MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 1494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016843	CAA	2	6	281998	282003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_016843	GGT	2	6	282022	282027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016843	GCA	2	6	282067	282072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_016843	GTG	2	6	282126	282131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016843	CGT	2	6	282139	282144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_016843	GGA	2	6	282203	282208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016843	A	6	6	282226	282231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016843	AAAC	2	8	282266	282273	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_016843	TGCG	2	8	282424	282431	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
510	NC_016843	AGG	2	6	282529	282534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016843	AGC	2	6	282545	282550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_016843	TGA	2	6	282685	282690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016843	GAG	2	6	282703	282708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016843	AG	3	6	282725	282730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016843	AGG	2	6	282754	282759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_016843	TTCC	2	8	282766	282773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_016843	CGT	2	6	282985	282990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_016843	GTGCGA	2	12	283001	283012	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
519	NC_016843	AGGTT	2	10	283070	283079	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016843	AGGT	2	8	283107	283114	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016843	GA	3	6	283138	283143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016843	AC	3	6	283170	283175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_016843	GGT	2	6	283287	283292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016843	AGAGG	2	10	283319	283328	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016843	TTGAA	2	10	283348	283357	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016843	CGG	2	6	283369	283374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_016843	AAG	2	6	283498	283503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016843	GTA	2	6	283580	283585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016843	ACC	2	6	283641	283646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_016843	CCT	2	6	283729	283734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_016843	AGG	2	6	283805	283810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016843	GAG	2	6	284109	284114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016843	TAA	2	6	284350	284355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016843	ATT	2	6	284374	284379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016843	TCCTTC	2	12	284382	284393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_016843	TGG	2	6	284433	284438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016843	GAT	2	6	284491	284496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016843	GTAG	2	8	284516	284523	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016843	TTC	2	6	285609	285614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_016843	TAAA	3	12	290317	290328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016843	GA	3	6	291231	291236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016843	AAC	2	6	291240	291245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_016843	GC	3	6	293427	293432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
544	NC_016843	ACA	2	6	293446	293451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_016843	TC	3	6	293467	293472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_016843	AGT	2	6	293498	293503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016843	GCG	2	6	293504	293509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_016843	GCAC	2	8	293514	293521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
549	NC_016843	GACC	2	8	293550	293557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
550	NC_016843	ACA	2	6	295050	295055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_016843	GAG	2	6	295059	295064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016843	GAT	2	6	295094	295099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016843	TTTCC	2	10	295141	295150	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
554	NC_016843	GGA	2	6	295163	295168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016843	GC	3	6	295189	295194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
556	NC_016843	GAG	2	6	295211	295216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016843	CTT	2	6	295257	295262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_016843	GT	3	6	297877	297882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016843	TGG	2	6	297933	297938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016843	CTC	3	9	297939	297947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_016843	GTT	2	6	297949	297954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016843	AGGT	2	8	297988	297995	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016843	GT	3	6	298008	298013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016843	GCT	2	6	298068	298073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_016843	GAG	2	6	298119	298124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016843	GTGCG	2	10	298870	298879	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
567	NC_016843	AG	3	6	298903	298908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016843	GAG	2	6	298933	298938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016843	TGC	2	6	298967	298972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_016843	T	6	6	298976	298981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016843	CGC	2	6	298990	298995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_016843	AAC	2	6	299005	299010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_016843	TGA	2	6	299527	299532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016843	GTT	2	6	304802	304807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016843	T	6	6	304806	304811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016843	T	6	6	305693	305698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_016843	TC	3	6	312044	312049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
578	NC_016843	GTG	2	6	312053	312058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016843	GAG	2	6	312081	312086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016843	GA	3	6	312138	312143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016843	CG	3	6	323739	323744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_016843	T	6	6	323751	323756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016843	TG	3	6	323796	323801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016843	GC	4	8	323820	323827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
585	NC_016843	GGGA	2	8	323872	323879	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016843	T	6	6	326593	326598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_016843	T	7	7	326608	326614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016843	GT	3	6	326617	326622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016843	G	7	7	326631	326637	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
590	NC_016843	GT	3	6	327811	327816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016843	GA	3	6	327844	327849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016843	T	6	6	327876	327881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016843	AGAA	2	8	327885	327892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016843	CAG	2	6	327896	327901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_016843	CTA	2	6	331307	331312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_016843	CGC	2	6	331315	331320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_016843	TCC	2	6	331345	331350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_016843	CTC	2	6	334007	334012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_016843	C	10	10	334027	334036	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
600	NC_016843	C	11	11	336337	336347	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
601	NC_016843	TAG	2	6	336357	336362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016843	CCT	2	6	336376	336381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_016843	CA	3	6	336383	336388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_016843	CAC	2	6	336399	336404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_016843	CCT	2	6	336413	336418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_016843	G	6	6	336472	336477	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016843	GT	3	6	337722	337727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016843	CCCG	2	8	337733	337740	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
609	NC_016843	GAGG	2	8	337777	337784	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016843	GAA	2	6	341456	341461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016843	T	6	6	341530	341535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016843	CCA	2	6	348525	348530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_016843	CCT	2	6	349088	349093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_016843	CAC	2	6	353532	353537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_016843	CG	3	6	353545	353550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
616	NC_016843	TCT	2	6	353594	353599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_016843	GGA	2	6	355489	355494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016843	GAT	2	6	355500	355505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016843	ACA	2	6	355557	355562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_016843	CCG	2	6	355564	355569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_016843	GCA	2	6	355587	355592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_016843	GGT	2	6	355598	355603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016843	AATATA	2	12	355620	355631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016843	GGA	2	6	355651	355656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016843	CCT	2	6	357133	357138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_016843	TGCG	2	8	357140	357147	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
627	NC_016843	CTT	2	6	357354	357359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016843	GCT	2	6	357441	357446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_016843	TGG	3	9	366620	366628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016843	TGG	2	6	366644	366649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_016843	ATGG	2	8	366678	366685	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016843	GTA	2	6	371673	371678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016843	TTTCCG	2	12	372883	372894	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_016843	ATG	2	6	372897	372902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016843	G	9	9	374437	374445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016843	GCG	2	6	378509	378514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_016843	GTCT	2	8	378563	378570	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
638	NC_016843	GGT	2	6	378579	378584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_016843	GT	3	6	378583	378588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
640	NC_016843	TG	3	6	380627	380632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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647	NC_016843	GT	3	6	381231	381236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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