MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013921	TAAAGT	2	12	15063	15074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013921	GATAAA	2	12	15123	15134	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013921	GGAGAA	2	12	24356	24367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013921	TAAAAA	2	12	29085	29096	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013921	AATTAA	2	12	36019	36030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013921	AATTTT	2	12	36207	36218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013921	AAGCGA	2	12	48897	48908	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013921	AAGCGA	2	12	92899	92910	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013921	TGAAAT	2	12	103238	103249	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013921	TTTTAT	2	12	121650	121661	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013921	AAATTT	2	12	131409	131420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013921	AAAGGT	2	12	172993	173004	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013921	AAAGGG	2	12	188682	188693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013921	TAATTT	2	12	219723	219734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013921	CGTCTT	2	12	269494	269505	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013921	TTAATT	2	12	299311	299322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013921	ATAAAG	2	12	299332	299343	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013921	TTTTTC	2	12	305943	305954	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013921	TTACTT	2	12	305993	306004	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013921	GAATTT	2	12	307729	307740	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013921	GAAGTA	2	12	308909	308920	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013921	TTTTAT	2	12	332918	332929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013921	AGCTCA	2	12	354512	354523	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013921	TAAATT	2	12	370811	370822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013921	GAATGC	2	12	382556	382567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013921	AGACAA	2	12	416508	416519	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013921	GATAAA	2	12	418028	418039	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013921	TTTTGA	2	12	419733	419744	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013921	ATAATT	2	12	424065	424076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013921	AAGTAA	2	12	434018	434029	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013921	ATTGTT	2	12	440043	440054	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013921	AAGCAA	2	12	440362	440373	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013921	ATAAAA	2	12	451633	451644	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013921	TAAAAA	2	12	454818	454829	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013921	ATTTAT	2	12	455991	456002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013921	ATCAAA	2	12	459879	459890	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013921	AAAAAT	2	12	486304	486315	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013921	ATTTAT	2	12	497484	497495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013921	AAGAAA	2	12	512021	512032	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013921	TATTTT	2	12	532978	532989	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013921	TTCTCT	2	12	547237	547248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013921	TAAAAT	2	12	582820	582831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013921	TTATTT	2	12	583752	583763	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013921	TAAAAT	2	12	608091	608102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013921	ATAAAA	2	12	631245	631256	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013921	AAATAT	2	12	656554	656565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013921	AAATTT	2	12	663284	663295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013921	ATAAAA	2	12	696590	696601	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013921	TTTTTA	2	12	724500	724511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013921	TAAAAT	2	12	726074	726085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013921	AAAGAA	2	12	733925	733936	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013921	AAAAAC	3	18	733944	733961	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013921	TAACAA	2	12	734926	734937	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013921	ATTTTT	2	12	736459	736470	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013921	GCTGAA	2	12	760908	760919	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013921	AGTTTT	2	12	762189	762200	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013921	TCCAAT	2	12	765565	765576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013921	TAAATA	2	12	787961	787972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013921	AATTAA	2	12	788849	788860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013921	ACGTGG	2	12	793336	793347	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013921	AGCAGA	2	12	793562	793573	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013921	TGCCTG	2	12	793750	793761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013921	GATATA	2	12	804636	804647	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013921	TATTAC	2	12	822898	822909	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013921	AGAATA	2	12	839855	839866	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013921	AAGGGG	2	12	840523	840534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013921	TTAGTT	2	12	872846	872857	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013921	TTGACT	2	12	882663	882674	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013921	CCAACG	2	12	971485	971496	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013921	ATTTCA	2	12	992096	992107	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013921	ATAAAA	3	18	1053030	1053047	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013921	TAAAAA	2	12	1088764	1088775	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013921	AGTATT	2	12	1091193	1091204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013921	TTTTTA	2	12	1100142	1100153	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013921	TGATAT	2	12	1132595	1132606	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013921	CTTTTT	2	12	1141939	1141950	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013921	TAAATT	2	12	1148696	