MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter sp. X513 chromosome

Total Repeats: 1237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014538	TAAA	2	8	53	60	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014538	GGTG	2	8	14800	14807	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014538	GATT	2	8	15003	15010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014538	TTTG	2	8	30183	30190	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014538	TTAA	2	8	30368	30375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014538	TTTG	2	8	30744	30751	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014538	CAAC	2	8	33072	33079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014538	TAGA	2	8	33462	33469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014538	TAAA	2	8	33687	33694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014538	TTGC	2	8	34769	34776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014538	TAAG	2	8	35554	35561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014538	GGAA	2	8	35616	35623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014538	AAAT	2	8	35805	35812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014538	AAAT	2	8	41359	41366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014538	TTGG	2	8	41800	41807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014538	GAAA	2	8	41808	41815	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014538	AGCT	2	8	42185	42192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014538	CAAT	2	8	43577	43584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014538	AGAA	2	8	45758	45765	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014538	AGTG	2	8	45853	45860	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014538	GGCC	2	8	45888	45895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014538	GAAA	2	8	46944	46951	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014538	AGTG	2	8	48340	48347	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014538	ACTT	2	8	50924	50931	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014538	TTAA	2	8	52886	52893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014538	AGTT	2	8	52957	52964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014538	GGTT	2	8	53453	53460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014538	CAGC	2	8	55684	55691	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014538	TTAA	2	8	55870	55877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014538	AACA	2	8	56354	56361	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014538	ATTG	2	8	56675	56682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014538	TGGT	2	8	56845	56852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014538	AAAG	2	8	57053	57060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014538	ATAA	2	8	57377	57384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014538	ATTA	2	8	67219	67226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014538	AAAC	2	8	68429	68436	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014538	CTAC	2	8	71825	71832	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014538	TAAA	2	8	73240	73247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014538	TTAT	2	8	79769	79776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014538	TAAA	2	8	82266	82273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014538	AGAA	2	8	85719	85726	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014538	AGTG	2	8	85814	85821	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014538	GGCC	2	8	85849	85856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014538	GAAA	2	8	86905	86912	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014538	AGTG	2	8	88301	88308	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014538	AGGG	2	8	90329	90336	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014538	CAGG	2	8	94999	95006	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014538	TAGA	2	8	104181	104188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014538	GGAA	2	8	104287	104294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014538	ATAA	2	8	104307	104314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014538	AATA	2	8	107420	107427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014538	TTAC	2	8	110528	110535	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014538	TAAT	2	8	117998	118005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014538	TTTA	2	8	120362	120369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014538	ATTT	2	8	120389	120396	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014538	TAAA	2	8	120408	120415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014538	TAAA	2	8	125575	125582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014538	ATTT	2	8	126206	126213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014538	ATTA	2	8	126225	126232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014538	AAAG	2	8	126244	126251	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014538	AGCT	2	8	126661	126668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014538	TAAA	2	8	127712	127719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014538	AATC	2	8	132155	132162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014538	ATAC	2	8	133419	133426	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014538	TTCC	2	8	137798	137805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014538	TTTA	2	8	143577	143584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014538	TTAT	2	8	153720	153727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014538	TAAA	2	8	153794	153801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014538	GGGA	2	8	154060	154067	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014538	ATTT	2	8	158320	158327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014538	GCAA	2	8	158336	158343	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014538	GAGG	2	8	160467	160474	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014538	TAAT	2	8	165920	165927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014538	TAGT	2	8	170008	170015	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014538	GTGA	2	8	172590	172597	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014538	ATAG	2	8	173182	173189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014538	TTTC	2	8	173191	173198	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014538	GACA	2	8	174928	174935	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014538	AAAG	2	8	176008	176015	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014538	AAAG	2	8	180268	180275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014538	AAAG	2	8	186689	186696	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014538	GGGA	2	8	187733	187740	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014538	TTTG	2	8	189075	189082	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014538	TTTA	2	8	189114	189121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014538	TACA	2	8	189129	189136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014538	TGCG	2	8	194546	194553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014538	GAAG	2	8	194652	194659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014538	GATG	2	8	194714	194721	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014538	AAGG	2	8	194932	194939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014538	GTAC	2	8	196403	196410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014538	TAAT	2	8	199174	199181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014538	TTAA	2	8	206396	206403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014538	GGGC	2	8	207411	207418	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014538	GAAG	2	8	207530	207537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014538	GATG	2	8	207592	207599	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014538	AAGG	2	8	207810	207817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014538	GTAC	2	8	209281	209288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014538	ATGA	2	8	209365	209372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014538	AAAT	2	8	209623	209630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014538	AAAT	2	8	211312	211319	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014538	TTTA	2	8	214907	214914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014538	AATT	2	8	223915	223922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014538	GGAA	2	8	226605	226612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014538	ATAA	2	8	227806	227813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014538	TAAA	2	8	229658	229665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014538	ATGT	2	8	229706	229713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014538	AAGG	2	8	230025	230032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014538	AGTT	2	8	235461	235468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014538	AGAC	2	8	237729	237736	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014538	ATTT	2	8	239122	239129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014538	AAAG	2	8	243642	243649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014538	CAAA	2	8	252109	252116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014538	ATGG	2	8	263566	263573	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014538	CTTG	2	8	270050	270057	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014538	GAGT	2	8	270107	270114	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014538	AAAT	2	8	270240	270247	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014538	AATA	2	8	270666	270673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014538	AATT	2	8	276121	276128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014538	CCCT	2	8	285822	285829	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_014538	TGAT	2	8	285865	285872	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014538	TTAT	2	8	287566	287573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014538	ATTT	2	8	289417	289424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014538	GGAA	2	8	294195	294202	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014538	AGTC	2	8	295484	295491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014538	TAAA	2	8	302789	302796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014538	GCAA	2	8	302902	302909	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014538	CATA	2	8	302917	302924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014538	AAAT	2	8	307219	307226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014538	ATTT	2	8	308827	308834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014538	ATAG	2	8	309121	309128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014538	ATTT	2	8	315120	315127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014538	AAAT	2	8	329071	329078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014538	AAAG	2	8	333182	333189	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014538	CCAT	2	8	336039	336046	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014538	TACT	2	8	336137	336144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014538	TCTT	2	8	339162	339169	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014538	CAAA	2	8	342747	342754	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014538	TATT	2	8	344678	344685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014538	ATAA	2	8	347808	347815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014538	AAGT	2	8	348094	348101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014538	TGTT	2	8	348542	348549	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014538	GTTT	2	8	351464	351471	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014538	TCTT	2	8	351977	351984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014538	TTTA	2	8	378538	378545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014538	CCTG	2	8	378749	378756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014538	GCCC	2	8	381710	381717	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_014538	TAAT	2	8	383091	383098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014538	TTTA	2	8	383272	383279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014538	CTTT	2	8	385254	385261	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014538	TAAA	2	8	387054	387061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014538	TAAA	2	8	393767	393774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014538	GAGG	2	8	394984	394991	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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