MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 1494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016843	CG	3	6	749986	749991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_016843	AGG	2	6	750016	750021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_016843	GCT	2	6	751272	751277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_016843	TAGG	2	8	751306	751313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016843	CG	4	8	751337	751344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_016843	GAG	2	6	752855	752860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016843	AAG	2	6	754567	754572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016843	CAT	2	6	756692	756697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_016843	GGC	2	6	760487	760492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_016843	ACC	2	6	761770	761775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_016843	CA	3	6	761778	761783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_016843	GCT	2	6	761836	761841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_016843	CGG	2	6	761868	761873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_016843	ACA	2	6	761889	761894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_016843	TTC	2	6	761905	761910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_016843	CAC	2	6	763338	763343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_016843	CCA	2	6	763398	763403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_016843	TCT	2	6	763417	763422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_016843	GAC	2	6	763442	763447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_016843	ACC	2	6	763454	763459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_016843	TCC	2	6	764151	764156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_016843	CA	3	6	764165	764170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_016843	TGCA	2	8	764173	764180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_016843	AGG	2	6	764214	764219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016843	GC	4	8	766854	766861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_016843	ACGCGC	2	12	766866	766877	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_016843	GC	3	6	766880	766885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_016843	ACCCC	2	10	766888	766897	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1029	NC_016843	AGC	2	6	766898	766903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_016843	CA	3	6	768097	768102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_016843	C	6	6	768161	768166	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1032	NC_016843	A	6	6	768174	768179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_016843	CTGC	2	8	768191	768198	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_016843	AAC	2	6	768669	768674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_016843	AAAC	2	8	768682	768689	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_016843	CGCGC	2	10	768959	768968	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1037	NC_016843	C	6	6	768995	769000	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1038	NC_016843	TCC	2	6	772472	772477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_016843	GA	3	6	772478	772483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016843	ACC	2	6	772486	772491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_016843	CAC	2	6	772525	772530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_016843	AC	3	6	772529	772534	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_016843	AC	3	6	775349	775354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_016843	A	6	6	777063	777068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016843	CA	3	6	787635	787640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_016843	TCC	2	6	791839	791844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_016843	TAC	2	6	791850	791855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_016843	GCG	2	6	791857	791862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_016843	CCA	2	6	791873	791878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_016843	CA	3	6	793702	793707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_016843	TCC	2	6	795119	795124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_016843	TC	3	6	795146	795151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_016843	CTC	2	6	795650	795655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_016843	T	6	6	795656	795661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016843	C	6	6	795681	795686	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1056	NC_016843	GC	3	6	795706	795711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_016843	GA	3	6	798426	798431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016843	AC	3	6	798455	798460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_016843	CGCA	2	8	800087	800094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_016843	CGT	2	6	800158	800163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_016843	CGG	3	9	800827	800835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_016843	GC	4	8	800844	800851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_016843	CTCC	2	8	801563	801570	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1064	NC_016843	CG	3	6	801607	801612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_016843	GCA	2	6	801629	801634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_016843	GCT	2	6	804158	804163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_016843	TCA	2	6	804168	804173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_016843	TCG	2	6	807177	807182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_016843	AC	4	8	807196	807203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_016843	CT	3	6	809669	809674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_016843	CTT	2	6	809730	809735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_016843	AGG	2	6	809756	809761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016843	ACGCAG	2	12	810772	810783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_016843	ACGA	2	8	810830	810837	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_016843	TGA	2	6	814604	814609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_016843	TCTA	2	8	814664	814671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1078	NC_016843	TG	3	6	818430	818435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_016843	ACACGC	2	12	819607	819618	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_016843	GC	3	6	819617	819622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_016843	CT	3	6	821346	821351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_016843	AC	3	6	822044	822049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_016843	CAT	2	6	822060	822065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_016843	A	7	7	823817	823823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_016843	TTC	2	6	823874	823879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_016843	GCAC	2	8	823902	823909	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1087	NC_016843	GT	3	6	828048	828053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_016843	GCAGGG	2	12	828059	