MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 10363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014152	AGGT	2	8	246717	246724	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_014152	GAA	2	6	246769	246774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014152	CGG	2	6	246850	246855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_014152	AGG	2	6	246897	246902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014152	GGA	2	6	246934	246939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014152	ACA	2	6	246947	246952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_014152	GCG	2	6	246968	246973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_014152	GGA	2	6	246983	246988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014152	CCT	2	6	246997	247002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_014152	AAG	2	6	247036	247041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014152	AGG	2	6	247101	247106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014152	GA	3	6	247207	247212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014152	ACC	2	6	247262	247267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_014152	GGGAG	2	10	247338	247347	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014152	TAGC	2	8	247442	247449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_014152	GAG	2	6	247503	247508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014152	TGG	2	6	247573	247578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014152	ACCG	2	8	247587	247594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_014152	CGG	2	6	247607	247612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_014152	AGC	2	6	247919	247924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_014152	CAT	2	6	247925	247930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_014152	AG	3	6	248038	248043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014152	AGT	2	6	248140	248145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014152	GAG	2	6	248200	248205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014152	AGA	2	6	248219	248224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014152	GA	3	6	248223	248228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014152	CCG	2	6	248270	248275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_014152	CCAC	2	8	248380	248387	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1029	NC_014152	AGG	2	6	248412	248417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014152	CA	3	6	248483	248488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_014152	AGT	2	6	248522	248527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_014152	AGGT	2	8	248601	248608	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014152	GA	3	6	248612	248617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014152	GC	3	6	248626	248631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_014152	GA	3	6	248632	248637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014152	AGT	2	6	248695	248700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014152	AGAGG	2	10	248736	248745	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014152	ACG	2	6	248793	248798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_014152	AGG	2	6	248837	248842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_014152	CGG	2	6	248887	248892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_014152	CAA	2	6	248981	248986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_014152	GACAG	2	10	249033	249042	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1043	NC_014152	GTC	2	6	249144	249149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_014152	ACC	2	6	249158	249163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_014152	GGT	2	6	249381	249386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_014152	CGT	2	6	249576	249581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_014152	CGCAGG	2	12	249605	249616	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_014152	GAG	2	6	249625	249630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014152	AGG	2	6	249899	249904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014152	GA	3	6	249946	249951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014152	TAA	2	6	250010	250015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014152	TAA	2	6	250024	250029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014152	TAA	2	6	250038	250043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_014152	TAA	2	6	250052	250057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014152	TAA	2	6	250080	250085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014152	TAA	2	6	250094	250099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014152	TAA	2	6	250108	250113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_014152	AAT	2	6	250118	250123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014152	AC	3	6	250148	250153	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_014152	TA	3	6	250244	250249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014152	TCTT	2	8	250277	250284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_014152	CGGG	2	8	250305	250312	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_014152	TTA	2	6	250389	250394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014152	ATG	2	6	250503	250508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014152	GAAT	2	8	250510	250517	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014152	TTC	2	6	250531	250536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_014152	AGG	2	6	250544	250549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014152	TCC	2	6	251134	251139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_014152	T	7	7	251140	251146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014152	TGT	2	6	251172	251177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014152	TAA	2	6	251183	251188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014152	T	6	6	251203	251208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_014152	AAC	2	6	251299	251304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_014152	TCG	2	6	251341	251346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_014152	GTT	2	6	251384	251389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_014152	T	7	7	251388	251394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_014152	AAAT	2	8	251422	251429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_014152	TA	3	6	253198	253203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_014152	TAAT	2	8	253255	253262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_014152	TA	3	6	253286	253291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_014152	AGG	2	6	254535	254540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_014152	GGA	2	6	254769	254774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_014152	CGTC	2	8	254882	254889	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_014152	TCT	2	6	254908	254913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_014152	AAC	2	6	254914	254919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_014152	GCAAG	2	10	254927	254936	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1087	NC_014152	GA	3	6	255067	255072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014152	GTG	2	6	255075	255080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_014152	AGC	2	6	255161	255166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_014152	TAT	2	6	255306	255311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014152	AT	3	6	255310	255315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014152	A	6	6	255316	255321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014152	AGAA	2	8	255329	255336	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_014152	TAA	2	6	255601	255606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_014152	A	6	6	255605	255610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014152	TTA	2	6	255617	255622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014152	TGG	2	6	255660	255665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014152	CA	3	6	255733	255738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_014152	TGTTT	2	10	255755	255764	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_014152	GTT	2	6	255790	255795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014152	TC	3	6	255825	255830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_014152	GTGG	2	8	255901	255908	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014152	AAG	2	6	255958	255963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014152	AGG	2	6	255966	255971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014152	GCC	2	6	255998	256003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_014152	ACTCA	2	10	256016	256025	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1107	NC_014152	GGC	2	6	256047	