MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Tannerella forsythia ATCC 43037 chromosome

Total Repeats: 496

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016610	CCCCT	2	10	8381	8390	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_016610	TGTTA	2	10	12238	12247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016610	GGACA	2	10	17687	17696	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016610	TGAAA	2	10	18603	18612	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016610	CCTTA	2	10	69264	69273	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016610	TATTT	2	10	77008	77017	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016610	TGATT	2	10	80169	80178	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016610	GTATC	2	10	80607	80616	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016610	ACATG	2	10	81010	81019	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016610	CATCT	2	10	84659	84668	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_016610	TTTAT	2	10	85624	85633	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016610	AAATA	2	10	85786	85795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016610	AAAAG	2	10	87589	87598	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016610	TCAAA	2	10	93783	93792	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016610	TTGAA	2	10	93953	93962	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016610	TGCAA	2	10	94428	94437	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016610	AGTGT	2	10	95476	95485	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016610	TATGC	2	10	102896	102905	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016610	GATGA	2	10	106056	106065	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016610	TGAAA	2	10	106327	106336	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016610	TGTTT	2	10	112454	112463	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016610	AGATG	2	10	113129	113138	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016610	TATGC	2	10	119298	119307	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016610	AAATA	2	10	124946	124955	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016610	GATAT	2	10	125104	125113	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016610	AGTAA	2	10	125287	125296	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016610	TAATC	2	10	127218	127227	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016610	TTATT	2	10	135162	135171	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016610	GTATT	2	10	144478	144487	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016610	AAAGA	2	10	159570	159579	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016610	CGGCC	2	10	160537	160546	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_016610	ATTTT	2	10	165604	165613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016610	GAAAA	2	10	167600	167609	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016610	TCTGC	2	10	171340	171349	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_016610	TCGCT	2	10	171382	171391	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016610	AGCGA	2	10	171453	171462	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_016610	TCTGC	2	10	174310	174319	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_016610	ATTTT	2	10	183935	183944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016610	CGAAG	2	10	191363	191372	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016610	TCGCT	2	10	191485	191494	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016610	AGCGA	2	10	191587	191596	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016610	GCATC	2	10	191708	191717	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016610	CGAAG	2	10	191946	191955	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016610	TCGCT	2	10	192068	192077	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_016610	AGCGA	2	10	192171	192180	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016610	GCATC	2	10	192295	192304	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_016610	TCTTT	2	10	226884	226893	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016610	ATGAA	2	10	230948	230957	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016610	AGAAA	2	10	232121	232130	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016610	TTCGC	2	10	232272	232281	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_016610	CAGTC	2	10	237989	237998	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_016610	AATAA	2	10	261075	261084	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016610	GAAAA	2	10	261328	261337	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016610	TTCTT	2	10	276113	276122	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016610	CAAAG	2	10	278985	278994	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016610	GATGC	2	10	280352	280361	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_016610	CATTT	2	10	288278	288287	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016610	GAAAA	2	10	288350	288359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016610	TATTT	2	10	294301	294310	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016610	AAGAC	2	10	299908	299917	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016610	CGAAC	2	10	302479	302488	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_016610	CTTTT	2	10	343650	343659	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016610	GAACC	2	10	347943	347952	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016610	CAAAA	2	10	348010	348019	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016610	ACAAA	2	10	353413	353422	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016610	TCAAA	2	10	372228	372237	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016610	TTGAA	2	10	372398	372407	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016610	CATCT	2	10	373599	373608	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_016610	CTTGG	2	10	380602	380611	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016610	TCCTT	2	10	384292	384301	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_016610	TAAGA	2	10	384422	384431	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016610	AAGAG	2	10	384992	385001	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016610	TTCTT	2	10	393103	393112	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016610	AACAA	2	10	400386	400395	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016610	TCTCT	2	10	416770	416779	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_016610	ACTTT	2	10	437795	437804	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_016610	ACGGT	2	10	439693	439702	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016610	TTGTT	2	10	455769	455778	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016610	TATTT	2	10	480549	480558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016610	ATTAT	2	10	485610	485619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016610	ATAGA	2	10	485849	485858	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016610	TTTTA	2	10	500627	500636	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016610	AGCGA	2	10	501622	501631	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016610	GAAGC	2	10	501668	501677	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_016610	GAAGC	2	10	501923	501932	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016610	ATGTT	2	10	535384	535393	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016610	CCCAT	2	10	549191	549200	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
