MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Tepidanaerobacter sp. Re1 chromosome

Total Repeats: 10537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015519	ATC	2	6	239070	239075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_015519	CCTA	2	8	239097	239104	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_015519	ATC	2	6	239135	239140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_015519	CCTA	2	8	239167	239174	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_015519	CCTA	2	8	239238	239245	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_015519	TGA	2	6	239267	239272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015519	GAA	2	6	239276	239281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015519	CCTA	2	8	239304	239311	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_015519	CCTA	2	8	239370	239377	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_015519	CCTA	2	8	239440	239447	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_015519	CCTA	2	8	239509	239516	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_015519	CCTA	2	8	239575	239582	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_015519	CCTA	2	8	239642	239649	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_015519	TAC	2	6	239669	239674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_015519	CCTA	2	8	239713	239720	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_015519	CCTA	2	8	239778	239785	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_015519	CCTA	2	8	239846	239853	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_015519	GACA	2	8	239870	239877	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_015519	CCTA	2	8	239912	239919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_015519	CCTA	2	8	239978	239985	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_015519	CCTA	2	8	240045	240052	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_015519	CCTA	2	8	240113	240120	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_015519	CCTA	2	8	240182	240189	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_015519	GAC	2	6	240206	240211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_015519	GGA	2	6	240220	240225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015519	AG	3	6	240227	240232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015519	CCTA	2	8	240338	240345	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_015519	CCTA	2	8	240406	240413	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_015519	TA	3	6	240453	240458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015519	CCTA	2	8	240472	240479	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_015519	CCTA	2	8	240538	240545	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_015519	TA	3	6	240585	240590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015519	CCTA	2	8	240605	240612	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_015519	T	6	6	240641	240646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015519	CCTA	2	8	240672	240679	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_015519	CCTA	2	8	240741	240748	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_015519	CCTA	2	8	240813	240820	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_015519	GAAT	2	8	240853	240860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015519	CCTA	2	8	240880	240887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_015519	CCTA	2	8	240947	240954	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_015519	GA	3	6	240978	240983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015519	CCTA	2	8	241016	241023	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_015519	CCTA	2	8	241084	241091	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_015519	TAA	2	6	241128	241133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015519	CCTA	2	8	241152	241159	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_015519	CCTA	2	8	241218	241225	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_015519	T	7	7	241248	241254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015519	CCTA	2	8	241283	241290	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_015519	AT	3	6	241331	241336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015519	AAG	2	6	241339	241344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015519	CCTA	2	8	241352	241359	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_015519	TCT	2	6	241379	241384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_015519	ACCT	2	8	241417	241424	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_015519	AT	3	6	241454	241459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015519	ATG	2	6	241478	241483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015519	TG	3	6	241508	241513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015519	TA	3	6	241559	241564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015519	TGC	2	6	241577	241582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_015519	TAT	2	6	241620	241625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015519	AT	3	6	241624	241629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015519	TAA	2	6	241648	241653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015519	TGT	2	6	241678	241683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015519	TGT	2	6	241712	241717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015519	TAA	2	6	241733	241738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015519	AT	3	6	241742	241747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015519	TAA	2	6	241923	241928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015519	TGATA	2	10	242026	242035	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015519	T	6	6	242996	243001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015519	T	6	6	243006	243011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015519	CTTA	2	8	243051	243058	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_015519	ACT	2	6	243787	243792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_015519	ATT	2	6	243919	243924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015519	A	6	6	243951	243956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015519	ATT	2	6	244896	244901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015519	ATA	3	9	244910	244918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015519	TA	3	6	244946	244951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015519	A	6	6	244965	244970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015519	ATA	3	9	244979	244987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015519	GTAT	2	8	245028	245035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015519	CCTT	2	8	246029	246036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_015519	TTTCT	2	10	246037	246046	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1082	NC_015519	TAT	2	6	247400	247405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015519	CTT	2	6	247486	247491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_015519	ATAA	2	8	247495	247502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015519	CTG	2	6	247504	247509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_015519	TGA	2	6	247529	247534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015519	TAAT	2	8	247552	247559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015519	T	7	7	247588	247594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015519	ATT	2	6	247607	247612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015519	CTA	2	6	247634	247639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_015519	TA	5	10	247638	247647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_015519	ATT	2	6	247687	247692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015519	A	6	6	247701	247706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015519	AT	3	6	247719	247724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015519	A	6	6	247759	247764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015519	T	6	6	248256	248261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015519	AAAT	2	8	249760	249767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_015519	