256052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_014152	ATC	2	6	256069	256074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_014152	CTT	2	6	256102	256107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_014152	GCA	2	6	256119	256124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_014152	CCCA	2	8	256148	256155	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1112	NC_014152	GGA	2	6	256190	256195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014152	ATT	2	6	256196	256201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014152	TAA	2	6	258119	258124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014152	TTA	2	6	258148	258153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014152	A	6	6	258162	258167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014152	A	7	7	258199	258205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014152	AAG	2	6	260097	260102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014152	TTG	2	6	260266	260271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014152	TAA	2	6	260370	260375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_014152	G	6	6	260401	260406	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014152	CTG	2	6	264968	264973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_014152	GAAA	2	8	264986	264993	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014152	GAAG	2	8	265060	265067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014152	CAGG	3	12	265195	265206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_014152	GTG	2	6	265281	265286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014152	GTA	2	6	265306	265311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014152	GGA	2	6	265350	265355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014152	GGA	2	6	265364	265369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014152	AGC	2	6	265407	265412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_014152	GAAGA	2	10	265471	265480	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_014152	CTG	2	6	265530	265535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_014152	GA	3	6	265567	265572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014152	AGGA	2	8	265614	265621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014152	GAA	2	6	265646	265651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014152	TGA	2	6	265673	265678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_014152	CACC	2	8	267374	267381	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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1263	NC_014152	AGG	2	6	302765	302770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1267	NC_014152	TG	3	6	303844	303849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1413	NC_014152	CAGG	2	8	346392	346399	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1414	NC_014152	GCC	2	6	346433	346438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1415	NC_014152	TCAAG	2	10	346453	346462	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1416	NC_014152	GGC	2	6	346481	346486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_014152	CTGC	2	8	346531	346538	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1418	NC_014152	GCA	2	6	346552	346557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1419	NC_014152	CACC	2	8	346584	346591	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1420	NC_014152	GAAG	2	8	346604	346611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_014152	GTT	2	6	346631	346636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_014152	ATT	2	6	350067	350072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_014152	T	6	6	351251	351256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_014152	CTA	2	6	351267	351272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1425	NC_014152	GCT	2	6	352530	352535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1426	NC_014152	GCTTT	2	10	352540	352549	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1427	NC_014152	G	6	6	352625	352630	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_014152	CTG	3	9	353540	353548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1429	NC_014152	GCG	2	6	354056	354061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1430	NC_014152	TA	3	6	354990	354995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_014152	A	6	6	355005	355010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_014152	A	6	6	355030	355035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_014152	A	6	6	359560	359565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_014152	AGG	2	6	359608	359613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_014152	GA	3	6	363627	363632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_014152	ATTT	2	8	364916	364923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1437	NC_014152	GAG	2	6	364944	364949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1438	NC_014152	AG	3	6	364971	364976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_014152	AGT	2	6	365057	365062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_014152	GTG	2	6	365092	365097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_014152	TG	3	6	365112	365117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_014152	GC	3	6	365125	365130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1443	NC_014152	AGCA	2	8	365131	365138	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1444	NC_014152	GGT	2	6	365140	365145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_014152	TA	4	8	365213	365220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_014152	ATA	2	6	365248	365253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_014152	G	6	6	365274	365279	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1448	NC_014152	A	8	8	367872	367879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_014152	A	6	6	367895	367900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_014152	A	7	7	367916	367922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_014152	AAT	2	6	367944	367949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_014152	AGCC	2	8	367950	367957	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1453	NC_014152	CAC	2	6	371213	371218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1454	NC_014152	CCTG	2	8	371238	371245	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1455	NC_014152	AGG	2	6	371301	371306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_014152	GAA	2	6	372913	372918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_014152	AAG	2	6	372928	372933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1458	NC_014152	AAG	2	6	372946	372951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1459	NC_014152	TTG	2	6	372956	372961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1461	NC_014152	CG	3	6	377535	377540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1462	NC_014152	T	6	6	377548	377553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1463	NC_014152	T	6	6	377566	377571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1464	NC_014152	TA	3	6	377592	377597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1465	NC_014152	ACA	2	6	377678	377683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1466	NC_014152	TAGCT	2	10	377721	377730	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1468	NC_014152	A	6	6	377822	377827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1469	NC_014152	T	6	6	377832	377837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1470	NC_014152	CTT	2	6	377843	377848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1472	NC_014152	ATC	2	6	377872	377877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1475	NC_014152	CGG	2	6	379898	379903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1476	NC_014152	CCG	2	6	379911	379916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1477	NC_014152	TA	3	6	379928	379933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1478	NC_014152	G	7	7	379946	379952	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1479	NC_014152	CAGG	3	12	380004	380015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1480	NC_014152	GCC	2	6	380045	380050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1481	NC_014152	TCAAG	2	10	380065	380074	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1482	NC_014152	GGC	2	6	380093	380098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1483	NC_014152	CTGC	2	8	380143	380150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1484	NC_014152	GCA	2	6	380164	380169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1487	NC_014152	GTT	2	6	380279	380284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1488	NC_014152	TTG	2	6	380326	380331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1489	NC_014152	TCC	2	6	380772	380777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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