88	NC_016610	ATTTA	2	10	549456	549465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016610	TTTTG	2	10	562153	562162	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016610	AGGGT	2	10	565361	565370	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016610	AGCGA	2	10	569034	569043	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016610	TGTCC	2	10	575223	575232	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_016610	TTCGC	2	10	609451	609460	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_016610	TCTTT	2	10	609588	609597	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016610	AGCGA	2	10	609759	609768	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016610	TCTTT	2	10	609773	609782	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016610	TCTTT	2	10	611995	612004	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016610	AGCGA	2	10	625467	625476	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016610	TATTT	2	10	628489	628498	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016610	TATTT	2	10	631003	631012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016610	AGCGA	2	10	631488	631497	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016610	TTTCA	2	10	632474	632483	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016610	AGAGA	2	10	664780	664789	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016610	TTTTC	2	10	681924	681933	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016610	ACAAA	2	10	685912	685921	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016610	TTCAA	2	10	687026	687035	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_016610	TCCGA	2	10	689881	689890	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_016610	CAGGA	2	10	696269	696278	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016610	CGAAG	2	10	697870	697879	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016610	GGTTG	2	10	698760	698769	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016610	GAGAT	2	10	729358	729367	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016610	TCTTT	2	10	738996	739005	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_016610	TTTTC	2	10	741030	741039	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_016610	ATTTC	2	10	744235	744244	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016610	GAAGA	2	10	751876	751885	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016610	AGCAA	2	10	752540	752549	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_016610	TAAAA	2	10	752832	752841	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016610	AGTTC	2	10	784179	784188	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_016610	GATAT	2	10	805287	805296	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016610	CGCTT	2	10	822404	822413	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_016610	TTGTT	2	10	829665	829674	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016610	CAAAG	2	10	832007	832016	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016610	TTTGA	2	10	833445	833454	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016610	TTCGT	2	10	869860	869869	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_016610	TTTCT	2	10	891892	891901	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016610	CTTAT	2	10	896248	896257	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016610	ATCTT	2	10	899559	899568	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016610	GGGTT	2	10	911499	911508	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016610	AGCGA	2	10	914380	914389	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016610	TAATT	2	10	914441	914450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016610	AGCGA	2	10	914794	914803	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016610	AAGCG	2	10	915167	915176	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016610	AGCGA	2	10	915421	915430	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016610	AGCGA	2	10	915463	915472	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016610	CGAAG	2	10	919328	919337	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016610	AGCGA	2	10	919951	919960	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016610	TGCGG	2	10	920954	920963	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_016610	AAAAG	2	10	944796	944805	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016610	ACAGG	2	10	952992	953001	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016610	GAAAA	2	10	953105	953114	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016610	AATAA	2	10	953166	953175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016610	AAAGA	2	10	956486	956495	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016610	TCATA	2	10	956569	956578	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016610	ATATT	2	10	959406	959415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016610	TGATT	2	10	959581	959590	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016610	TTTAT	2	10	963509	963518	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016610	TACCG	2	10	967367	967376	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_016610	AAAAG	2	10	967583	967592	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016610	CATAT	2	10	969128	969137	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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152	NC_016610	GCCTG	2	10	983342	983351	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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158	NC_016610	CATAT	2	10	1036077	1036086	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_016610	ATTTT	2	10	1056986	1056995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_016610	AGAGG	2	10	1057837	1057846	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_016610	TTTTC	2	10	1239125	1239134	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_016610	GATTT	2	10	1240856	1240865	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_016610	CATAA	2	10	1794366	1794375	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
266	NC_016610	GTTTT	2	10	1815679	1815688	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_016610	TGTTT	2	10	1818437	1818446	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
268	NC_016610	TGATC	2	10	1819533	1819542	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
269	NC_016610	CGATA	2	10	1819755	1819764	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
270	NC_016610	TTGCA	2	10	1819898	1819907	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
271	NC_016610	TGAAG	2	10	1825606	1825615	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
272	NC_016610	ATGGG	2	10	1826419	1826428	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
273	NC_016610	ACAAA	2	10	1827364	1827373	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
274	NC_016610	ATAAG	2	10	1833750	1833759	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_016610	TCGCT	2	10	1850306	1850315	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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281	NC_016610	TTTTA	2	10	1914600	1914609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_016610	CGCTT	2	10	1929358	1929367	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
283	NC_016610	CCAAG	2	10	1930220	1930229	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
284	NC_016610	GTTCG	2	10	1935179	1935188	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_016610	CTTTT	2	10	1961636	1961645	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_016610	ATTTG	2	10	1961725	1961734	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
288	NC_016610	AGTGA	2	10	1967335	1967344	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_016610	AGCGA	2	10	2134398	2134407	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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361	NC_016610	CGATA	2	10	2406038	2406047	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
362	NC_016610	TTTTA	2	10	2417530	2417539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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404	NC_016610	GTATC	2	10	2702261	2702270	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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422	NC_016610	CTTTT	2	10	2767978	2767987	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
423	NC_016610	TTTTA	2	10	2785251	2785260	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_016610	TACGT	2	10	3219791	3219800	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
472	NC_016610	TATTT	2	10	3223026	3223035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_016610	ACAAA	2	10	3358071	3358080	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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494	NC_016610	TCCGA	2	10	3362039	3362048	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
495	NC_016610	CGATA	2	10	3371196	3371205	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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