MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermodesulfobacterium sp. OPB45 chromosome

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015682	CCTATT	2	12	49155	49166	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015682	AATTAA	2	12	67969	67980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015682	TTATTT	2	12	68292	68303	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015682	AAATAG	2	12	143106	143117	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015682	TTTCTA	2	12	143559	143570	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015682	ATTTTT	2	12	163668	163679	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015682	ATTTTT	2	12	173304	173315	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015682	TATTTT	2	12	212301	212312	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015682	TAAAAA	2	12	232153	232164	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015682	GCTTCG	2	12	233519	233530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015682	ATTAAA	2	12	243601	243612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015682	AATTAA	2	12	259701	259712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015682	TTAAAA	2	12	289425	289436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015682	ATTAAG	2	12	289447	289458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015682	TTTGTT	2	12	303874	303885	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015682	GAATAA	2	12	315826	315837	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015682	TTTAAC	2	12	326643	326654	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015682	GTAAAG	2	12	335063	335074	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015682	TTTTAA	2	12	375639	375650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015682	CCCCTA	2	12	383155	383166	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015682	CTTTTT	2	12	384415	384426	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015682	ATTTAA	2	12	405019	405030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015682	TTTAAA	2	12	469075	469086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015682	TTTAAT	2	12	471950	471961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015682	TTAAAA	2	12	473130	473141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015682	TTTAAA	2	12	496599	496610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015682	AAAATT	2	12	527313	527324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015682	AATAAA	2	12	527329	527340	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015682	AAAATT	2	12	541934	541945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015682	TTTAAA	2	12	553036	553047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015682	AAGTTA	2	12	579506	579517	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015682	AATTAA	2	12	636215	636226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015682	TTAAAA	2	12	643359	643370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015682	TAAAAA	2	12	742736	742747	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015682	ATTTAT	2	12	771930	771941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015682	ATCTGT	2	12	807801	807812	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015682	GTTAAC	2	12	811795	811806	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015682	TAAAAT	2	12	811810	811821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015682	CTATAA	2	12	833706	833717	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015682	TATTTG	2	12	843301	843312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015682	TATAAT	2	12	843383	843394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015682	CAAAAT	2	12	894647	894658	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015682	ATACTT	2	12	946858	946869	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015682	ATTTAA	2	12	947240	947251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015682	AAGAAA	2	12	953894	953905	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015682	TTTAAA	2	12	997076	997087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015682	TAAAAA	2	12	997172	997183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015682	TGGAAA	2	12	1019713	1019724	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015682	TAAAAA	2	12	1029534	1029545	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015682	TTTAAA	2	12	1043955	1043966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015682	GAAGTT	2	12	1043973	1043984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015682	ATTATA	2	12	1076522	1076533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015682	TTTTAG	2	12	1078508	1078519	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015682	ATATTT	2	12	1080301	1080312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015682	GAAGAG	2	12	1090941	1090952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015682	AAATTT	2	12	1101279	1101290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015682	GAAAAA	2	12	1119875	1119886	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015682	CTAAAG	2	12	1157104	1157115	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015682	TCAAAA	2	12	1174897	1174908	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015682	AATTAA	2	12	1191323	1191334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015682	TATTTT	2	12	1199451	1199462	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015682	TTAAAA	2	12	1203163	1203174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015682	GAAAAA	2	12	1211401	1211412	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015682	AAAAGT	2	12	1221754	1221765	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015682	TTTTGT	2	12	1224110	1224121	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015682	ACATCT	2	12	1224802	1224813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015682	AGTTTT	2	12	1226851	1226862	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015682	ATTTTA	2	12	1227932	1227943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015682	ATAAAT	2	12	1229138	1229149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015682	TTAAAA	2	12	1252045	1252056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015682	ATTTAA	2	12	1274999	1275010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015682	ATTTTT	2	12	1278486	1278497	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015682	ATTATA	2	12	1374078	1374089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015682	TAAAAA	2	12	1391280	1391291	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015682	ACCTCC	2	12	1393270	1393281	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015682	TAATTA	2	12	1395808	1395819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015682	TTTTTA	2	12	1404790	1404801	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015682	TTTATT	2	12	1406138	1406149	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015682	ATTTAA	2	12	1413817	1413828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015682	ATTATC	2	12	1418424	1418435	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015682	AGTTTT	2	12	1439336	1439347	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015682	CTTTTT	2	12	1443009	1443020	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015682	TTAAAA	2	12	1477820	1477831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015682	TATTTT	2	12	1478213	1478224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015682	TATAAA	2	12	1478316	1478327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015682	ATTAAA	2	12	1484316	1484327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015682	TTTAAA	2	12	1496149	1496160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015682	CAGGCA	2	12	1525125	1525136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015682	AAAAAG	2	12	1577268	1577279	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015682	ATAAAG	2	12	1577319	1577330	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015682	TAAAAT	2	12	1595156	1595167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015682	TAATTA	2	12	1602565	1602576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015682	AAAATT	2	12	1630702	1630713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015682	AAATTT	2	12	1634322	1634333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.