MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 5509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014152	AAT	2	6	58	63	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014152	GCA	2	6	71	76	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014152	AAC	2	6	1463	1468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014152	CAA	2	6	1482	1487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014152	TAA	2	6	1518	1523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014152	AGG	2	6	1633	1638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014152	GTT	2	6	3007	3012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014152	AGG	2	6	4129	4134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014152	GCA	2	6	4397	4402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014152	AAT	2	6	4406	4411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014152	TAG	2	6	4704	4709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014152	AGG	2	6	4737	4742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014152	GGA	2	6	6340	6345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014152	TCT	2	6	10936	10941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014152	GTA	2	6	11001	11006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014152	TAT	2	6	11036	11041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014152	TTA	2	6	11051	11056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014152	AGG	2	6	11063	11068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014152	AGG	2	6	11965	11970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014152	TTG	2	6	12671	12676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014152	CCG	2	6	12681	12686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_014152	TGT	2	6	12928	12933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014152	AAT	2	6	12941	12946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014152	GGT	2	6	13002	13007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014152	AAC	2	6	13161	13166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014152	AGG	2	6	13239	13244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014152	ATT	2	6	13321	13326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014152	CCA	2	6	16102	16107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_014152	TAA	2	6	16128	16133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014152	ATG	2	6	16188	16193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014152	AGG	2	6	16204	16209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014152	GTG	2	6	16235	16240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014152	TGA	2	6	16285	16290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014152	GAG	2	6	16316	16321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014152	CTA	2	6	17660	17665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014152	AGG	2	6	17698	17703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014152	CCT	2	6	17754	17759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014152	TTA	2	6	17767	17772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014152	GGC	2	6	17820	17825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014152	TGG	2	6	18010	18015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014152	ATA	2	6	18111	18116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014152	TGG	2	6	18186	18191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014152	GGA	2	6	18198	18203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014152	GTA	2	6	18263	18268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014152	GCC	2	6	18283	18288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014152	GCC	2	6	18910	18915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014152	GGC	2	6	19095	19100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014152	CGG	2	6	19118	19123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014152	CAA	2	6	19414	19419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014152	GAA	2	6	19511	19516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014152	ATT	2	6	20520	20525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014152	TAT	2	6	20588	20593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014152	TGC	2	6	24123	24128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014152	GAC	2	6	25750	25755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014152	TTA	2	6	25760	25765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014152	CAA	2	6	25798	25803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014152	AAT	2	6	25877	25882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014152	AGG	2	6	25970	25975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014152	TGT	2	6	26889	26894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014152	GTT	2	6	28158	28163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014152	AAG	2	6	31319	31324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014152	TAA	2	6	31729	31734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014152	AGG	2	6	31758	31763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014152	ATT	2	6	31778	31783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014152	CAA	2	6	31787	31792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014152	GAA	2	6	31836	31841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014152	TCC	2	6	35770	35775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_014152	TAA	2	6	35912	35917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014152	AGG	2	6	35939	35944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014152	TAA	2	6	36122	36127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014152	TAA	2	6	37483	37488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014152	ATT	2	6	37511	37516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014152	GTT	2	6	39239	39244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014152	ATT	2	6	39263	39268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014152	TTG	2	6	39314	39319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014152	AAG	2	6	39359	39364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014152	TTA	2	6	39376	39381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014152	TGA	2	6	39549	39554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014152	GGT	2	6	42659	42664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014152	AGG	2	6	44163	44168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014152	TGA	2	6	46831	46836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014152	CAT	2	6	49775	49780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014152	AGG	2	6	49817	49822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014152	AGG	2	6	50816	50821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014152	GCC	2	6	52996	53001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014152	TAA	2	6	57578	57583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014152	ACA	2	6	59415	59420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014152	GTT	2	6	59484	59489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014152	ATC	2	6	59537	59542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014152	TAA	2	6	59576	59581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014152	AGG	2	6	59694	59699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014152	AAT	2	6	63109	63114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014152	AGG	2	6	63149	63154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014152	TCT	2	6	64003	64008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014152	ATT	2	6	64080	64085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014152	GAA	2	6	64783	64788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014152	ATA	2	6	66499	66504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014152	AAT	2	6	66510	66515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014152	ATA	2	6	66530	66535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014152	TAT	2	6	66789	66794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014152	CAG	2	6	66818	66823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014152	AGG	2	6	67992	67997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014152	AGG	2	6	69038	69043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014152	AAG	2	6	69065	69070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014152	ATT	2	6	70541	70546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014152	ATT	2	6	70553	70558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014152	GAT	3	9	71108	71116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014152	ATT	2	6	71151	71156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014152	CAT	2	6	71196	71201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014152	CAA	2	6	71266	71271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014152	TAA	2	6	71451	71456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014152	TAA	2	6	71559	71564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014152	AGC	2	6	71737	71742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014152	TGG	2	6	71872	71877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014152	TTG	2	6	71935	71940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014152	TAA	2	6	73653	73658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014152	GGT	2	6	74031	74036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014152	ATT	2	6	74670	74675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014152	GAT	2	6	74722	74727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014152	GAA	2	6	74831	74836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014152	AGC	2	6	74926	74931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014152	GGT	2	6	74997	75002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014152	GGT	2	6	75065	75070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014152	GAT	2	6	75103	75108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014152	CCT	2	6	77360	77365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014152	GTC	2	6	77711	77716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014152	AGG	2	6	77756	77761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014152	AAT	2	6	78158	78163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014152	ATA	2	6	78180	78185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014152	AGG	2	6	78961	78966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014152	GTT	2	6	81700	81705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014152	AAG	2	6	81707	81712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014152	CAA	2	6	81775	81780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014152	AGC	2	6	81842	81847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014152	GGA	2	6	81894	81899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014152	TGA	2	6	81924	81929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014152	GGT	2	6	82108	82113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014152	AGT	2	6	82185	82190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014152	TAA	2	6	82249	82254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014152	AAG	2	6	82338	82343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014152	GGC	2	6	82451	82456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014152	ATA	2	6	82594	82599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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