MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 plasmid pTHEAM01

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014917	AGGA	2	8	6817	6824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014917	TGTC	2	8	8541	8548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014917	TGTT	3	12	11047	11058	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014917	TGTT	2	8	11164	11171	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014917	TGTT	3	12	11190	11201	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014917	TAAT	2	8	18379	18386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014917	AGGA	2	8	21518	21525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014917	TGCT	2	8	21544	21551	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014917	TGTT	2	8	30701	30708	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014917	AAAT	2	8	38040	38047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014917	CGTT	2	8	38109	38116	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014917	CCTC	2	8	53965	53972	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_014917	GGGC	2	8	69149	69156	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014917	GGGC	2	8	72981	72988	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014917	GGGC	2	8	73898	73905	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014917	TTTC	2	8	74316	74323	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014917	GGCC	2	8	74643	74650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014917	CAAA	2	8	75201	75208	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014917	GCCC	2	8	75265	75272	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_014917	GGGC	2	8	75937	75944	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014917	CTTT	2	8	76447	76454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.