MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thiomonas intermedia K12 plasmid pTINT01

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014154	TCCC	2	8	4501	4508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_014154	GTAC	2	8	7718	7725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014154	CATA	2	8	7746	7753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014154	GCCT	2	8	18561	18568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014154	AGCA	2	8	21021	21028	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014154	AAGA	2	8	21156	21163	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014154	CCAT	2	8	21327	21334	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014154	CCTG	2	8	22163	22170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014154	CAGA	2	8	23296	23303	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014154	GGCT	2	8	23338	23345	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014154	GTCG	2	8	23701	23708	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014154	TTCG	2	8	23989	23996	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014154	CCGA	2	8	24105	24112	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014154	GAGC	2	8	24853	24860	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014154	GCGG	2	8	24904	24911	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014154	GCTC	2	8	25692	25699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014154	CATC	2	8	26178	26185	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014154	GCCT	2	8	26724	26731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014154	TTTC	2	8	29565	29572	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014154	GTAT	2	8	30256	30263	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014154	TAGG	2	8	30265	30272	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014154	CCTA	2	8	31405	31412	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014154	GTTG	2	8	32207	32214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014154	GGTA	2	8	32272	32279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014154	GTAT	2	8	32355	32362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014154	CTAT	2	8	33346	33353	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014154	GACT	2	8	33954	33961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014154	TCCC	2	8	35913	35920	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_014154	GGGC	2	8	36019	36026	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014154	GTAG	2	8	36195	36202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014154	AGCA	2	8	36706	36713	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014154	CGCC	2	8	40453	40460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_014154	TCAA	2	8	41184	41191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.