MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter wiegelii Rt8.B1 chromosome

Total Repeats: 1492

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015958	AACT	2	8	31	38	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015958	GAGC	2	8	6859	6866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015958	TTTG	2	8	29496	29503	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015958	CTTA	2	8	30273	30280	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015958	CTCC	2	8	36276	36283	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_015958	ATAG	2	8	36404	36411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015958	TCTA	2	8	36469	36476	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015958	AAGT	2	8	36564	36571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015958	GCCT	2	8	48505	48512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015958	TCCA	2	8	48737	48744	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015958	TGAG	2	8	48840	48847	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015958	CAAG	2	8	49132	49139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015958	AGGA	2	8	49152	49159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015958	ATGA	2	8	51206	51213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015958	TGCG	2	8	51253	51260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015958	GAAG	2	8	51359	51366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015958	GATG	2	8	51421	51428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015958	AAGG	2	8	51639	51646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015958	GTAC	2	8	53110	53117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015958	AAGG	3	12	53676	53687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015958	TTGT	2	8	53983	53990	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015958	GCTC	2	8	54661	54668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015958	TCAA	2	8	55042	55049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015958	GCAT	2	8	56823	56830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015958	TAAG	2	8	57655	57662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015958	GGAA	2	8	57717	57724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015958	CTTA	2	8	57877	57884	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015958	AAAT	2	8	57906	57913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015958	AAAT	2	8	63469	63476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015958	GGGA	2	8	66243	66250	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015958	GTGA	2	8	66452	66459	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015958	GAGC	2	8	67044	67051	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015958	AGAA	2	8	67934	67941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015958	AGTG	2	8	68029	68036	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015958	GGCC	2	8	68064	68071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015958	AGGA	2	8	68676	68683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015958	AGTG	2	8	70100	70107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015958	AATT	2	8	71015	71022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015958	AACA	2	8	72706	72713	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015958	AATT	2	8	73915	73922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015958	ATTA	2	8	80738	80745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015958	AAAC	2	8	81948	81955	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015958	ATTT	2	8	85259	85266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015958	ACTG	2	8	86848	86855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015958	GTAT	2	8	89151	89158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015958	GGGA	2	8	98476	98483	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015958	GTGA	2	8	98685	98692	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015958	GAGC	2	8	99277	99284	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015958	AGAA	2	8	100104	100111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015958	AGTG	2	8	100199	100206	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015958	GGCC	2	8	100234	100241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015958	AGGA	2	8	100846	100853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015958	AGTG	2	8	102271	102278	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015958	TGTT	2	8	104085	104092	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015958	GTGC	2	8	108559	108566	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015958	GAAG	2	8	108666	108673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015958	GATG	2	8	108728	108735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015958	AAGG	2	8	108946	108953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015958	GTAC	2	8	109163	109170	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015958	CAGG	2	8	110861	110868	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015958	TCCT	2	8	119787	119794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015958	TCCT	2	8	127213	127220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015958	ATTT	2	8	127247	127254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015958	AATA	2	8	127634	127641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015958	TTAC	2	8	130745	130752	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015958	AATT	2	8	141580	141587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015958	AGTT	2	8	141616	141623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015958	AAGT	2	8	152320	152327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015958	ATTT	2	8	152381	152388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015958	ATTA	2	8	152400	152407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015958	AAAG	2	8	152419	152426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015958	TAAA	2	8	153895	153902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015958	ATAC	2	8	159601	159608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015958	TTCC	2	8	166259	166266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015958	AAGG	2	8	168728	168735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015958	TGAA	2	8	172719	172726	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015958	GAAG	2	8	172872	172879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015958	GATG	2	8	172934	172941	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015958	AAGG	2	8	173152	173159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015958	GTAC	2	8	173369	173376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015958	ATAA	2	8	175407	175414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015958	TACT	2	8	185026	185033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015958	GAGC	2	8	185151	185158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_015958	CTTT	2	8	185745	185752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015958	TATC	2	8	186354	186361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015958	ATGT	2	8	186599	186606	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015958	TAGA	2	8	186909	186916	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015958	TTTA	2	8	186943	186950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015958	TTAT	2	8	196829	196836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015958	TAAA	2	8	196903	196910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015958	GGGA	2	8	197169	197176	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015958	AAAG	2	8	201288	201295	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015958	GTTA	2	8	201461	201468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015958	TTGA	2	8	202051	202058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015958	AGGA	2	8	202883	202890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015958	GTAA	2	8	202957	202964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015958	TTGC	2	8	203514	203521	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015958	CAGT	2	8	203570	203577	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015958	ATTT	2	8	203930	203937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015958	AGAT	2	8	204300	204307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015958	AAAG	2	8	206455	206462	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015958	AGCA	2	8	206658	206665	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015958	AGTG	2	8	208527	208534	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015958	GTAA	2	8	213327	213334	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015958	TAGA	2	8	214762	214769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015958	TAAA	2	8	215305	215312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015958	TAAT	2	8	216044	216051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015958	ATTA	2	8	217326	217333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015958	ATTA	2	8	221867	221874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015958	TTGA	2	8	222424	222431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015958	TATT	2	8	229839	229846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015958	TTTA	2	8	233887	233894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015958	AGCA	2	8	237730	237737	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015958	AAGG	2	8	237944	237951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015958	AATA	2	8	239608	239615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015958	ATTA	2	8	241076	241083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015958	ATTA	2	8	243963	243970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015958	TTTG	2	8	247940	247947	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015958	AATT	2	8	247952	247959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015958	AATG	2	8	248002	248009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015958	ATAA	2	8	248561	248568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015958	AATT	2	8	261329	261336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015958	ATCC	2	8	271842	271849	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015958	CCCA	2	8	271920	271927	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_015958	TTTA	2	8	271978	271985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015958	GAAA	2	8	273269	273276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015958	CCTT	2	8	274783	274790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015958	TAAT	2	8	291172	291179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015958	ATGG	2	8	295044	295051	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015958	TTAA	2	8	302574	302581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015958	GAGT	2	8	302590	302597	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015958	AATT	2	8	304853	304860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015958	AAAT	2	8	304865	304872	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015958	AATA	2	8	306189	306196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015958	AATT	2	8	311644	311651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015958	AAGA	2	8	321438	321445	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015958	GAAA	2	8	333389	333396	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015958	AATT	2	8	333627	333634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015958	ATAA	2	8	334001	334008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015958	TAAA	2	8	336444	336451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015958	GAAG	2	8	338333	338340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015958	GATG	2	8	338395	338402	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015958	AAGG	2	8	338613	338620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015958	GTAC	2	8	338830	338837	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015958	TAAA	2	8	341775	341782	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015958	ATTT	2	8	342723	342730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015958	TGCT	2	8	343042	343049	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015958	ACAA	2	8	347705	347712	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015958	ACAA	2	8	351201	351208	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015958	ACTT	2	8	351636	351643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015958	AGTC	2	8	353895	353902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_015958	TAAT	3	12	353945	353956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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