1148707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013921	ACTTAT	2	12	1155504	1155515	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013921	AGTAAA	2	12	1176599	1176610	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013921	TAGACG	2	12	1177374	1177385	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013921	TAAAAT	2	12	1182026	1182037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013921	TTTTAA	2	12	1292157	1292168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013921	GCCTTT	2	12	1301899	1301910	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013921	TTTTAA	2	12	1315097	1315108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013921	ATTTGT	2	12	1320041	1320052	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013921	TCGCTT	2	12	1354230	1354241	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013921	TGTTAC	2	12	1424355	1424366	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013921	CCTCTT	2	12	1436441	1436452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013921	TCCTTT	2	12	1486565	1486576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013921	TTTTTA	2	12	1536557	1536568	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013921	ATTTTA	2	12	1538901	1538912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013921	TAAAAA	2	12	1558546	1558557	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013921	TAAAAA	2	12	1562868	1562879	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013921	TAAAAA	2	12	1613963	1613974	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013921	CATATT	2	12	1617448	1617459	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_013921	AAAATA	2	12	1655965	1655976	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013921	TTAATT	2	12	1659434	1659445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013921	TAATTC	2	12	1672741	1672752	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_013921	AGCTTT	2	12	1680899	1680910	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013921	ATTTTT	2	12	1711349	1711360	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013921	TAAATA	2	12	1711366	1711377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013921	GTTAAA	2	12	1753060	1753071	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013921	ATTTAT	2	12	1764066	1764077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013921	GGTTTT	2	12	1785640	1785651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013921	TAAGAA	2	12	1817246	1817257	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013921	TAAAAT	2	12	1847213	1847224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013921	CCCTTT	2	12	1914976	1914987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013921	TCGTTT	2	12	1932169	1932180	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013921	TGCAAT	2	12	1941509	1941520	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_013921	GTTTTT	2	12	1943477	1943488	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013921	CAATCT	2	12	1957092	1957103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013921	CCCTTT	2	12	1957297	1957308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013921	ATCCCC	2	12	1976269	1976280	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_013921	GAGCTG	2	12	1986725	1986736	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_013921	TCGCTT	2	12	1989658	1989669	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013921	AAATCA	2	12	2048488	2048499	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013921	TTACTT	2	12	2061447	2061458	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_013921	ATTCTT	2	12	2063596	2063607	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_013921	TTTTGT	2	12	2072317	2072328	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013921	TAAAAA	2	12	2084705	2084716	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013921	TTAATA	2	12	2090167	2090178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013921	TTTATC	2	12	2119941	2119952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_013921	ATAAAA	2	12	2123532	2123543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013921	ATCATA	2	12	2124599	2124610	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_013921	TCAATA	2	12	2129194	2129205	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_013921	ATTTAT	2	12	2139229	2139240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013921	GATAAT	2	12	2145095	2145106	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013921	TAATTT	2	12	2161884	2161895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013921	GGATAT	2	12	2168585	2168596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013921	TATATC	2	12	2169235	2169246	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_013921	ATTTAT	2	12	2212938	2212949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013921	GTGGAT	2	12	2231620	2231631	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013921	TTTTCT	2	12	2232848	2232859	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_013921	ATAAAA	2	12	2233259	2233270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013921	ATAGTA	2	12	2235826	2235837	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013921	ATTTTA	2	12	2237413	2237424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013921	CTCCTT	2	12	2249713	2249724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013921	TAAAAT	2	12	2251970	2251981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013921	AAAATT	2	12	2287907	2287918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013921	TTGTAT	2	12	2302923	2302934	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013921	CTTCAG	2	12	2334014	2334025	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013921	TCCCTC	2	12	2340130	2340141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_013921	ATAAAA	2	12	2342803	2342814	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013921	AAAAGA	2	12	2358742	2358753	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013921	TATCCT	2	12	2362445	2362456	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013921	AAAAGC	2	12	2375741	2375752	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_013921	TAAAAT	2	12	2383724	2383735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013921	TCTTTT	2	12	2399437	2399448	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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150	NC_013921	TGAAAA	2	12	2418414	2418425	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013921	AATTCA	2	12	2420614	2420625	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_013921	AATTAA	2	12	2422017	2422028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.