MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Treponema primitia ZAS-2 chromosome

Total Repeats: 8889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015578	ATT	2	6	452172	452177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015578	TGC	2	6	452248	452253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_015578	CAG	2	6	452290	452295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_015578	GCC	2	6	452343	452348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_015578	CAG	2	6	452443	452448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_015578	AG	3	6	452529	452534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015578	TGA	2	6	452559	452564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015578	TGT	2	6	452574	452579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015578	TC	3	6	452580	452585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_015578	A	7	7	452602	452608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015578	ATA	2	6	452613	452618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015578	TC	3	6	452638	452643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_015578	A	7	7	453512	453518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015578	CGG	2	6	454631	454636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_015578	TTA	2	6	457076	457081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015578	CA	3	6	459929	459934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_015578	TAA	2	6	459956	459961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015578	CT	3	6	459982	459987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_015578	TAA	2	6	459997	460002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015578	CT	3	6	461516	461521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_015578	CCT	2	6	461522	461527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_015578	TAT	2	6	462875	462880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015578	ATT	2	6	462945	462950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015578	TAA	2	6	464280	464285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015578	T	6	6	465764	465769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015578	A	7	7	465770	465776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015578	CT	3	6	466633	466638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_015578	GAAA	2	8	467295	467302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015578	A	8	8	467316	467323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015578	A	7	7	467334	467340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015578	TACC	2	8	467353	467360	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_015578	ATT	2	6	469456	469461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015578	TAT	2	6	469529	469534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015578	TGAT	2	8	469568	469575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015578	A	6	6	469587	469592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015578	TTGA	2	8	469605	469612	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015578	AGA	2	6	469623	469628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015578	TAT	2	6	469639	469644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015578	A	6	6	469667	469672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015578	ATTA	2	8	469699	469706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015578	ACAA	2	8	469713	469720	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_015578	A	6	6	469729	469734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015578	A	6	6	470702	470707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015578	TTG	2	6	470730	470735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015578	TAACAA	2	12	470736	470747	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1046	NC_015578	TA	3	6	470772	470777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015578	AAT	2	6	470815	470820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015578	AAGA	2	8	470828	470835	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015578	ATTT	2	8	470848	470855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015578	AATA	2	8	470860	470867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015578	AAC	2	6	470875	470880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_015578	A	6	6	470887	470892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015578	AAC	2	6	470906	470911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_015578	TTA	2	6	470925	470930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015578	CAA	2	6	470946	470951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015578	AGC	2	6	470953	470958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_015578	CA	3	6	470995	471000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_015578	TCC	2	6	471002	471007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_015578	TAA	2	6	471056	471061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015578	CAAA	2	8	471066	471073	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_015578	ATTT	2	8	471144	471151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015578	TA	3	6	471153	471158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015578	TAT	2	6	471194	471199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015578	ATA	2	6	472113	472118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015578	T	7	7	472144	472150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015578	TGA	2	6	474001	474006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015578	TGAA	2	8	474030	474037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015578	ATT	3	9	474086	474094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015578	ATT	3	9	474119	474127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015578	ATA	2	6	474136	474141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015578	CAT	2	6	474153	474158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_015578	T	6	6	474262	474267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015578	ATT	2	6	474272	474277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015578	A	7	7	474314	474320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015578	TATTG	2	10	474477	474486	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015578	TA	3	6	474535	474540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015578	AT	3	6	474664	474669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015578	TTTTC	2	10	474670	474679	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1079	NC_015578	TTC	2	6	474750	474755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_015578	TAT	2	6	474843	474848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015578	TAA	2	6	474893	474898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015578	AAT	2	6	474932	474937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015578	CAT	2	6	474944	474949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_015578	CGG	2	6	474955	474960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_015578	TGTT	2	8	474989	474996	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015578	GCG	2	6	474997	475002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_015578	ATA	2	6	475003	475008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015578	TGA	2	6	475017	475022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015578	TCA	2	6	475117	475122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_015578	A	7	7	475122	475128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015578	AAT	2	6	475254	475259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_015578	CGG	2	6	475287	475292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_015578	T	6	6	475341	475346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015578	TCA	2	6	475393	475398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_015578	TTA	2	6	475403	475408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015578	T	6	6	475499	475504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015578	GGC	2	6	475560	475565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_015578	CTT	2	6	479213	479218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_015578	CT	3	6	479222	479227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_015578	GCTG	2	8	479231	479238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_015578	ATAA	2	8	480105	480112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015578	C	6	6	480171	480176	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1103	NC_015578	CCA	2	6	480182	480187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_015578	CG	3	6	480203	480208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_015578	ACC	2	6	480251	480256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_015578	CCG	2	6	480262	480267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_015578	ATT	2	6	480298	480303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015578	GCC	2	6	480383	480388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_015578	CT	3	6	480455	480460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_015578	ACC	2	6	480491	480496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_015578	TC	3	6	480579	480584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_015578	ATG	2	6	480620	480625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015578	GCTT	2	8	480679	480686	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_015578	CTTC	2	8	480690	480697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_015578	CTT	2	6	480732	480737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_015578	GCC	2	6	480781	480786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_015578	TAAA	2	8	480799	480806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015578	CACATA	2	12	480814	480825	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_015578	TTCA	2	8	480838	480845	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_015578	T	6	6	480883	480888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015578	TCC	2	6	480998	481003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_015578	GCT	2	6	481006	481011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_015578	TCCG	2	8	481148	481155	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_015578	GCA	2	6	481166	481171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_015578	GGC	2	6	481183	481188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_015578	GCT	2	6	481225	481230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_015578	TCT	2	6	481284	481289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_015578	T	6	6	481404	481409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015578	T	6	6	481414	481419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015578	TTC	2	6	481450	481455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_015578	TAT	2	6	481491	481496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015578	CCCT	2	8	482128	482135	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1133	NC_015578	ATA	2	6	482138	482143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015578	ATT	2	6	482150	482155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015578	AT	3	6	482184	482189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015578	ATT	2	6	482860	482865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_015578	TCC	2	6	483087	483092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1138	NC_015578	TAT	2	6	483141	483146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1142	NC_015578	AT	3	6	483248	483253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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