MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 1772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015714	A	6	6	537998	538003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015714	CGG	2	6	538098	538103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_015714	TGT	2	6	538141	538146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015714	AGG	2	6	538210	538215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015714	CGA	2	6	538227	538232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_015714	G	6	6	538273	538278	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015714	GGA	2	6	538287	538292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015714	TTGC	2	8	538404	538411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_015714	GTG	2	6	538432	538437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015714	CTC	2	6	538496	538501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_015714	TGC	2	6	538601	538606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_015714	TTC	2	6	538647	538652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_015714	TGGTG	2	10	541836	541845	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015714	ACTTT	2	10	541868	541877	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_015714	GTTT	2	8	541883	541890	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015714	GCGT	2	8	542512	542519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_015714	TGC	2	6	542550	542555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_015714	TG	3	6	542562	542567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015714	A	6	6	542659	542664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015714	GTA	2	6	544498	544503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015714	GTG	2	6	544553	544558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015714	T	6	6	544595	544600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015714	GC	3	6	546435	546440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_015714	A	7	7	546450	546456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015714	CTA	2	6	546464	546469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_015714	A	6	6	564901	564906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015714	AG	3	6	564965	564970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1029	NC_015714	AGC	2	6	567713	567718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_015714	AC	3	6	568401	568406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_015714	TGA	2	6	572670	572675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015714	A	6	6	576546	576551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015714	CAC	2	6	576576	576581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_015714	TAC	2	6	576593	576598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_015714	CCT	2	6	577356	577361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_015714	CAC	2	6	577381	577386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_015714	CCG	2	6	577394	577399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_015714	CCCAA	2	10	577465	577474	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1039	NC_015714	CAC	2	6	577490	577495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_015714	CTC	2	6	578762	578767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_015714	A	7	7	578828	578834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015714	TCGG	2	8	578850	578857	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_015714	CCTG	2	8	578878	578885	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_015714	TTG	2	6	578929	578934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015714	CGG	2	6	578962	578967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015714	CG	3	6	579037	579042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1049	NC_015714	TG	3	6	583162	583167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015714	CTC	2	6	585071	585076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_015714	TCAC	2	8	588979	588986	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_015714	GC	3	6	589013	589018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1054	NC_015714	TGG	2	6	589060	589065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015714	TTC	3	9	589070	589078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015714	AGGG	2	8	590568	590575	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015714	AG	3	6	596227	596232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015714	CGAA	2	8	596259	596266	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_015714	A	7	7	596357	596363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015714	AACC	2	8	596384	596391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_015714	ACG	2	6	598378	598383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1063	NC_015714	AACC	2	8	599687	599694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_015714	CAA	2	6	599794	599799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_015714	ATT	2	6	600862	600867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015714	GTG	2	6	600883	600888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015714	CAG	2	6	600908	600913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1072	NC_015714	AG	3	6	605942	605947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015714	GTGCT	2	10	605972	605981	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1075	NC_015714	CT	3	6	613881	613886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1088	NC_015714	TACA	2	8	639585	639592	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_015714	CTG	2	6	639601	639606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1091	NC_015714	GCC	2	6	639657	639662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_015714	GTC	2	6	639689	639694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1094	NC_015714	ACC	2	6	639781	639786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_015714	CA	3	6	639804	639809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_015714	CGCAC	2	10	639820	639829	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1097	NC_015714	GC	3	6	639921	639926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_015714	GCG	2	6	639956	639961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_015714	GCC	2	6	640050	640055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_015714	A	6	6	640056	640061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015714	CCG	2	6	640076	640081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_015714	TC	3	6	643696	643701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_015714	ATG	2	6	644332	644337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015714	CAAC	2	8	644342	644349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_015714	A	6	6	644369	644374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015714	ACG	2	6	644386	644391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_015714	C	9	9	644394	644402	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1108	NC_015714	ACAT	2	8	644403	644410	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_015714	AAAC	2	8	645053	645060	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_015714	TCC	2	6	646200	646205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_015714	ACC	2	6	646250	646255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_015714	AG	3	6	653666	653671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015714	CCT	2	6	654620	654625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_015714	AC	3	6	654671	654676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_015714	TCC	2	6	655586	655591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_015714	AG	3	6	655594	655599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015714	TC	3	6	655618	655623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_015714	CAC	2	6	655627	655632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_015714	CG	3	6	655640	655645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_015714	CA	3	6	655682	655687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_015714	GCA	2	6	655758	655763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_015714	CAGGG	2	10	655769	655778	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1123	NC_015714	CCGC	2	8	655923	655930	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1124	NC_015714	CAG	2	6	655938	655943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_015714	TCC	2	6	656682	656687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_015714	GCACG	2	10	656731	656740	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1127	NC_015714	CG	3	6	656739	656744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_015714	CAC	2	6	656768	656773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_015714	AC	3	6	656811	656816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_015714	CG	3	6	656883	656888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_015714	AGA	2	6	656963	656968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015714	CTC	2	6	656983	656988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_015714	AG	3	6	656993	656998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015714	ACG	2	6	657018	657023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_015714	GCG	2	6	657057	657062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_015714	GCT	2	6	657105	657110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_015714	ACAT	2	8	660900	660907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1404	NC_015714	TCT	2	6	853850	853855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1409	NC_015714	CA	5	10	856868	856877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1415	NC_015714	ACTGT	2	10	858032	858041	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1418	NC_015714	ACA	2	6	861551	861556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1424	NC_015714	ACA	2	6	867253	867258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1425	NC_015714	AGT	2	6	867282	867287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1453	NC_015714	CTT	2	6	880414	880419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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