MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 883

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015714	GTG	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015714	TTC	2	6	1507	1512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015714	TAT	2	6	1583	1588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015714	TAA	2	6	1622	1627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015714	GGA	2	6	1628	1633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015714	TAA	2	6	10178	10183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015714	GAT	2	6	12476	12481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015714	TAT	2	6	13893	13898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015714	GTG	2	6	13952	13957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015714	GGC	2	6	24413	24418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015714	AAC	2	6	24664	24669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015714	ACC	2	6	24688	24693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015714	CCA	2	6	25023	25028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015714	AGC	2	6	25085	25090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015714	TGA	2	6	28981	28986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015714	CTC	2	6	29111	29116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015714	AGG	2	6	29138	29143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015714	CTC	2	6	33031	33036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015714	TAT	2	6	38280	38285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015714	TGA	2	6	38295	38300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015714	GTG	2	6	40111	40116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015714	GGT	2	6	40162	40167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015714	CCT	2	6	45658	45663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015714	ACA	2	6	45675	45680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015714	TCT	2	6	52664	52669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015714	AGA	2	6	54593	54598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015714	AGG	2	6	55672	55677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015714	ACG	2	6	55726	55731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015714	CAG	2	6	55745	55750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015714	CAC	2	6	55786	55791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015714	GTG	2	6	55834	55839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015714	GGA	2	6	58895	58900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015714	CAT	2	6	59576	59581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015714	TTG	2	6	59624	59629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015714	CCT	3	9	62899	62907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015714	GTA	2	6	62923	62928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015714	GCG	2	6	62956	62961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015714	GGA	2	6	67664	67669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015714	TCC	2	6	67706	67711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015714	CCT	2	6	69059	69064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_015714	AGG	2	6	69080	69085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015714	GGT	2	6	69089	69094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015714	CCT	2	6	69753	69758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015714	AAC	2	6	69826	69831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015714	TCT	2	6	70795	70800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015714	AGG	2	6	71137	71142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015714	TTC	2	6	73942	73947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015714	TCC	2	6	74055	74060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015714	TCG	2	6	74064	74069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015714	GAG	2	6	74070	74075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015714	CGA	2	6	74089	74094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015714	AGT	2	6	78720	78725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015714	GTC	2	6	79151	79156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015714	GCA	2	6	84344	84349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015714	GCG	2	6	84357	84362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015714	TCG	2	6	98781	98786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015714	CTT	2	6	99963	99968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015714	GTA	2	6	102855	102860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015714	AAT	2	6	102863	102868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015714	CTG	2	6	106447	106452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015714	AGC	2	6	106798	106803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015714	GCG	2	6	112094	112099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015714	TTC	2	6	112138	112143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015714	TCG	2	6	112200	112205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015714	GTG	2	6	112259	112264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015714	GTG	2	6	112337	112342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015714	GTG	2	6	112416	112421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015714	CCT	2	6	112505	112510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015714	TGA	2	6	112573	112578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015714	GGT	2	6	112597	112602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015714	CAT	2	6	112657	112662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015714	TGA	2	6	112738	112743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015714	GTG	2	6	112829	112834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015714	TCG	2	6	113032	113037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015714	CCA	2	6	113059	113064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015714	GAA	2	6	113123	113128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015714	ACT	2	6	113180	113185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015714	AGG	2	6	113270	113275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015714	GTT	2	6	113414	113419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015714	ATC	2	6	113562	113567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015714	GCA	2	6	113574	113579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015714	AAG	2	6	113744	113749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015714	CGT	2	6	113861	113866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015714	GGA	2	6	113946	113951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015714	GAA	2	6	115689	115694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015714	CGT	2	6	122128	122133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015714	GAG	2	6	122197	122202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015714	TCC	2	6	123609	123614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015714	TCC	2	6	124901	124906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_015714	AGA	2	6	124966	124971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015714	GAG	2	6	125019	125024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015714	CCT	2	6	129699	129704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015714	TAC	2	6	132759	132764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015714	TAA	2	6	132785	132790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015714	TTG	2	6	135064	135069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015714	CAC	2	6	135132	135137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015714	TGA	2	6	135160	135165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015714	GGA	2	6	135407	135412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015714	TTC	2	6	135519	135524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015714	TGC	2	6	135525	135530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015714	ACC	2	6	135584	135589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015714	ACA	2	6	135690	135695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015714	CAG	2	6	135713	135718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015714	TGA	2	6	135736	135741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015714	CCT	2	6	135864	135869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015714	AGC	2	6	135969	135974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015714	GTG	2	6	136035	136040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015714	AGA	2	6	136338	136343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015714	CGG	2	6	136408	136413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015714	TTC	2	6	136507	136512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015714	GCA	2	6	136585	136590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015714	CTC	2	6	136647	136652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_015714	AGA	2	6	136684	136689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015714	GCA	2	6	139604	139609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015714	GGA	2	6	140834	140839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015714	GGT	2	6	140848	140853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015714	CCG	2	6	140876	140881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_015714	CGC	2	6	142824	142829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015714	TGC	2	6	142846	142851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015714	GTT	2	6	143006	143011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015714	TGA	2	6	143024	143029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015714	GTG	2	6	148431	148436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015714	GTT	2	6	150245	150250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015714	TTG	2	6	151018	151023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015714	CAC	2	6	151086	151091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015714	TGA	2	6	151114	151119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015714	GGA	2	6	151361	151366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015714	TTC	2	6	151473	151478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015714	TGC	2	6	151479	151484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015714	ACC	2	6	151538	151543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015714	ACA	2	6	151644	151649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015714	CAG	2	6	151667	151672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015714	TGA	2	6	151690	151695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015714	CCT	2	6	151818	151823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_015714	AGC	2	6	151923	151928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015714	GTG	2	6	151989	151994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015714	AGA	2	6	152292	152297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015714	CGG	2	6	152362	152367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015714	TTC	2	6	152461	152466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_015714	CCG	2	6	155021	155026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_015714	GCC	2	6	155039	155044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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164	NC_015714	ACC	2	6	167698	167703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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168	NC_015714	GGA	2	6	176841	176846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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