MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermaerobacter marianensis DSM 12885 chromosome

Total Repeats: 809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014831	TCCCA	2	10	275	284	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_014831	CGACG	2	10	433	442	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014831	CCGGC	2	10	1972	1981	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_014831	CGGCG	2	10	8855	8864	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014831	CCCGG	2	10	8915	8924	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_014831	AGGGG	2	10	11509	11518	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014831	CGGGC	2	10	14056	14065	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_014831	CCGGC	2	10	18613	18622	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_014831	CGCCC	2	10	22808	22817	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10	NC_014831	GCTCC	2	10	35826	35835	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_014831	GCCGG	2	10	56913	56922	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014831	TTTGC	2	10	59375	59384	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014831	GCCCG	2	10	66209	66218	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_014831	GTCCG	2	10	66293	66302	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014831	GCCGG	2	10	66723	66732	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_014831	CGTGC	2	10	71467	71476	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014831	CGGGG	2	10	73077	73086	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014831	GCCTG	2	10	74649	74658	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014831	TCGTG	2	10	74987	74996	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014831	GGGAA	2	10	76137	76146	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014831	GGGAG	2	10	76535	76544	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014831	GACGC	2	10	77565	77574	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014831	GCGAG	2	10	77673	77682	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014831	AGGGG	2	10	77903	77912	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014831	CCGAA	2	10	77934	77943	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014831	GCGCG	2	10	79523	79532	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014831	GCGCC	2	10	83580	83589	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_014831	CCGGC	2	10	84756	84765	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_014831	GACGG	2	10	92816	92825	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014831	GCCGG	2	10	94435	94444	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31	NC_014831	CGGTC	2	10	95296	95305	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_014831	CCGGC	2	10	99558	99567	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_014831	CCCGG	2	10	104159	104168	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_014831	CGCGG	2	10	109233	109242	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014831	GCCGC	2	10	111242	111251	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_014831	CCTGG	2	10	113045	113054	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014831	GGCCG	2	10	113429	113438	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_014831	GAACC	2	10	113449	113458	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_014831	CGGGC	2	10	117858	117867	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_014831	CCCGG	2	10	119192	119201	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
41	NC_014831	CTTTT	2	10	119317	119326	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014831	CGGCG	2	10	119429	119438	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_014831	GCCGG	2	10	123065	123074	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_014831	CCAGC	2	10	123285	123294	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_014831	CCCGT	2	10	123429	123438	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_014831	CCGGC	2	10	123771	123780	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_014831	GGCCC	2	10	124883	124892	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_014831	GGCCC	2	10	128259	128268	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_014831	CTTGC	2	10	128371	128380	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_014831	CGGGA	2	10	128697	128706	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014831	GCCGG	2	10	133931	133940	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014831	GCCGG	2	10	136303	136312	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014831	CCCCG	2	10	139418	139427	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
54	NC_014831	GCTAC	2	10	139535	139544	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014831	CGGCC	2	10	153739	153748	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_014831	GGGCG	2	10	155576	155585	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014831	TCCGG	2	10	155595	155604	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014831	TTTGC	2	10	156587	156596	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014831	GCCTG	2	10	159525	159534	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014831	TCGTG	2	10	159862	159871	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014831	GGGAA	2	10	161009	161018	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014831	GGGAG	2	10	161407	161416	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014831	GACGC	2	10	162438	162447	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014831	GCGAG	2	10	162543	162552	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014831	AGGGG	2	10	162771	162780	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014831	CCGAA	2	10	162802	162811	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014831	CGGGC	2	10	184969	184978	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
68	NC_014831	GCCCC	2	10	185047	185056	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
69	NC_014831	GGGCG	2	10	191010	191019	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014831	GTCCG	2	10	193061	193070	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_014831	GATTG	2	10	199065	199074	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014831	GCCGG	2	10	203017	203026	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_014831	GCCTC	2	10	205072	205081	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_014831	GCCGT	2	10	206085	206094	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014831	CCGGT	2	10	208025	208034	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_014831	GACCG	2	10	208073	208082	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014831	CGACG	2	10	210224	210233	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_014831	CCGGC	2	10	211801	211810	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
79	NC_014831	GCTCG	2	10	216080	216089	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_014831	GGGGA	2	10	220504	220513	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014831	CCGCA	2	10	224492	224501	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_014831	AGGAA	2	10	224558	224567	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014831	GCCGG	2	10	234201	234210	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_014831	GCGGT	2	10	245470	245479	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014831	CCCGT	2	10	253620	253629	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_014831	GCCGG	2	10	264281	264290	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_014831	GCCCA	2	10	264633	264642	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_014831	CGGGG	2	10	264874	264883	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014831	GGGCC	2	10	264961	264970	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014831	GGCCG	2	10	265569	265578	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_014831	CCGGC	2	10	265642	265651	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_014831	GCCGG	2	10	266016	266025	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_014831	CCCGG	2	10	276190	276199	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
