MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Treponema primitia ZAS-2 chromosome

Total Repeats: 8889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015578	TCA	2	6	1793616	1793621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_015578	CTT	2	6	1793627	1793632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_015578	AAT	2	6	1793657	1793662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_015578	GGA	2	6	1793755	1793760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_015578	ACA	2	6	1793799	1793804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_015578	CGG	2	6	1793821	1793826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_015578	GGCCTG	2	12	1793831	1793842	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_015578	ATG	2	6	1793867	1793872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_015578	A	7	7	1793956	1793962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_015578	A	6	6	1793971	1793976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_015578	TGG	3	9	1794009	1794017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_015578	TGC	2	6	1794082	1794087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_015578	AGG	2	6	1794099	1794104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_015578	T	6	6	1794143	1794148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_015578	GATC	2	8	1794178	1794185	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4016	NC_015578	TTCCC	2	10	1794314	1794323	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4017	NC_015578	TGG	3	9	1794324	1794332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_015578	GAC	2	6	1794392	1794397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_015578	TGG	2	6	1794429	1794434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_015578	GGT	2	6	1794523	1794528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_015578	ATC	2	6	1794563	1794568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_015578	GATG	2	8	1794592	1794599	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_015578	GAA	2	6	1794800	1794805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_015578	GGC	2	6	1797159	1797164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_015578	TCA	2	6	1798403	1798408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_015578	ATA	2	6	1799081	1799086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_015578	TAT	2	6	1799090	1799095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_015578	ATTA	2	8	1799100	1799107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_015578	CAA	2	6	1799108	1799113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_015578	CTT	2	6	1799136	1799141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_015578	TA	3	6	1799955	1799960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_015578	GGA	2	6	1800010	1800015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_015578	TA	4	8	1800774	1800781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_015578	T	7	7	1800782	1800788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_015578	AGC	2	6	1800889	1800894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_015578	GCT	2	6	1800901	1800906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_015578	G	6	6	1800931	1800936	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_015578	A	7	7	1801005	1801011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_015578	AT	3	6	1801024	1801029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_015578	A	6	6	1802748	1802753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_015578	AT	3	6	1806524	1806529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_015578	TCA	2	6	1816359	1816364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_015578	A	6	6	1829764	1829769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_015578	TAA	2	6	1829773	1829778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_015578	GAA	2	6	1833034	1833039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_015578	T	7	7	1833047	1833053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_015578	TTC	2	6	1840350	1840355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_015578	ATA	2	6	1845353	1845358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_015578	AAATTA	2	12	1845363	1845374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_015578	T	6	6	1847173	1847178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_015578	AT	3	6	1847188	1847193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_015578	TAT	3	9	1847191	1847199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_015578	T	6	6	1847209	1847214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_015578	T	8	8	1847222	1847229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_015578	AT	3	6	1847246	1847251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_015578	ATTA	2	8	1847274	1847281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_015578	ATT	2	6	1847294	1847299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_015578	TAA	2	6	1847318	1847323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_015578	T	6	6	1847324	1847329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_015578	T	7	7	1847367	1847373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015578	AAC	2	6	1847383	1847388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_015578	ATT	2	6	1847389	1847394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015578	T	6	6	1849191	1849196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_015578	TAA	2	6	1849217	1849222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_015578	CT	3	6	1850678	1850683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_015578	TTA	2	6	1850711	1850716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_015578	AT	3	6	1850720	1850725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_015578	AAT	2	6	1856057	1856062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_015578	TAAA	2	8	1856122	1856129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_015578	TGTT	2	8	1868768	1868775	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_015578	TAAT	2	8	1868854	1868861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_015578	AGGT	2	8	1868942	1868949	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_015578	TTC	2	6	1869083	1869088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_015578	A	7	7	1869101	1869107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_015578	CCG	2	6	1869116	1869121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_015578	TCCG	2	8	1869124	1869131	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_015578	CAG	2	6	1869202	1869207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_015578	CCA	2	6	1869312	1869317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_015578	GCC	2	6	1869336	1869341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_015578	TAA	2	6	1869372	1869377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_015578	T	6	6	1869510	1869515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_015578	TCC	2	6	1869521	1869526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_015578	TTGC	2	8	1869568	1869575	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4084	NC_015578	AAGC	2	8	1869586	1869593	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4085	NC_015578	A	7	7	1869668	1869674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_015578	T	8	8	1875053	1875060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_015578	A	6	6	1877477	1877482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_015578	CATA	2	8	1877524	1877531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4089	NC_015578	GTT	3	9	1877563	1877571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_015578	TTG	2	6	1880385	1880390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_015578	CCTT	2	8	1880437	1880444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_015578	C	8	8	1880453	1880460	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4093	NC_015578	GAG	2	6	1881692	1881697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_015578	AGC	2	6	1882345	1882350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_015578	GTTAA	2	10	1882503	1882512	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_015578	TTA	2	6	1884461	1884466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_015578	ATAA	2	8	1884840	1884847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_015578	T	8	8	1884854	1884861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_015578	T	6	6	1884877	1884882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_015578	TTCC	2	8	1884886	1884893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_015578	T	8	8	1886664	1886671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_015578	TAG	2	6	1886705	1886710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015578	GGGA	2	8	1886711	1886718	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_015578	GA	3	6	1886717	1886722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_015578	T	8	8	1889369	1889376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015578	TAC	2	6	1889414	1889419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_015578	TAT	2	6	1897186	1897191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_015578	A	7	7	1899849	1899855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_015578	GGC	2	6	1908041	1908046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_015578	A	7	7	1910116	1910122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_015578	GAA	2	6	1910225	1910230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_015578	ATCT	2	8	1910245	1910252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_015578	CGC	2	6	1910386	1910391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_015578	TGA	2	6	1910408	1910413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_015578	AGT	2	6	1911723	1911728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_015578	TTC	2	6	1911729	1911734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_015578	CCTTT	2	10	1911735	1911744	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4118	NC_015578	AG	3	6	1911775	1911780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_015578	A	6	6	1917998	1918003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_015578	TAA	2	6	1918087	1918092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_015578	T	9	9	1918110	1918118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_015578	ATA	2	6	1918130	1918135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_015578	TGA	2	6	1918139	1918144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_015578	TCCG	2	8	1920495	1920502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_015578	TG	3	6	1920572	1920577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_015578	GCG	2	6	1920632	1920637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_015578	TTC	2	6	1920641	1920646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_015578	A	8	8	1920650	1920657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_015578	GAA	2	6	1920676	1920681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_015578	AAG	2	6	1923333	1923338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_015578	AAT	2	6	1923361	1923366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_015578	GAA	2	6	1925369	1925374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4134	NC_015578	CCG	2	6	1927477	1927482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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