	CCA	2	6	169084	169089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_016843	CCG	2	6	169090	169095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016843	AGG	2	6	169176	169181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016843	GTT	2	6	169226	169231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016843	TGG	3	9	169265	169273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016843	ATT	2	6	169380	169385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016843	CAC	2	6	169445	169450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_016843	ATC	2	6	169479	169484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016843	GAT	2	6	169655	169660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016843	ATT	2	6	170021	170026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016843	ACC	2	6	170203	170208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_016843	TTC	2	6	170264	170269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016843	AAG	2	6	179339	179344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016843	TAT	2	6	182428	182433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016843	GCT	2	6	185520	185525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016843	CTT	2	6	185546	185551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016843	TTG	2	6	190059	190064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016843	TCG	2	6	190982	190987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016843	TTA	2	6	204167	204172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016843	TCA	2	6	204236	204241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016843	CCT	2	6	204379	204384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_016843	CCG	2	6	204408	204413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_016843	GAG	2	6	204435	204440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016843	GCG	2	6	205642	205647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016843	AGG	2	6	212292	212297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016843	GAG	2	6	216151	216156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016843	AGG	2	6	216666	216671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016843	GGT	2	6	218629	218634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016843	GGT	2	6	218875	218880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016843	GCG	2	6	218974	218979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016843	GAA	2	6	219031	219036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016843	AGC	2	6	223246	223251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016843	GTT	2	6	230210	230215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016843	AGG	2	6	230235	230240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016843	GTG	2	6	231004	231009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016843	AAT	2	6	231169	231174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016843	TTG	2	6	231426	231431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016843	GCA	2	6	231528	231533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016843	CGA	2	6	231620	231625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016843	TGA	2	6	231654	231659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016843	CAG	2	6	231697	231702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016843	GTT	2	6	231728	231733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016843	ATT	2	6	231738	231743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016843	CTG	2	6	231821	231826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016843	GAA	2	6	231889	231894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016843	GAT	2	6	231923	231928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016843	GAT	2	6	232138	232143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016843	TGC	2	6	232225	232230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016843	GTC	2	6	232237	232242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016843	GTG	2	6	232311	232316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016843	GGA	2	6	232351	232356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016843	TCA	2	6	232376	232381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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146	NC_016843	TAT	2	6	232919	232924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_016843	CGG	2	6	234975	234980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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174	NC_016843	GAG	2	6	235715	235720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_016843	GTG	2	6	238372	238377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_016843	CTT	2	6	623130	623135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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