MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermincola potens JR chromosome

Total Repeats: 10363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014152	AATC	2	8	107207	107214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
502	NC_014152	A	7	7	107271	107277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014152	T	6	6	108331	108336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014152	CGG	2	6	108406	108411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_014152	ATA	2	6	108418	108423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014152	AGG	2	6	108426	108431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014152	A	6	6	109324	109329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_014152	GGT	2	6	109358	109363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014152	TA	3	6	109412	109417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014152	AGC	2	6	109518	109523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_014152	GGGA	2	8	109569	109576	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014152	GAA	2	6	109604	109609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014152	ACT	2	6	109849	109854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_014152	GCAT	2	8	109861	109868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
515	NC_014152	GGCT	2	8	109918	109925	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
516	NC_014152	T	9	9	109943	109951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014152	T	9	9	109956	109964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014152	ATT	2	6	110007	110012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014152	T	6	6	110070	110075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014152	TAC	2	6	110081	110086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_014152	GCT	2	6	110088	110093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_014152	CTCC	2	8	110103	110110	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
523	NC_014152	TGC	2	6	110128	110133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_014152	ATT	2	6	110136	110141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014152	GAAG	2	8	110232	110239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_014152	CTT	2	6	112159	112164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_014152	TA	7	14	112165	112178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014152	ATT	2	6	112183	112188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014152	AGGG	2	8	112197	112204	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014152	CAAA	2	8	112889	112896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_014152	ATTT	2	8	112951	112958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014152	TGAA	2	8	113201	113208	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014152	T	8	8	113232	113239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014152	T	6	6	113316	113321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014152	AGAA	2	8	113327	113334	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014152	CTG	2	6	114435	114440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_014152	CAG	2	6	115259	115264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_014152	ATT	2	6	115299	115304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014152	ACT	2	6	115347	115352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_014152	A	6	6	115356	115361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014152	AT	3	6	115427	115432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014152	T	6	6	115439	115444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014152	ATT	2	6	118067	118072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014152	GGA	2	6	118470	118475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014152	ACA	2	6	119539	119544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_014152	T	7	7	120576	120582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014152	ATA	2	6	120590	120595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014152	CTT	2	6	122636	122641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_014152	T	8	8	122640	122647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014152	AAAT	2	8	122703	122710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_014152	AAAT	2	8	122748	122755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014152	ATT	2	6	122760	122765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014152	GTG	2	6	122768	122773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014152	AGT	2	6	124144	124149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014152	TAG	2	6	124157	124162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014152	TAA	2	6	124191	124196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_014152	AAAT	2	8	124214	124221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014152	ATA	2	6	124229	124234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014152	ATT	2	6	124235	124240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014152	A	6	6	124268	124273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014152	ATA	2	6	124279	124284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014152	ATT	2	6	124309	124314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_014152	GAAAA	2	10	124343	124352	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014152	T	6	6	124361	124366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014152	TAAT	2	8	124387	124394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014152	AGG	2	6	126187	126192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014152	A	7	7	127405	127411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014152	T	6	6	127432	127437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014152	G	6	6	127441	127446	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014152	AAT	2	6	128086	128091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014152	GAG	2	6	128235	128240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014152	ATT	2	6	129641	129646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014152	A	7	7	129663	129669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014152	ATGG	2	8	129692	129699	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_014152	TGC	2	6	129702	129707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_014152	TTA	2	6	129781	129786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014152	AATA	2	8	129851	129858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_014152	A	7	7	129867	129873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_014152	GGCC	2	8	129877	129884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_014152	GAGT	2	8	129886	129893	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014152	AAAACG	2	12	129896	129907	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
582	NC_014152	T	6	6	132075	132080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014152	TCA	2	6	132506	132511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_014152	T	7	7	132522	132528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014152	ATA	2	6	132535	132540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014152	A	6	6	132564	132569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014152	A	6	6	132592	132597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014152	GTG	2	6	132609	132614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014152	T	6	6	136169	136174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014152	TAGA	2	8	136219	136226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014152	GGAT	2	8	137169	137176	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014152	ATT	2	6	137901	137906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014152	GAT	2	6	138717	138722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014152	T	6	6	138797	138802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014152	AAT	2	6	138808	138813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014152	A	6	6	138850	138855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_014152	GAA	2	6	138890	138895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014152	GGT	2	6	138932	138937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014152	TGT	2	6	139211	139216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014152	A	6	6	139226	139231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014152	GTA	2	6	139253	139258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014152	T	6	6	139336	139341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_014152	TA	4	8	139344	139351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014152	GGA	2	6	139476	139481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_014152	TTTA	2	8	140881	140888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_014152	GGA	2	6	140897	140902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014152	GCCG	2	8	141884	141891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
