MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016842	GTG	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016842	GAA	2	6	10248	10253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016842	GTG	2	6	10292	10297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016842	AGT	2	6	10326	10331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016842	TAT	2	6	13850	13855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016842	GTG	2	6	13909	13914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016842	GGC	2	6	24333	24338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016842	CAA	3	9	24580	24588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016842	ACC	2	6	24608	24613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_016842	CCA	2	6	24943	24948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016842	AGC	2	6	25005	25010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016842	AGA	2	6	25425	25430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016842	TGA	2	6	28899	28904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016842	CTC	2	6	29029	29034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016842	AGG	2	6	29056	29061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016842	CTC	2	6	32949	32954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_016842	TAT	2	6	38197	38202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016842	TGA	2	6	38212	38217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016842	CCT	2	6	45569	45574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_016842	ACA	2	6	45586	45591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016842	TCT	2	6	52575	52580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016842	AGA	2	6	54504	54509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016842	GTG	2	6	55745	55750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016842	GGA	2	6	58806	58811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016842	CAT	2	6	59487	59492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016842	TTG	2	6	59535	59540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016842	CCT	3	9	62807	62815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_016842	GTA	2	6	62831	62836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016842	GCG	2	6	62864	62869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016842	GGA	2	6	67572	67577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016842	TCC	2	6	67614	67619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016842	CCT	2	6	69661	69666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016842	AAC	2	6	69734	69739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016842	TCT	2	6	70703	70708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016842	TTC	2	6	73538	73543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016842	AGT	2	6	78316	78321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016842	GTC	2	6	78747	78752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016842	TCT	3	9	82045	82053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016842	GCA	2	6	83941	83946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016842	TTG	2	6	94088	94093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016842	ACC	2	6	94405	94410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_016842	TCG	2	6	98381	98386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016842	CTT	2	6	99563	99568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016842	GTA	2	6	102455	102460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016842	AAT	2	6	102463	102468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016842	TTC	2	6	105548	105553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016842	CTG	2	6	106047	106052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016842	AGC	2	6	106398	106403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016842	CCG	2	6	107837	107842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_016842	CGT	2	6	113461	113466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016842	GGA	2	6	113546	113551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016842	TGC	2	6	115451	115456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016842	GAG	2	6	121950	121955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016842	TCC	2	6	123362	123367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_016842	TCC	2	6	124353	124358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_016842	GCT	2	6	124475	124480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016842	TCC	2	6	124654	124659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_016842	AGA	2	6	124719	124724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016842	GAG	2	6	124772	124777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016842	CCT	2	6	129452	129457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016842	CCT	2	6	132416	132421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_016842	TAC	2	6	132511	132516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016842	TAA	2	6	132537	132542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016842	CTC	2	6	136404	136409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_016842	AGA	2	6	136442	136447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016842	GCA	2	6	139362	139367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016842	GGA	2	6	140590	140595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016842	GGT	2	6	140604	140609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016842	CCG	2	6	140632	140637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_016842	CGC	2	6	142581	142586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_016842	TGC	2	6	142603	142608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016842	GTT	2	6	142763	142768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016842	TGA	2	6	142781	142786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016842	GTT	2	6	150286	150291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016842	GCT	2	6	150386	150391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016842	GTT	2	6	151476	151481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016842	GCT	2	6	152014	152019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016842	CTC	2	6	153844	153849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_016842	CGG	2	6	154013	154018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016842	AGG	2	6	154023	154028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016842	CCG	2	6	157289	157294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016842	GAC	2	6	157537	157542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016842	CCT	2	6	157570	157575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_016842	CTG	2	6	159097	159102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016842	TGC	2	6	166619	166624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016842	TGG	2	6	168645	168650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016842	CGC	2	6	168669	168674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_016842	GCG	2	6	168711	168716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016842	CCA	2	6	168779	168784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_016842	CCG	2	6	168785	168790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_016842	AGG	2	6	168871	168876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016842	GTT	2	6	168921	168926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016842	TGG	3	9	168960	168968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016842	ATT	2	6	169075	169080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016842	CAC	2	6	169140	169145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_016842	ATC	2	6	169174	169179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016842	GAT	2	6	169350	169355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016842	ATT	2	6	169716	169721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016842	ACC	2	6	169898	169903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_016842	TTC	2	6	169959	169964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016842	AAG	2	6	179034	179039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016842	TAT	2	6	182123	182128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016842	GCT	2	6	185215	185220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016842	CTT	2	6	185241	185246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016842	TTG	2	6	189754	189759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016842	TCG	2	6	190677	190682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016842	TTA	2	6	203862	203867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016842	TCA	2	6	203931	203936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016842	CCT	2	6	204074	204079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_016842	CCG	2	6	204103	204108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_016842	GAG	2	6	204130	204135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016842	GCG	2	6	205337	205342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016842	AGG	2	6	211986	211991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016842	GAG	2	6	215845	215850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016842	AGG	2	6	216360	216365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016842	GGT	2	6	218323	218328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016842	GGT	2	6	218569	218574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016842	GCG	2	6	218668	218673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016842	GAA	2	6	218725	218730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016842	AGC	2	6	222940	222945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016842	GTT	2	6	229904	229909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016842	AGG	2	6	229929	229934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016842	GTG	2	6	230698	230703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016842	AAT	2	6	230863	230868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016842	TTG	2	6	231120	231125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016842	GCA	2	6	231222	231227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016842	CGA	2	6	231314	231319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016842	TGA	2	6	231348	231353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016842	CAG	2	6	231391	231396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016842	GTT	2	6	231422	231427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016842	ATT	2	6	231432	231437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016842	CTG	2	6	231515	231520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016842	GAA	2	6	231583	231588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016842	GAT	2	6	231617	231622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016842	GAT	2	6	231832	231837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016842	TGC	2	6	231919	231924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016842	GTC	2	6	231931	231936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016842	GTG	2	6	232005	232010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016842	GGA	2	6	232045	232050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016842	TCA	2	6	232070	232075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016842	AGG	2	6	232356	232361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016842	CCT	2	6	232408	232413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_016842	TAT	2	6	232603	232608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_016842	ATA	2	6	232704	232709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_016842	AGT	2	6	232953	232958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_016842	CGG	2	6	233139	233144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_016842	CAA	2	6	233288	233293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_016842	GCA	2	6	233357	233362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_016842	CGT	2	6	233429	233434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_016842	AGG	2	6	233819	233824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_016842	AGG	2	6	234044	234049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_016842	CGT	2	6	234275	234280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_016842	GGT	2	6	234577	234582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016842	CGG	2	6	234659	234664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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168	NC_016842	ACC	2	6	234931	234936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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171	NC_016842	GAG	2	6	235399	235404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
172	NC_016842	TAA	2	6	235640	235645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_016842	ATT	2	6	235664	235669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_016842	TGG	2	6	235723	235728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_016842	AGG	2	6	238032	238037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
179	NC_016842	GTG	2	6	238056	238061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_016842	GTA	2	6	241032	241037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_016842	GAG	2	6	254640	254645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
192	NC_016842	GTG	2	6	260541	260546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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