MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 377

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016051	AG	3	6	318	323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016051	CT	3	6	2621	2626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016051	GA	4	8	4620	4627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016051	GT	3	6	9649	9654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016051	TC	3	6	10037	10042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016051	TA	3	6	16266	16271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016051	AC	3	6	36274	36279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016051	TA	3	6	36301	36306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016051	AT	3	6	47676	47681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016051	TC	3	6	66639	66644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016051	AG	3	6	77296	77301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016051	CT	3	6	87543	87548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016051	AC	3	6	87645	87650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016051	TC	3	6	103953	103958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016051	GT	3	6	144030	144035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016051	TA	4	8	144180	144187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016051	CT	3	6	156344	156349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016051	CT	3	6	159474	159479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016051	GA	3	6	162157	162162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016051	CT	3	6	174231	174236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016051	TC	3	6	179287	179292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016051	AT	3	6	179896	179901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016051	AG	3	6	181311	181316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016051	CT	3	6	185346	185351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016051	TA	4	8	207486	207493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016051	CA	3	6	216533	216538	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016051	TA	3	6	241254	241259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016051	AT	3	6	269683	269688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016051	TA	3	6	287570	287575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016051	TA	3	6	290050	290055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016051	TA	3	6	306489	306494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016051	TG	4	8	318600	318607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016051	GT	5	10	318722	318731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016051	AG	3	6	327174	327179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016051	TG	3	6	338129	338134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016051	AT	3	6	356727	356732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016051	GA	3	6	360580	360585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016051	GT	3	6	377804	377809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016051	AC	3	6	383473	383478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016051	AT	3	6	401487	401492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016051	TA	3	6	401607	401612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016051	GA	3	6	418070	418075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016051	GC	3	6	421575	421580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016051	TC	3	6	422356	422361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016051	TG	3	6	422418	422423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016051	AT	3	6	422536	422541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016051	CT	3	6	430155	430160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016051	TA	3	6	430167	430172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016051	AG	3	6	440361	440366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016051	TC	3	6	449436	449441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016051	GA	3	6	452194	452199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016051	GC	3	6	452501	452506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016051	TA	3	6	458774	458779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016051	CT	3	6	464669	464674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016051	AT	3	6	464771	464776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016051	TA	3	6	464797	464802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016051	TC	3	6	465871	465876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016051	AG	3	6	481099	481104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016051	CA	3	6	481222	481227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016051	GA	3	6	481646	481651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016051	CT	3	6	482410	482415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016051	AT	3	6	482563	482568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016051	AG	3	6	483127	483132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016051	CT	3	6	483176	483181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016051	CG	3	6	483316	483321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016051	AG	3	6	483890	483895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016051	AT	3	6	490343	490348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016051	TA	3	6	508726	508731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016051	GT	3	6	524051	524056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016051	AT	3	6	543707	543712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016051	AG	3	6	546221	546226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016051	CT	3	6	546654	546659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016051	TA	3	6	548001	548006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016051	AT	3	6	553530	553535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016051	GA	3	6	556041	556046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016051	CT	3	6	569630	569635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016051	GA	3	6	576528	576533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016051	TA	3	6	591031	591036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016051	AC	3	6	594698	594703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016051	AG	3	6	596156	596161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016051	TC	3	6	597015	597020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016051	CA	3	6	607580	607585	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016051	TC	3	6	640093	640098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016051	TC	3	6	648999	649004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016051	TA	3	6	655643	655648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016051	TC	4	8	674631	674638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016051	CT	3	6	681454	681459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016051	TC	3	6	687576	687581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016051	GA	3	6	696460	696465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016051	TC	3	6	697417	697422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016051	GA	3	6	699210	699215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016051	GA	3	6	704344	704349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016051	AG	3	6	706729	706734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016051	TA	3	6	727933	727938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016051	TA	3	6	736129	736134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016051	TG	3	6	736138	736143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016051	TC	3	6	746042	746047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016051	GA	3	6	769452	769457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016051	CA	3	6	778421	778426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016051	AT	3	6	782375	782380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016051	CG	3	6	787797	787802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016051	AG	3	6	788033	788038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016051	GT	3	6	792566	792571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016051	CA	3	6	792653	792658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016051	TA	3	6	794466	794471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016051	TG	3	6	802042	802047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016051	TA	5	10	802153	802162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016051	TA	3	6	815195	815200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016051	TA	3	6	825084	825089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016051	CT	3	6	845815	845820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016051	GA	3	6	846660	846665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016051	AT	3	6	848325	848330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016051	TC	3	6	848379	848384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016051	AT	3	6	848576	848581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016051	GT	3	6	849335	849340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016051	TA	3	6	849343	849348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016051	AC	3	6	849559	849564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016051	AG	3	6	849577	849582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016051	AG	3	6	849607	849612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016051	GA	3	6	851120	851125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016051	TA	3	6	858835	858840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016051	CT	3	6	859194	859199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016051	AT	3	6	863949	863954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016051	TA	3	6	863996	864001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016051	TA	4	8	868868	868875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016051	CT	3	6	885853	885858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016051	AC	3	6	885875	885880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016051	GA	3	6	885954	885959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016051	AT	4	8	903192	903199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016051	CA	3	6	903256	903261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016051	TA	3	6	903833	903838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016051	TC	3	6	913188	913193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016051	GA	3	6	928785	928790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016051	AT	3	6	934788	934793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016051	AT	5	10	934894	934903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016051	AC	3	6	941377	941382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016051	TA	3	6	941551	941556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016051	GA	3	6	946167	946172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016051	AT	3	6	957656	957661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016051	AG	3	6	962407	962412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016051	AT	3	6	974091	974096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016051	GA	3	6	985246	985251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016051	TA	3	6	987753	987758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016051	GC	3	6	1001776	1001781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016051	GC	3	6	1002170	1002175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016051	GT	3	6	1014703	1014708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016051	AG	3	6	1015016	1015021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016051	CT	3	6	1015042	1015047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016051	TC	3	6	1066075	1066080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_016051	TA	3	6	1067751	1067756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016051	CT	3	6	1082212	1082217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_016051	TA	3	6	1082806	1082811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016051	TG	3	6	1092323	1092328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.