608	NC_014152	GCA	2	6	141935	141940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_014152	ATG	2	6	141951	141956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014152	ACCT	2	8	141974	141981	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_014152	CAA	2	6	142046	142051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_014152	GGT	2	6	142114	142119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014152	AAG	2	6	142243	142248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014152	AAAGT	2	10	142299	142308	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014152	TAAT	2	8	142335	142342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014152	T	6	6	142346	142351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014152	T	6	6	142402	142407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014152	ACG	2	6	142423	142428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_014152	CCA	2	6	142540	142545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_014152	GTG	3	9	142546	142554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014152	TA	3	6	143043	143048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_014152	CCT	3	9	143057	143065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_014152	ACC	2	6	143101	143106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_014152	CAAG	2	8	143153	143160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_014152	AGG	2	6	143179	143184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014152	TGC	2	6	143206	143211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_014152	TTG	2	6	143234	143239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_014152	ATA	3	9	143289	143297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014152	AAG	2	6	144132	144137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014152	T	6	6	144147	144152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014152	TTA	2	6	144158	144163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014152	TACA	2	8	144177	144184	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
633	NC_014152	TTTTTA	2	12	144187	144198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014152	ATT	2	6	144251	144256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014152	ATA	2	6	144282	144287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014152	GGA	2	6	144301	144306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014152	A	6	6	146738	146743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014152	GTCC	2	8	148285	148292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
639	NC_014152	ATA	2	6	148430	148435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_014152	TTAC	2	8	148489	148496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
641	NC_014152	TGT	2	6	148510	148515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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784	NC_014152	A	6	6	195484	195489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
785	NC_014152	A	7	7	195494	195500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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797	NC_014152	T	6	6	200981	200986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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923	NC_014152	GTT	2	6	236608	236613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
924	NC_014152	GTG	3	9	236638	236646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
925	NC_014152	GGA	2	6	238433	238438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
926	NC_014152	AG	3	6	238543	238548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
927	NC_014152	A	6	6	238565	238570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
928	NC_014152	A	6	6	238578	238583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
929	NC_014152	AAG	2	6	238589	238594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
930	NC_014152	TA	3	6	238623	238628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
931	NC_014152	TTG	2	6	238780	238785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
932	NC_014152	TTTCTT	2	12	238806	238817	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
933	NC_014152	AGG	2	6	239055	239060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
934	NC_014152	T	6	6	239988	239993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
935	NC_014152	AT	3	6	240926	240931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
936	NC_014152	ATAC	2	8	240996	241003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
937	NC_014152	AAG	2	6	241110	241115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
938	NC_014152	TGAATG	2	12	241131	241142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
939	NC_014152	ATT	2	6	241150	241155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
940	NC_014152	A	6	6	241187	241192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
941	NC_014152	A	6	6	241708	241713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
942	NC_014152	T	6	6	243268	243273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
943	NC_014152	A	6	6	243281	243286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
944	NC_014152	C	6	6	243366	243371	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
945	NC_014152	TTG	2	6	243375	243380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
946	NC_014152	CG	3	6	243402	243407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
947	NC_014152	ATTA	2	8	243480	243487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
948	NC_014152	AAAT	2	8	243615	243622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
949	NC_014152	TAA	2	6	244137	244142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
950	NC_014152	A	6	6	244154	244159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
951	NC_014152	AAG	2	6	244226	244231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
952	NC_014152	CGGC	2	8	244246	244253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
953	NC_014152	GGC	2	6	244339	244344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
954	NC_014152	GCTT	2	8	244383	244390	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
955	NC_014152	ATA	2	6	244482	244487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
956	NC_014152	CGA	2	6	244584	244589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
957	NC_014152	GCA	2	6	244658	244663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
958	NC_014152	CGC	2	6	244705	244710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
959	NC_014152	GAA	2	6	244717	244722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
960	NC_014152	TCA	2	6	244746	244751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
961	NC_014152	GAA	2	6	244754	244759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
962	NC_014152	GAG	2	6	244776	244781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
963	NC_014152	CAG	2	6	244804	244809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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965	NC_014152	GCCT	2	8	244914	244921	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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967	NC_014152	AGG	2	6	244994	244999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
968	NC_014152	GGC	2	6	245015	245020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
969	NC_014152	AGG	2	6	245119	245124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
970	NC_014152	GAA	2	6	245259	245264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
971	NC_014152	GTC	2	6	245309	245314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
972	NC_014152	GCTT	2	8	245319	245326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
973	NC_014152	GGT	2	6	245341	245346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
974	NC_014152	GTC	2	6	245355	245360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
975	NC_014152	TCGTG	2	10	245364	245373	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
976	NC_014152	AG	3	6	245446	245451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
977	NC_014152	GGA	2	6	245469	245474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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984	NC_014152	GTT	2	6	245877	245882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1000	NC_014152	ACA	2	6	246708	246713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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