TAA	2	6	249776	249781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015519	AGC	2	6	249796	249801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_015519	AAT	2	6	249850	249855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015519	TTA	2	6	249894	249899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015519	GCA	2	6	249933	249938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_015519	AAC	2	6	249940	249945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_015519	A	7	7	249951	249957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015519	A	7	7	249963	249969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015519	TAA	2	6	250003	250008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015519	GGC	2	6	250127	250132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_015519	AGC	2	6	250186	250191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_015519	GCG	2	6	250201	250206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_015519	AAAG	2	8	250305	250312	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015519	ATGG	2	8	250326	250333	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015519	CCA	2	6	250370	250375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_015519	CGA	2	6	250379	250384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_015519	GCA	2	6	250453	250458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_015519	CGC	2	6	250500	250505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_015519	GAA	2	6	250512	250517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015519	CAG	2	6	250596	250601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015519	GAA	2	6	250788	250793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015519	GGC	2	6	250807	250812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_015519	GTGG	2	8	250909	250916	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015519	GAA	2	6	251051	251056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015519	GTA	2	6	251080	251085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015519	GGT	2	6	251134	251139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015519	GTC	2	6	251148	251153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_015519	TCGTG	2	10	251157	251166	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1126	NC_015519	GGA	2	6	251261	251266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015519	GAC	2	6	251274	251279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_015519	ATC	2	6	251285	251290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_015519	AC	3	6	251312	251317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_015519	AAC	2	6	251334	251339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_015519	AC	3	6	251481	251486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_015519	CAC	2	6	251496	251501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_015519	CCT	2	6	251606	251611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_015519	AAG	2	6	251657	251662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015519	A	6	6	251677	251682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015519	TTCT	2	8	251700	251707	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1137	NC_015519	GGA	2	6	251833	251838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_015519	CGA	2	6	251857	251862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_015519	AGCG	2	8	251870	251877	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1140	NC_015519	AGAA	2	8	252030	252037	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_015519	GCG	2	6	252056	252061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NC_015519	AT	3	6	252086	252091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_015519	AT	3	6	252113	252118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_015519	CTG	2	6	252181	252186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1148	NC_015519	GT	3	6	252399	252404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_015519	GGAG	2	8	252413	252420	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1174	NC_015519	GAA	2	6	255270	255275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1175	NC_015519	GGT	2	6	255276	255281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1262	NC_015519	AGTGC	2	10	268415	268424	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1263	NC_015519	TAT	2	6	268445	268450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1266	NC_015519	AAG	2	6	268799	268804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_015519	TA	3	6	270262	270267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_015519	CAA	2	6	270280	270285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1272	NC_015519	TTA	3	9	270287	270295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1407	NC_015519	A	8	8	291657	291664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_015519	A	6	6	291734	291739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_015519	AGA	2	6	291779	291784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_015519	ATCA	2	8	291962	291969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1411	NC_015519	GCGT	2	8	291975	291982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1412	NC_015519	ACA	2	6	292034	292039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_015519	CAT	2	6	292048	292053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1415	NC_015519	AACA	2	8	292116	292123	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1416	NC_015519	A	7	7	292123	292129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_015519	TGA	2	6	292144	292149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_015519	GAT	2	6	292190	292195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_015519	TA	3	6	292220	292225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_015519	A	7	7	292320	292326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_015519	AAGA	2	8	292343	292350	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_015519	A	6	6	292352	292357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_015519	ACA	2	6	292365	292370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1425	NC_015519	TAC	2	6	292373	292378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1426	NC_015519	AAAT	2	8	292383	292390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_015519	TGC	2	6	292421	292426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1429	NC_015519	GTG	2	6	292434	292439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_015519	TTTA	2	8	292442	292449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_015519	A	8	8	292449	292456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_015519	ACTG	2	8	292495	292502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1433	NC_015519	TG	3	6	292501	292506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_015519	T	6	6	292514	292519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_015519	A	7	7	294157	294163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1439	NC_015519	T	6	6	294266	294271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1441	NC_015519	T	6	6	294406	294411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_015519	ATT	2	6	294420	294425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_015519	A	6	6	294438	294443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1445	NC_015519	TTA	2	6	294480	294485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_015519	AT	3	6	294497	294502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_015519	CCA	2	6	294635	294640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1452	NC_015519	ATGCG	2	10	294642	294651	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1453	NC_015519	AAAG	2	8	294701	294708	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_015519	TAA	2	6	294762	294767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_015519	TGA	2	6	294788	294793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1485	NC_015519	TA	3	6	300077	300082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_015519	ATT	3	9	309098	309106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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