MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema azotonutricium ZAS-9 chromosome

Total Repeats: 836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015577	ATAA	2	8	1758	1765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015577	GCCT	2	8	20136	20143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015577	TTGA	2	8	32592	32599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015577	ATTT	2	8	33100	33107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015577	AGGA	2	8	33177	33184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015577	TGTA	2	8	38868	38875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015577	TCCT	2	8	46723	46730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015577	TTGC	2	8	52414	52421	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015577	ACTG	2	8	60580	60587	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015577	CCCA	2	8	60739	60746	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_015577	AAAT	2	8	66023	66030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015577	ATCA	2	8	75440	75447	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015577	TTAG	2	8	94201	94208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015577	GGCA	2	8	100292	100299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015577	AGGG	2	8	103355	103362	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015577	AAAT	2	8	116846	116853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015577	ATTG	2	8	124059	124066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015577	AAAT	2	8	131481	131488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015577	GGAA	2	8	146683	146690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015577	AGCA	2	8	150894	150901	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015577	TTCT	2	8	156766	156773	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015577	CAGC	2	8	178548	178555	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015577	AAGT	2	8	179164	179171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015577	GAAA	2	8	179987	179994	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015577	GGGT	2	8	187507	187514	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015577	TAAC	2	8	197017	197024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015577	TTAT	2	8	239949	239956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015577	GAAA	2	8	244806	244813	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015577	CTTT	2	8	244817	244824	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015577	CCTT	2	8	253487	253494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015577	TGTT	2	8	261180	261187	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015577	TTCT	2	8	263036	263043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015577	AAGG	2	8	267910	267917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015577	AAGC	2	8	278943	278950	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015577	GAAA	2	8	289992	289999	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015577	CCCT	3	12	290047	290058	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_015577	GGCA	2	8	291042	291049	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015577	ATAA	2	8	294289	294296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015577	GGGA	2	8	325116	325123	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015577	TGAA	2	8	325859	325866	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015577	CCTT	2	8	349337	349344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015577	CATT	2	8	356171	356178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015577	CAGC	2	8	363329	363336	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015577	CCTG	2	8	363449	363456	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015577	CCTG	2	8	365848	365855	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015577	ACGA	2	8	366214	366221	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015577	TCAT	2	8	367888	367895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015577	GAAG	2	8	378920	378927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015577	ATTA	2	8	381060	381067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015577	GCAG	3	12	381615	381626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015577	CAAT	2	8	382979	382986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015577	TCTT	2	8	384515	384522	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015577	CGTT	2	8	390186	390193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015577	TAAG	2	8	390475	390482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015577	GGCT	2	8	401323	401330	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015577	GTGG	2	8	412019	412026	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015577	TTGA	2	8	412264	412271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015577	AGAA	2	8	412287	412294	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015577	ATAA	2	8	420029	420036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015577	CCCA	2	8	422533	422540	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_015577	TCCC	2	8	422602	422609	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_015577	CCCT	2	8	422967	422974	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_015577	AGGG	2	8	423169	423176	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015577	ATGA	2	8	423240	423247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015577	GCAA	2	8	423498	423505	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015577	TAAA	2	8	423606	423613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015577	CATA	2	8	423645	423652	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015577	TAAC	2	8	423662	423669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015577	CCAA	2	8	423690	423697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015577	ACAG	2	8	437059	437066	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015577	TTTC	2	8	437757	437764	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015577	AAAT	2	8	441596	441603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015577	AATA	2	8	441649	441656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015577	ATTA	2	8	444471	444478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015577	AAAG	2	8	446524	446531	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015577	TCCC	2	8	446811	446818	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_015577	AAAG	2	8	454242	454249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015577	ATTG	2	8	454288	454295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015577	GTAA	2	8	454328	454335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015577	ATCA	2	8	462360	462367	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015577	TTGG	2	8	475254	475261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015577	CATG	2	8	480208	480215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015577	TTGT	2	8	488981	488988	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015577	GCCT	2	8	494873	494880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015577	CACT	2	8	495014	495021	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015577	CCAG	2	8	495123	495130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015577	TAAA	2	8	495344	495351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015577	ATTT	2	8	508306	508313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015577	TCGG	2	8	509843	509850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015577	CCTG	2	8	510117	510124	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015577	AAGC	2	8	510271	510278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015577	CTGC	2	8	510665	510672	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015577	CTTC	2	8	510679	510686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015577	TATG	2	8	512638	512645	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015577	AAAG	2	8	512685	512692	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015577	GTAC	2	8	525562	525569	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015577	GTAG	2	8	533659	533666	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015577	AAAG	2	8	539826	539833	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015577	CTGC	2	8	541758	541765	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015577	CCAT	2	8	542093	542100	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015577	TACA	2	8	542470	542477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015577	CCCT	2	8	542494	542501	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_015577	TTTC	2	8	562016	562023	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015577	AACG	2	8	562069	562076	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015577	CTTC	2	8	575342	575349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015577	TCCT	2	8	582873	582880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015577	GTTT	2	8	585918	585925	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015577	CACC	2	8	587756	587763	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_015577	AGAT	2	8	587771	587778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015577	GATT	2	8	595403	595410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015577	TCCA	2	8	608343	608350	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015577	CAAT	2	8	623879	623886	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015577	ATGC	2	8	624119	624126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015577	AGGC	2	8	624220	624227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015577	CTTA	2	8	624915	624922	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015577	AGCC	2	8	651129	651136	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015577	TAAA	2	8	653517	653524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015577	TTAT	2	8	653622	653629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015577	CATA	2	8	654038	654045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015577	TCAT	2	8	654087	654094	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015577	AAAT	2	8	654813	654820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015577	GGGC	2	8	681169	681176	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015577	CTTT	2	8	682706	682713	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015577	TGTT	2	8	682885	682892	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015577	AAAG	2	8	683969	683976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015577	AAAG	2	8	684657	684664	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015577	TAAT	2	8	698247	698254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015577	AAAT	2	8	702928	702935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015577	TCCC	2	8	709625	709632	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_015577	ATTT	2	8	719601	719608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015577	GCGT	2	8	735715	735722	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015577	CGGG	2	8	736206	736213	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015577	GGCT	2	8	736419	736426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015577	GGAG	2	8	736511	736518	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015577	GATG	2	8	736531	736538	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015577	TACA	2	8	736856	736863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015577	GGCG	2	8	737010	737017	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015577	GAAG	2	8	737215	737222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015577	GAGG	2	8	737236	737243	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015577	CAAC	2	8	751762	751769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015577	AGGG	2	8	757213	757220	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015577	AATA	2	8	757611	757618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015577	GCAG	2	8	759580	759587	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015577	GATA	2	8	764782	764789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015577	ATCG	2	8	774489	774496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015577	TCCA	2	8	775061	775068	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015577	TAAT	2	8	781258	781265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015577	TAAA	2	8	792286	792293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015577	AGTA	2	8	799570	799577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_015577	TTAT	2	8	2212160	2212167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_015577	TCAT	2	8	2212172	2212179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
476	NC_015577	AAAT	2	8	2214629	2214636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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