MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Treponema primitia ZAS-2 chromosome

Total Repeats: 8889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015578	ATCCA	2	10	2031096	2031105	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4502	NC_015578	TAA	3	9	2031108	2031116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_015578	TATAC	2	10	2031154	2031163	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4504	NC_015578	GTATA	2	10	2031168	2031177	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_015578	TCT	2	6	2032415	2032420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_015578	TTC	2	6	2032428	2032433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_015578	TTG	2	6	2032568	2032573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_015578	TAAA	2	8	2032596	2032603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_015578	ATA	3	9	2032632	2032640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_015578	AAT	2	6	2032646	2032651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_015578	GCTTC	2	10	2033282	2033291	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4512	NC_015578	T	6	6	2033314	2033319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_015578	TGC	2	6	2033330	2033335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_015578	A	6	6	2033355	2033360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_015578	ATT	2	6	2033403	2033408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_015578	TGT	2	6	2033426	2033431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_015578	CAT	2	6	2034648	2034653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_015578	TCG	2	6	2034673	2034678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_015578	CTC	2	6	2034684	2034689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_015578	CT	3	6	2034725	2034730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4521	NC_015578	GGC	2	6	2034743	2034748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_015578	TGC	2	6	2034755	2034760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_015578	GCC	2	6	2034776	2034781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4524	NC_015578	CGT	2	6	2034786	2034791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_015578	A	6	6	2034844	2034849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_015578	ATA	2	6	2034875	2034880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_015578	ATT	2	6	2034921	2034926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_015578	T	6	6	2034989	2034994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_015578	T	8	8	2035036	2035043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_015578	AAT	2	6	2035055	2035060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_015578	AAG	2	6	2035084	2035089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_015578	A	6	6	2035162	2035167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_015578	A	7	7	2035265	2035271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_015578	GGC	2	6	2035330	2035335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_015578	TTA	2	6	2035443	2035448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_015578	GTA	2	6	2035481	2035486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_015578	ATAAA	2	10	2035509	2035518	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_015578	GTA	2	6	2035551	2035556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_015578	GAA	2	6	2035651	2035656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_015578	AATA	2	8	2035766	2035773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_015578	TCG	2	6	2035822	2035827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_015578	CTC	2	6	2035833	2035838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_015578	CTCCA	2	10	2035874	2035883	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4544	NC_015578	T	7	7	2035918	2035924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_015578	AAGA	2	8	2036054	2036061	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_015578	ATA	2	6	2036175	2036180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_015578	TAA	2	6	2037798	2037803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_015578	TAT	2	6	2037804	2037809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_015578	ATG	2	6	2037814	2037819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_015578	A	6	6	2037862	2037867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_015578	TCT	2	6	2037873	2037878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_015578	CCTA	2	8	2037920	2037927	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4553	NC_015578	TA	4	8	2037962	2037969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_015578	CCCA	2	8	2037996	2038003	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4555	NC_015578	CTT	2	6	2038010	2038015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_015578	GGT	3	9	2038037	2038045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_015578	TCCC	2	8	2038065	2038072	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4558	NC_015578	CGC	2	6	2038076	2038081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4559	NC_015578	AGG	2	6	2038108	2038113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_015578	CGC	2	6	2038124	2038129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4561	NC_015578	GGGA	2	8	2038178	2038185	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_015578	GAA	2	6	2038216	2038221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_015578	A	7	7	2038220	2038226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_015578	T	7	7	2038247	2038253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_015578	GGC	2	6	2038262	2038267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_015578	GCC	2	6	2038273	2038278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4567	NC_015578	ACC	2	6	2038289	2038294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_015578	CCCA	2	8	2038313	2038320	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4569	NC_015578	CAA	2	6	2038335	2038340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_015578	TGAAA	2	10	2038371	2038380	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_015578	CGC	2	6	2038385	2038390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4572	NC_015578	TCC	2	6	2038468	2038473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_015578	GGC	2	6	2038479	2038484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_015578	CCG	2	6	2038524	2038529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4575	NC_015578	TTC	2	6	2038532	2038537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_015578	GT	3	6	2038557	2038562	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_015578	ACC	2	6	2038629	2038634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4578	NC_015578	GCC	3	9	2038635	2038643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_015578	GCG	2	6	2038669	2038674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_015578	AGC	2	6	2038680	2038685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_015578	AATG	2	8	2038688	2038695	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_015578	ATA	2	6	2038776	2038781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_015578	AAT	3	9	2038819	2038827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_015578	A	6	6	2038873	2038878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_015578	AAC	2	6	2038933	2038938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_015578	GC	3	6	2038958	2038963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_015578	GCC	2	6	2039057	2039062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4588	NC_015578	ACA	2	6	2039084	2039089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_015578	AAT	2	6	2039100	2039105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_015578	CCCAA	2	10	2039125	2039134	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4591	NC_015578	G	6	6	2039146	2039151	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_015578	A	7	7	2039172	2039178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_015578	AAC	2	6	2040604	2040609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_015578	C	6	6	2044423	2044428	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4595	NC_015578	AT	3	6	2045172	2045177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_015578	AAG	2	6	2045207	2045212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_015578	TGC	2	6	2045235	2045240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_015578	CATA	2	8	2048963	2048970	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4599	NC_015578	TAG	2	6	2048971	2048976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_015578	AT	3	6	2049036	2049041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_015578	ATA	2	6	2049792	2049797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_015578	AAGT	2	8	2049879	2049886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_015578	A	6	6	2050022	2050027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_015578	A	6	6	2050196	2050201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_015578	AAT	2	6	2050219	2050224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_015578	TAT	2	6	2050229	2050234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_015578	GTT	2	6	2050826	2050831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_015578	TAT	2	6	2050832	2050837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_015578	TAA	2	6	2050842	2050847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_015578	ATT	2	6	2050859	2050864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_015578	AG	3	6	2050874	2050879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_015578	GGA	2	6	2052371	2052376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_015578	T	7	7	2053315	2053321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_015578	AGT	2	6	2054580	2054585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_015578	TAT	2	6	2054643	2054648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_015578	T	6	6	2054662	2054667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_015578	TAT	2	6	2054673	2054678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_015578	AAAAT	2	10	2054741	2054750	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_015578	CTTTA	2	10	2054768	2054777	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4620	NC_015578	TAA	2	6	2054794	2054799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_015578	AATG	2	8	2054866	2054873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_015578	A	7	7	2054882	2054888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_015578	GCTTC	2	10	2054955	2054964	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4624	NC_015578	T	7	7	2054986	2054992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_015578	T	7	7	2055011	2055017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_015578	A	7	7	2055026	2055032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_015578	T	6	6	2055063	2055068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_015578	T	7	7	2055072	2055078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_015578	ATA	2	6	2055079	2055084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_015578	AATT	2	8	2055085	2055092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_015578	A	7	7	2055102	2055108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_015578	A	6	6	2056071	2056076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4634	NC_015578	GGC	2	6	2056115	2056120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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