MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Tepidanaerobacter sp. Re1 chromosome

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015519	GATAAA	2	12	28464	28475	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015519	ACATGA	2	12	36806	36817	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015519	TTATGG	2	12	36963	36974	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015519	AATTCT	2	12	54058	54069	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015519	TTAAAT	2	12	59627	59638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015519	TATAAA	2	12	103627	103638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015519	CAAAAG	2	12	106360	106371	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015519	TAAAGG	2	12	147117	147128	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015519	AAATTT	2	12	150413	150424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015519	GGTATT	2	12	159986	159997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015519	TGAAAC	2	12	238570	238581	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015519	AAGCGA	2	12	252503	252514	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015519	TTTTAT	2	12	267169	267180	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015519	AATGAA	2	12	270110	270121	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015519	ACAGTA	2	12	284417	284428	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015519	AAAAAG	2	12	294559	294570	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015519	TTAGCC	2	12	299922	299933	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015519	AAAACC	2	12	337732	337743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015519	TAATCT	2	12	373822	373833	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015519	TTATGA	2	12	375615	375626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015519	ATGTAT	2	12	380270	380281	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015519	CTGTAA	2	12	380357	380368	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015519	CAAAAT	2	12	468162	468173	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015519	TTTATA	2	12	504361	504372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015519	ATATTT	2	12	516563	516574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015519	TTTAAA	2	12	518016	518027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015519	ACAAGA	2	12	535071	535082	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015519	CATCAA	2	12	569897	569908	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015519	TGATGT	2	12	579648	579659	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015519	AAGGAA	2	12	626167	626178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015519	ACCATT	2	12	650684	650695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015519	TAACAA	2	12	661764	661775	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015519	CATTAG	2	12	702819	702830	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015519	TTGACA	2	12	743118	743129	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015519	CTAAAA	2	12	747956	747967	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015519	CTCAAA	2	12	777966	777977	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015519	ATAAAA	2	12	783656	783667	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015519	ATTGTT	2	12	833183	833194	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015519	ATTTAT	2	12	887281	887292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015519	TAACTA	2	12	912406	912417	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015519	AAGCAC	2	12	922096	922107	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015519	AAAATA	2	12	926658	926669	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015519	AAAAGC	2	12	939714	939725	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015519	ATATTT	2	12	943900	943911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015519	GATTTG	2	12	951288	951299	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015519	CTTTTT	2	12	966423	966434	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015519	TAAATA	2	12	968540	968551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015519	GGACAA	2	12	968584	968595	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015519	TTAGAA	2	12	976969	976980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015519	AAAATC	2	12	991341	991352	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015519	CAAGCT	2	12	996194	996205	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015519	ATAAAT	2	12	996417	996428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015519	TTGAAA	2	12	1001150	1001161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015519	AAGTTA	2	12	1004849	1004860	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015519	ATTTTC	2	12	1020691	1020702	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015519	TAAAGC	2	12	1020941	1020952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015519	AATATG	2	12	1021365	1021376	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015519	TTTATA	2	12	1044410	1044421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015519	TATGCA	2	12	1069241	1069252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015519	TATAAT	2	12	1173867	1173878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015519	AATATT	2	12	1213695	1213706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015519	AAGCGA	2	12	1219396	1219407	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015519	TAAATG	2	12	1242256	1242267	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015519	TTAAAT	2	12	1330154	1330165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015519	TAAAAT	2	12	1377479	1377490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015519	TAAAAC	2	12	1406250	1406261	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015519	TGATTT	2	12	1425499	1425510	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015519	TTTATA	2	12	1428270	1428281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015519	CTGCTA	2	12	1433562	1433573	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015519	CAATTG	2	12	1438296	1438307	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015519	ATTTAT	2	12	1443577	1443588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015519	CTTATC	2	12	1462794	1462805	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015519	ATTTAA	2	12	1533314	1533325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015519	AATTGA	2	12	1581767	1581778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015519	ATAATT	2	12	1582194	1582205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015519	AGTATA	2	12	1617778	1617789	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015519	TTATAT	2	12	1666412	1666423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015519	ATAACA	2	12	1670575	1670586	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015519	TTTTGC	2	12	1683266	1683277	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015519	TAAAAA	2	12	1747420	1747431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015519	TCAATT	2	12	1792932	1792943	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015519	TTATTT	2	12	1803208	1803219	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015519	AATTTC	2	12	1873879	1873890	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015519	AATTTA	2	12	1945745	1945756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015519	TGAGCT	2	12	1955750	1955761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015519	TAAAAA	2	12	1956840	1956851	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015519	TAGAAT	2	12	1974210	1974221	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015519	TACCCC	2	12	1996496	1996507	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_015519	ATTTAC	2	12	2092317	2092328	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015519	CAATTA	2	12	2100686	2100697	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015519	GCCTAT	2	12	2108234	2108245	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015519	AATAAA	2	12	2112280	2112291	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015519	TCAAGT	2	12	2190704	2190715	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015519	TAAAAT	2	12	2194160	2194171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015519	TTATTT	2	12	2216917	2216928	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015519	GCTATG	2	12	2225163	2225174	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015519	TTTTTA	2	12	2238284	2238295	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015519	ATTTTT	2	12	2245624	2245635	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015519	GAATAT	2	12	2250121	2250132	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015519	ATAAAA	2	12	2253885	2253896	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015519	AAAAAT	2	12	2275384	2275395	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015519	ATATTT	2	12	2276097	2276108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015519	TAAAAT	2	12	2299651	2299662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015519	ATATTT	2	12	2305089	2305100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015519	TTTCAA	2	12	2330955	2330966	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015519	TAAAAT	2	12	2337023	2337034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015519	CGCCTC	2	12	2348698	2348709	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_015519	CCACAT	2	12	2399808	2399819	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015519	AATATA	2	12	2400108	2400119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015519	TAGATA	2	12	2402637	2402648	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015519	TTAAGT	2	12	2406750	2406761	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015519	TAAAAT	2	12	2412166	2412177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015519	CTTTCA	2	12	2468308	2468319	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015519	TCATGT	2	12	2479435	2479446	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_015519	TTTAAT	2	12	2482621	2482632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015519	TAAATT	2	12	2486512	2486523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015519	TTAAGT	2	12	2486835	2486846	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015519	TTTTTG	2	12	2491719	2491730	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015519	CTACAT	2	12	2491962	2491973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015519	TAAAAA	2	12	2494593	2494604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015519	TATTTT	2	12	2494718	2494729	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015519	TAAAAA	2	12	2496656	2496667	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015519	GCTTTA	2	12	2498258	2498269	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_015519	TTTTTA	2	12	2524222	2524233	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015519	GCACCG	2	12	2547244	2547255	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015519	CCGGTA	2	12	2549088	2549099	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015519	TATTTT	2	12	2566856	2566867	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015519	ATTTTT	2	12	2584412	2584423	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015519	GAAAAA	2	12	2605670	2605681	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015519	TGTATT	2	12	2655385	2655396	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015519	TATTTA	2	12	2669326	2669337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015519	TTTTAA	2	12	2688280	2688291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015519	GTTGCG	2	12	2689592	2689603	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_015519	TAAATA	2	12	2707676	2707687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.