828070	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1089	NC_016843	CTA	2	6	828966	828971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_016843	GCGA	2	8	828977	828984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_016843	GC	3	6	832351	832356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_016843	GC	3	6	833304	833309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_016843	GGCG	2	8	833340	833347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_016843	GGC	2	6	835570	835575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_016843	CTC	2	6	835651	835656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_016843	GAG	2	6	835666	835671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_016843	GC	3	6	842357	842362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_016843	CGC	2	6	843710	843715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_016843	GCT	2	6	843738	843743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_016843	CCA	2	6	843774	843779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_016843	TGG	2	6	843802	843807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016843	CA	3	6	846172	846177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_016843	AC	3	6	846476	846481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_016843	GTT	2	6	848073	848078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016843	A	6	6	850157	850162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_016843	CG	3	6	853757	853762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_016843	CAGAGA	2	12	853804	853815	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1108	NC_016843	A	7	7	853819	853825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016843	GAAT	2	8	853835	853842	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016843	ACC	2	6	855060	855065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_016843	GC	3	6	855073	855078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_016843	TCT	2	6	859502	859507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_016843	CGC	2	6	859560	859565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_016843	CA	4	8	859607	859614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_016843	TTC	2	6	860726	860731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_016843	GC	3	6	860756	860761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_016843	TCT	2	6	860769	860774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_016843	A	6	6	862445	862450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016843	CTC	2	6	863658	863663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_016843	ACTGT	2	10	864949	864958	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1121	NC_016843	CAG	2	6	864959	864964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_016843	A	8	8	864967	864974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016843	GTGCAC	2	12	870085	870096	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_016843	ACA	2	6	874168	874173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_016843	AGT	2	6	874197	874202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016843	GT	3	6	874201	874206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016843	CTC	2	6	875423	875428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_016843	AAG	2	6	879039	879044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_016843	CA	3	6	879045	879050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_016843	GAA	2	6	879073	879078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016843	TG	3	6	879097	879102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016843	AGG	2	6	879392	879397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016843	TGC	2	6	880409	880414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_016843	ATCGC	2	10	881367	881376	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1135	NC_016843	GCG	2	6	881382	881387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_016843	AC	3	6	881464	881469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_016843	GTA	2	6	881482	881487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_016843	TGC	2	6	881665	881670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1140	NC_016843	GCT	2	6	881959	881964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1143	NC_016843	GTG	2	6	882139	882144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1255	NC_016843	N	28	28	976218	976245	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_016843	CCG	2	6	976255	976260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1257	NC_016843	N	6	6	976372	976377	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_016843	GTAC	2	8	976389	976396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1259	NC_016843	AAG	2	6	976430	976435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1263	NC_016843	TCC	2	6	976557	976562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1264	NC_016843	CAA	2	6	976590	976595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1268	NC_016843	N	14	14	976720	976733	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_016843	GCT	2	6	976747	976752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1271	NC_016843	N	30	30	976878	976907	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_016843	TTC	2	6	977116	977121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1273	NC_016843	CCA	2	6	977200	977205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1274	NC_016843	CTT	2	6	977283	977288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1410	NC_016843	GCA	2	6	1084226	1084231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_016843	AC	3	6	1084265	1084270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1412	NC_016843	CA	3	6	1084280	1084285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1413	NC_016843	CATGC	2	10	1084326	1084335	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1414	NC_016843	AAC	2	6	1084389	1084394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1415	NC_016843	TG	3	6	1086238	1086243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1431	NC_016843	AAAG	2	8	1099731	1099738	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_016843	TCCG	2	8	1102318	1102325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1433	NC_016843	CG	3	6	1102413	1102418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1439	NC_016843	TCC	2	6	1104121	1104126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1442	NC_016843	TTC	2	6	1105868	1105873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_016843	CG	3	6	1105899	1105904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1444	NC_016843	GAG	2	6	1105950	1105955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_016843	AAC	2	6	1109660	1109665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1446	NC_016843	CA	3	6	1109683	1109688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1447	NC_016843	GCA	2	6	1109706	1109711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_016843	GCG	2	6	1116755	1116760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1452	NC_016843	TC	3	6	1116762	1116767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1453	NC_016843	GCCCG	2	10	1116779	1116788	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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