MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Tepidanaerobacter sp. Re1 chromosome

Total Repeats: 10537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015519	CGA	2	6	1217167	1217172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_015519	GCA	2	6	1217241	1217246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_015519	CGC	2	6	1217288	1217293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_015519	GAA	2	6	1217300	1217305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_015519	CAG	2	6	1217384	1217389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_015519	GAA	2	6	1217576	1217581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_015519	GGC	2	6	1217595	1217600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_015519	GTGG	2	8	1217697	1217704	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_015519	GAA	2	6	1217839	1217844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_015519	GTA	2	6	1217868	1217873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_015519	GGT	2	6	1217922	1217927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_015519	GTC	2	6	1217936	1217941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_015519	TCGTG	2	10	1217945	1217954	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5014	NC_015519	GGA	2	6	1218049	1218054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_015519	GAC	2	6	1218062	1218067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_015519	ATC	2	6	1218073	1218078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_015519	AC	3	6	1218100	1218105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_015519	AAC	2	6	1218122	1218127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_015519	AC	3	6	1218269	1218274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_015519	CAC	2	6	1218284	1218289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_015519	CCT	2	6	1218394	1218399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_015519	GA	3	6	1218440	1218445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_015519	CCA	2	6	1218533	1218538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_015519	GGT	2	6	1218563	1218568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_015519	TCCA	2	8	1218609	1218616	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_015519	CCA	2	6	1218620	1218625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_015519	ATTAA	2	10	1218678	1218687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_015519	GGA	2	6	1218726	1218731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_015519	CGA	2	6	1218750	1218755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_015519	AGCG	2	8	1218763	1218770	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_015519	AGAA	2	8	1218923	1218930	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_015519	GCG	2	6	1218949	1218954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_015519	AT	3	6	1218979	1218984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_015519	AT	3	6	1219006	1219011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_015519	AGGC	2	8	1219044	1219051	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_015519	CTG	2	6	1219074	1219079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_015519	GGA	2	6	1219182	1219187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_015519	ACC	2	6	1219207	1219212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_015519	GGGAG	2	10	1219263	1219272	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_015519	GT	3	6	1219292	1219297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_015519	GGAG	2	8	1219306	1219313	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_015519	AAGCGA	2	12	1219396	1219407	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5043	NC_015519	GAG	2	6	1219692	1219697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_015519	TGT	2	6	1219800	1219805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_015519	AGC	2	6	1219837	1219842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_015519	CA	3	6	1219843	1219848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_015519	CCG	2	6	1220061	1220066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_015519	AGG	2	6	1220205	1220210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_015519	CCG	2	6	1220273	1220278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_015519	GAG	2	6	1220400	1220405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_015519	CGG	2	6	1220669	1220674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_015519	GCC	2	6	1220926	1220931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_015519	ACC	2	6	1220940	1220945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_015519	CAA	2	6	1221123	1221128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_015519	CGG	2	6	1221162	1221167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_015519	TCG	2	6	1221278	1221283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_015519	CGT	2	6	1221358	1221363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_015519	CGT	2	6	1221384	1221389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_015519	GGAC	2	8	1221440	1221447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5060	NC_015519	ATCCC	2	10	1221552	1221561	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5061	NC_015519	TAA	2	6	1221645	1221650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_015519	TA	4	8	1221828	1221835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_015519	GAG	2	6	1221927	1221932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_015519	TAT	2	6	1222007	1222012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_015519	AT	3	6	1222011	1222016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_015519	ATA	2	6	1222044	1222049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_015519	A	7	7	1222077	1222083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_015519	AAGA	2	8	1222087	1222094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_015519	TTAA	2	8	1222151	1222158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_015519	TAA	2	6	1222160	1222165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_015519	ATG	2	6	1222279	1222284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_015519	TAT	2	6	1222299	1222304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_015519	CAA	2	6	1222318	1222323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_015519	TAA	2	6	1222329	1222334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_015519	A	6	6	1222356	1222361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_015519	CCTA	2	8	1222374	1222381	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_015519	CTAAT	2	10	1222399	1222408	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5078	NC_015519	TCT	2	6	1222426	1222431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_015519	CCA	2	6	1222487	1222492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_015519	AGG	2	6	1222531	1222536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_015519	CTT	2	6	1223254	1223259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_015519	ATT	2	6	1224789	1224794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_015519	T	6	6	1224793	1224798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_015519	AATA	2	8	1225577	1225584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_015519	AGG	2	6	1225639	1225644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_015519	AAG	2	6	1226224	1226229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_015519	GAG	2	6	1228381	1228386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_015519	AGAA	2	8	1229918	1229925	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_015519	A	6	6	1232747	1232752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_015519	AAT	2	6	1232760	1232765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_015519	A	6	6	1232789	1232794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_015519	TAAT	2	8	1232795	1232802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_015519	TAAA	2	8	1232848	1232855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_015519	TAAA	2	8	1232860	1232867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_015519	TAA	2	6	1233255	1233260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_015519	TTTTC	2	10	1233662	1233671	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5097	NC_015519	T	7	7	1233897	1233903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_015519	TTG	2	6	1233921	1233926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_015519	TAAA	2	8	1233932	1233939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_015519	AT	3	6	1233945	1233950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_015519	T	6	6	1236453	1236458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_015519	A	6	6	1236497	1236502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_015519	TTAT	2	8	1236507	1236514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_015519	TAATA	2	10	1236547	1236556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_015519	TA	3	6	1236555	1236560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_015519	AAC	2	6	1236582	1236587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_015519	AGG	2	6	1237195	1237200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_015519	GCG	2	6	1237203	1237208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_015519	AAT	2	6	1238207	1238212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_015519	AGG	2	6	1239234	1239239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_015519	AGG	2	6	1240190	1240195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_015519	AGA	2	6	1241894	1241899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_015519	ATT	2	6	1241900	1241905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_015519	TAT	2	6	1242249	1242254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_015519	TAAATG	2	12	1242256	1242267	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_015519	TAAA	2	8	1242303	1242310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_015519	GGA	2	6	1242334	1242339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_015519	ATA	2	6	1244316	1244321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_015519	AAG	2	6	1244329	1244334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_015519	CAT	2	6	1244347	1244352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_015519	AT	4	8	1244356	1244363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_015519	ATATA	2	10	1244371	1244380	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_015519	AT	3	6	1244405	1244410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_015519	AGG	2	6	1244704	1244709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_015519	T	8	8	1244753	1244760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_015519	AGG	2	6	1244789	1244794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_015519	TGTT	2	8	1249281	1249288	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_015519	TTG	2	6	1249312	1249317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_015519	GAAG	2	8	1249318	1249325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_015519	TTA	2	6	1249330	1249335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_015519	TTCAT	2	10	1249341	1249350	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5133	NC_015519	A	6	6	1249384	1249389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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