MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 1587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014152	TTTA	2	8	1574	1581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014152	GAAA	2	8	6090	6097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014152	TGAA	2	8	12647	12654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014152	TAAA	2	8	13069	13076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014152	TCCT	2	8	16138	16145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014152	TTTA	2	8	16296	16303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014152	CGGA	2	8	17671	17678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014152	GTTA	2	8	17791	17798	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014152	ACCA	2	8	18890	18897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014152	TAGG	2	8	19124	19131	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014152	AGGC	2	8	19226	19233	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014152	AAGA	2	8	20501	20508	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014152	TAAC	2	8	20578	20585	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014152	CAGG	2	8	24036	24043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014152	CAGG	2	8	24063	24070	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014152	TGAC	2	8	25730	25737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014152	TGGT	2	8	25850	25857	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014152	AAAT	2	8	28023	28030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014152	GTCT	2	8	28118	28125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014152	AAAT	2	8	31737	31744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014152	AAGG	2	8	37501	37508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014152	CCGA	2	8	39255	39262	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014152	CAAT	2	8	39281	39288	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014152	GCTG	2	8	39417	39424	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014152	GGAG	2	8	40351	40358	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014152	GAAG	2	8	53013	53020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014152	AAAG	2	8	54360	54367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014152	GGAA	2	8	54373	54380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014152	GGGA	2	8	54960	54967	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014152	AAAC	2	8	64096	64103	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014152	AAAG	2	8	66737	66744	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014152	AATA	2	8	70566	70573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014152	AAAT	2	8	71206	71213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014152	CCTG	2	8	71635	71642	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014152	AAGC	2	8	71746	71753	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014152	TAAG	2	8	74733	74740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014152	AAAG	2	8	74876	74883	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014152	CAAC	2	8	74985	74992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014152	ACAA	2	8	77377	77384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014152	GTCG	2	8	81751	81758	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014152	GGTT	2	8	81873	81880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014152	CCGG	2	8	81968	81975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014152	CGGC	2	8	82358	82365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014152	GCTT	2	8	82495	82502	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014152	GGCG	2	8	82981	82988	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014152	GCCT	2	8	83026	83033	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014152	GCTT	2	8	83431	83438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014152	AGAC	2	8	84016	84023	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014152	ACAG	2	8	84366	84373	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014152	ATAG	2	8	84690	84697	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014152	TAGC	2	8	85726	85733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014152	ACCG	2	8	85871	85878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014152	CCAC	2	8	86664	86671	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_014152	AGGT	2	8	86885	86892	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014152	TTTG	2	8	93585	93592	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014152	TAGA	2	8	96665	96672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014152	TCTT	2	8	97639	97646	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014152	ACCA	2	8	97968	97975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014152	TTGG	2	8	98124	98131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014152	AAAT	2	8	98193	98200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014152	GAAA	2	8	99687	99694	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014152	ATTT	2	8	99919	99926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014152	ATTT	2	8	100078	100085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014152	GGCC	2	8	103160	103167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014152	TTGA	2	8	103366	103373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014152	CTGG	2	8	103487	103494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014152	ATTT	2	8	104353	104360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014152	CAAA	2	8	104495	104502	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014152	TACA	2	8	106324	106331	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014152	TTAT	2	8	106801	106808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014152	AATC	2	8	107207	107214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014152	GGGA	2	8	109569	109576	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014152	GCAT	2	8	109861	109868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014152	GGCT	2	8	109918	109925	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014152	CTCC	2	8	110103	110110	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_014152	GAAG	2	8	110232	110239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014152	AGGG	2	8	112197	112204	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014152	CAAA	2	8	112889	112896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014152	ATTT	2	8	112951	112958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014152	TGAA	2	8	113201	113208	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014152	AGAA	2	8	113327	113334	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014152	AAAT	2	8	122703	122710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014152	AAAT	2	8	122748	122755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014152	AAAT	2	8	124214	124221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014152	TAAT	2	8	124387	