MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermotoga thermarum DSM 5069 chromosome

Total Repeats: 2394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015707	TAT	2	6	1	6	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015707	GGT	2	6	8312	8317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015707	CCT	2	6	11439	11444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015707	AGG	2	6	12303	12308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015707	AGG	2	6	14117	14122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015707	AGG	2	6	14618	14623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015707	CTT	2	6	16870	16875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015707	TAA	2	6	17813	17818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015707	TCA	2	6	17907	17912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015707	ATC	2	6	22028	22033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015707	GTT	2	6	22099	22104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015707	TAG	3	9	22105	22113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015707	AGA	2	6	22183	22188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015707	AGG	2	6	22238	22243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015707	TTA	2	6	24422	24427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015707	AGG	2	6	26396	26401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015707	ATC	2	6	26405	26410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015707	GTA	2	6	32531	32536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015707	ATT	2	6	37461	37466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015707	AGT	2	6	41855	41860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015707	AGA	2	6	41946	41951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015707	GAA	2	6	41983	41988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015707	GAT	2	6	42206	42211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015707	GTT	2	6	42330	42335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015707	TGA	2	6	42358	42363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015707	ACG	2	6	42421	42426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015707	CAG	2	6	42737	42742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015707	TGA	2	6	42745	42750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015707	AAC	2	6	42766	42771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015707	CTT	2	6	42801	42806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015707	GAT	2	6	42890	42895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015707	CGA	2	6	42896	42901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015707	GAA	2	6	42948	42953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015707	TTG	2	6	55127	55132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015707	ATT	2	6	55171	55176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015707	CTC	2	6	59890	59895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015707	ACC	2	6	60184	60189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_015707	AAC	2	6	62399	62404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015707	TAT	2	6	62621	62626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015707	AGG	2	6	62640	62645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015707	AGG	2	6	66492	66497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015707	ATT	2	6	69755	69760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015707	ACC	2	6	71246	71251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015707	TTA	2	6	72575	72580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015707	ATC	2	6	72626	72631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015707	GGA	2	6	72644	72649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015707	TGT	2	6	72700	72705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015707	GAA	2	6	72809	72814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015707	ATT	2	6	72917	72922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015707	CCT	2	6	84262	84267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015707	TAT	2	6	84597	84602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015707	AGG	2	6	84626	84631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015707	AGG	2	6	86011	86016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015707	GCT	2	6	86017	86022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015707	CTT	2	6	87823	87828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015707	AGG	2	6	87842	87847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015707	TGT	2	6	98380	98385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015707	ATT	2	6	98387	98392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015707	TAA	2	6	98397	98402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015707	GGA	2	6	98468	98473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015707	GTT	2	6	98522	98527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015707	CCT	2	6	103322	103327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015707	GAA	2	6	103590	103595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015707	TTC	2	6	103798	103803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015707	AAG	3	9	103851	103859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015707	CGA	2	6	103938	103943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015707	TGT	2	6	103950	103955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015707	TTC	2	6	104035	104040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015707	AAG	2	6	105490	105495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015707	AGG	2	6	105621	105626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015707	TTC	2	6	105910	105915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015707	GCA	2	6	105967	105972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015707	TTC	2	6	106003	106008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015707	GTT	2	6	106077	106082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015707	AGC	3	9	106146	106154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015707	TCG	2	6	106169	106174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015707	TGA	2	6	106394	106399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015707	AGG	2	6	107320	107325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015707	CCT	2	6	112409	112414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015707	GAA	2	6	112454	112459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015707	GTC	2	6	112512	112517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015707	CCG	2	6	112544	112549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015707	TCC	2	6	112563	112568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015707	AGG	2	6	112652	112657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015707	CTT	2	6	117829	117834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015707	TAA	2	6	117880	117885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015707	AAG	2	6	117888	117893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015707	GAC	2	6	117921	117926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015707	TGT	2	6	123418	123423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015707	ATT	2	6	123489	123494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015707	AGT	2	6	123820	123825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015707	CTT	2	6	124323	124328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015707	TAA	2	6	124422	124427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015707	AGG	2	6	124467	124472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015707	AGG	2	6	125701	125706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015707	TGT	2	6	129960	129965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015707	AAT	2	6	139489	139494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015707	AAT	2	6	139576	139581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015707	CCT	2	6	142341	142346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015707	CCT	2	6	143768	143773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_015707	TGA	2	6	143796	143801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015707	ATC	2	6	143803	143808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015707	TGA	2	6	143820	143825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015707	AGG	2	6	143870	143875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015707	AGG	2	6	144763	144768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015707	GTC	2	6	145759	145764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015707	AAT	2	6	145784	145789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015707	TAA	2	6	146002	146007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015707	AGG	2	6	159810	159815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015707	CCT	2	6	161392	161397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015707	AAT	2	6	161406	161411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015707	ACC	2	6	161415	161420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_015707	CAA	2	6	161540	161545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015707	GAA	2	6	161551	161556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015707	GGA	2	6	161638	161643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015707	ACA	2	6	161682	161687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015707	AGG	3	9	161733	161741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015707	GAA	2	6	161782	161787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015707	GGA	2	6	161791	161796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015707	TAT	2	6	161861	161866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015707	TCC	2	6	161936	161941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015707	CAA	2	6	161959	161964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015707	ATG	2	6	161994	161999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015707	GTC	2	6	162002	162007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015707	AAT	2	6	162067	162072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015707	CAA	2	6	162224	162229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015707	ATC	2	6	162306	162311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015707	TTC	2	6	162338	162343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015707	AGA	2	6	162375	162380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015707	TTC	2	6	162433	162438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015707	CAA	2	6	162680	162685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015707	TGT	2	6	162721	162726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015707	TTC	2	6	162733	162738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015707	ACC	2	6	162792	162797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_015707	ATC	2	6	162858	162863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015707	TCG	2	6	162870	162875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015707	CGC	2	6	162895	162900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_015707	AAG	2	6	162918	162923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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