94	NC_014831	TCCGG	2	10	279791	279800	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_014831	CTGGG	2	10	280318	280327	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014831	GCCAC	2	10	284351	284360	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_014831	GGAAG	2	10	284488	284497	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014831	GGAAG	2	10	287827	287836	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014831	CGGGG	2	10	287863	287872	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014831	GCCAG	2	10	289939	289948	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_014831	CGGCA	2	10	293989	293998	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014831	GGCCG	2	10	297738	297747	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_014831	GGGGA	2	10	311128	311137	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014831	GGGGT	2	10	315484	315493	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014831	GCCGG	2	10	317491	317500	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
106	NC_014831	GGTCC	2	10	326333	326342	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_014831	CCGGC	2	10	326821	326830	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
108	NC_014831	GTGGC	2	10	336744	336753	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014831	GAGCC	2	10	341268	341277	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_014831	CGGGG	2	10	343118	343127	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014831	CGCCC	2	10	343138	343147	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
112	NC_014831	CAGCA	2	10	353718	353727	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_014831	CCGGC	2	10	359159	359168	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_014831	GCCGG	2	10	359271	359280	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_014831	GACGG	2	10	363768	363777	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014831	TGCGG	2	10	367421	367430	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014831	CGGGC	2	10	373370	373379	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_014831	GCGCG	2	10	379738	379747	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014831	GGCCG	2	10	379990	379999	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014831	GCCGG	2	10	380044	380053	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
121	NC_014831	CGGGG	2	10	383716	383725	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014831	GCCGG	2	10	384915	384924	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014831	GGCGG	2	10	396354	396363	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014831	GCATC	2	10	397118	397127	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014831	TTCCC	2	10	400779	400788	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_014831	AACCC	2	10	405651	405660	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_014831	GCGCT	2	10	406788	406797	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014831	CCGTG	2	10	408948	408957	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_014831	CAGGC	2	10	410000	410009	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_014831	CCGGC	2	10	426438	426447	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_014831	GCGCC	2	10	427822	427831	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_014831	CGGCG	2	10	427847	427856	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_014831	GAGGC	2	10	427866	427875	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014831	GGCCG	2	10	427892	427901	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_014831	GCCGG	2	10	427916	427925	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
136	NC_014831	GGCCG	2	10	432342	432351	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_014831	TCCGG	2	10	447562	447571	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_014831	TTCTT	2	10	447611	447620	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014831	GCGCC	2	10	455187	455196	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_014831	CACGG	2	10	458823	458832	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_014831	CCGGC	2	10	458872	458881	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
142	NC_014831	GGGCG	2	10	459696	459705	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014831	GCCGG	2	10	467503	467512	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
144	NC_014831	GTCCG	2	10	467517	467526	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_014831	GCGCC	2	10	472264	472273	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
146	NC_014831	CGAAC	2	10	473286	473295	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_014831	GGCCG	2	10	478952	478961	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
148	NC_014831	GCGCT	2	10	500052	500061	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_014831	AAACG	2	10	501944	501953	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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188	NC_014831	CGGTG	2	10	621359	621368	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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275	NC_014831	CCGGG	2	10	906266	906275	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
276	NC_014831	CGGGC	2	10	907878	907887	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
277	NC_014831	GTTAG	2	10	912033	912042	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_014831	TTGGA	2	10	916751	916760	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_014831	GCGGT	2	10	953088	953097	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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297	NC_014831	GGATG	2	10	964410	964419	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_014831	CGGGC	2	10	1416353	1416362	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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427	NC_014831	CGCCA	2	10	1433493	1433502	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
428	NC_014831	TCCCG	2	10	1435590	1435599	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
429	NC_014831	CCGGG	2	10	1449914	1449923	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
430	NC_014831	CCGGT	2	10	1454740	1454749	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
431	NC_014831	GCCCC	2	10	1455931	1455940	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
432	NC_014831	CGGCG	2	10	1457281	1457290	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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471	NC_014831	TGCGG	2	10	1610766	1610775	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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473	NC_014831	GACCG	2	10	1616457	1616466	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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475	NC_014831	CGGCG	2	10	1616516	1616525	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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480	NC_014831	GCCGG	2	10	1629345	1629354	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
481	NC_014831	CCCCG	2	10	1634607	1634616	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
482	NC_014831	GGGAT	2	10	1639659	1639668	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_014831	CTCCC	2	10	1662360	1662369	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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488	NC_014831	TCCCT	2	10	1666826	1666835	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
489	NC_014831	CGCCC	2	10	1668527	1668536	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
490	NC_014831	GCCGC	2	10	1670371	1670380	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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499	NC_014831	CGCGG	2	10	1715813	1715822	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
500	NC_014831	GGCCG	2	10	1716358	1716367	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

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