124394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014152	ATGG	2	8	129692	129699	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014152	AATA	2	8	129851	129858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014152	GGCC	2	8	129877	129884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014152	GAGT	2	8	129886	129893	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014152	TAGA	2	8	136219	136226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014152	GGAT	2	8	137169	137176	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014152	TTTA	2	8	140881	140888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014152	GCCG	2	8	141884	141891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014152	ACCT	2	8	141974	141981	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014152	TAAT	2	8	142335	142342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014152	CAAG	2	8	143153	143160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014152	TACA	2	8	144177	144184	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014152	GTCC	2	8	148285	148292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014152	TTAC	2	8	148489	148496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014152	ATAA	2	8	154592	154599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014152	GAAA	2	8	159747	159754	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014152	AATG	2	8	168361	168368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014152	GTTG	2	8	168473	168480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014152	GTTT	2	8	168491	168498	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014152	CCTA	2	8	168601	168608	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014152	TTAT	2	8	170679	170686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014152	GGTA	2	8	171338	171345	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014152	AACT	2	8	178436	178443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014152	AGGT	2	8	178660	178667	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014152	AGGG	2	8	180146	180153	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014152	TATT	2	8	180367	180374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014152	TGGC	2	8	181729	181736	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014152	CTGT	2	8	181881	181888	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014152	AATT	2	8	185833	185840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014152	GTTG	2	8	194965	194972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014152	ATTT	2	8	195401	195408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014152	CAGG	2	8	200094	200101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014152	ATAA	2	8	200194	200201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014152	TATT	2	8	201416	201423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014152	TTCC	2	8	201445	201452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014152	AAAT	2	8	201760	201767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014152	GAAA	2	8	203254	203261	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014152	GGCT	2	8	203492	203499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014152	GAGC	2	8	203513	203520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014152	TCGG	2	8	204101	204108	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014152	TATG	2	8	209424	209431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014152	AAGG	2	8	209561	209568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014152	TTTA	2	8	218933	218940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014152	GCCT	2	8	218989	218996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014152	TAAA	2	8	219133	219140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014152	ATTT	2	8	221070	221077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014152	AATT	2	8	221096	221103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014152	TTTA	2	8	221325	221332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014152	GGGT	2	8	224047	224054	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014152	ATAG	2	8	227276	227283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014152	CTTA	2	8	235714	235721	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014152	TAAT	2	8	235899	235906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014152	ATAC	2	8	240996	241003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014152	ATTA	2	8	243480	243487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014152	AAAT	2	8	243615	243622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014152	CGGC	2	8	244246	244253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014152	GCTT	2	8	244383	244390	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014152	GGCG	2	8	244869	244876	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014152	GCCT	2	8	244914	244921	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014152	GCTT	2	8	245319	245326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014152	AGAC	2	8	245904	245911	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014152	ACAG	2	8	246254	246261	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014152	AGGT	2	8	246717	246724	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014152	TAGC	2	8	247442	247449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014152	ACCG	2	8	247587	247594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014152	CCAC	2	8	248380	248387	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
152	NC_014152	AGGT	2	8	248601	248608	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014152	TCTT	2	8	250277	250284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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452	NC_014152	CAGG	3	12	872341	872352	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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482	NC_014152	AGGA	2	8	945355	945362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
483	NC_014152	AGGA	2	8	951893	951900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
484	NC_014152	GGGA	2	8	951932	951939	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
485	NC_014152	CATT	2	8	952448	952455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
486	NC_014152	CTTT	2	8	952686	952693	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
487	NC_014152	GTGG	2	8	962976	962983	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
488	NC_014152	CTGC	2	8	963170	963177	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
489	NC_014152	AGCA	2	8	963701	963708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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498	NC_014152	ATTT	2	8	1000196	1000203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_014152	AGAA	2	8	1006395	1006402	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_014152	TAAT	2	8	1017667	1017674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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