MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 4783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013921	CAA	2	6	6	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013921	ATT	2	6	45	50	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013921	TTA	2	6	80	85	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013921	AAC	2	6	132	137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013921	GTT	2	6	148	153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013921	GTT	2	6	171	176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013921	CAA	2	6	265	270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013921	TTA	2	6	333	338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013921	ATA	2	6	356	361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013921	TAT	2	6	362	367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013921	AGG	2	6	411	416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013921	TAA	2	6	1815	1820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013921	CAA	2	6	1846	1851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013921	TAT	2	6	1907	1912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013921	ACT	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013921	TAT	2	6	1940	1945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013921	ACC	2	6	9078	9083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_013921	CTC	2	6	9112	9117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_013921	TAC	2	6	9134	9139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013921	CTT	2	6	9145	9150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013921	CAT	2	6	9151	9156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013921	TAT	3	9	9287	9295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013921	TAA	3	9	9304	9312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013921	ATA	2	6	14836	14841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013921	ATT	2	6	15031	15036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013921	AAT	2	6	15048	15053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013921	TGA	2	6	15138	15143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013921	TAG	2	6	15252	15257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013921	GGT	2	6	15335	15340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013921	AGG	2	6	16912	16917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013921	CGG	2	6	24286	24291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013921	AGG	2	6	24440	24445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013921	TGA	2	6	26174	26179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013921	AGG	2	6	26193	26198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013921	ATT	2	6	27425	27430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013921	TAA	2	6	27461	27466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013921	CCT	2	6	29039	29044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_013921	TAT	2	6	29052	29057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013921	CCG	2	6	29099	29104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_013921	GAG	2	6	29410	29415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013921	AGT	2	6	29962	29967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013921	AGT	2	6	29975	29980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013921	ATA	2	6	29981	29986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013921	AGT	2	6	30017	30022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013921	TGG	3	9	30045	30053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013921	GTT	2	6	30214	30219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013921	TAT	2	6	30220	30225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013921	TAT	2	6	31501	31506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013921	CTG	2	6	31543	31548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013921	CAG	2	6	31574	31579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013921	CCT	2	6	31781	31786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_013921	TAT	2	6	31799	31804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013921	TCC	2	6	33049	33054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_013921	TTA	2	6	33139	33144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013921	TTA	2	6	33150	33155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013921	TTC	2	6	33162	33167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013921	TTA	2	6	36037	36042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013921	ATT	2	6	36338	36343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013921	TAA	2	6	36367	36372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013921	ATA	2	6	36437	36442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013921	TAT	2	6	36461	36466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013921	AAT	2	6	37014	37019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013921	AGA	2	6	37043	37048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013921	TGG	2	6	37067	37072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013921	ACA	2	6	37810	37815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013921	ATC	2	6	37818	37823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013921	AGT	2	6	37828	37833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013921	TGG	2	6	38103	38108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013921	TAT	2	6	38229	38234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013921	TAA	2	6	38259	38264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013921	TTC	2	6	38292	38297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013921	ATA	2	6	38337	38342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013921	AGA	2	6	38364	38369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013921	AAT	2	6	41895	41900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013921	AGG	2	6	41937	41942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013921	ATT	2	6	41947	41952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013921	TTC	2	6	42912	42917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013921	TAT	2	6	42924	42929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013921	TAA	2	6	43856	43861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013921	AGG	2	6	43888	43893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013921	ATA	2	6	45100	45105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013921	GAG	2	6	45111	45116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013921	TCC	2	6	45754	45759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_013921	ATA	2	6	45768	45773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013921	AGG	2	6	45794	45799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013921	ACA	2	6	46102	46107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013921	ATG	2	6	46145	46150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013921	AAT	2	6	46152	46157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013921	GTT	2	6	46211	46216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013921	AGA	2	6	46319	46324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013921	AGA	2	6	46392	46397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013921	AGA	2	6	46406	46411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013921	GGC	2	6	46460	46465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013921	GCG	2	6	46523	46528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013921	GGT	2	6	46587	46592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013921	GGA	2	6	46628	46633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013921	CGA	2	6	46710	46715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013921	GGT	2	6	46735	46740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013921	GCA	2	6	46784	46789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013921	CGC	2	6	46831	46836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_013921	GGA	2	6	46842	46847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013921	AGT	2	6	46870	46875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013921	GAA	2	6	46880	46885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013921	GTG	2	6	46886	46891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013921	CAG	2	6	46927	46932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013921	GGA	2	6	47118	47123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013921	GAA	2	6	47380	47385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013921	GGT	2	6	47408	47413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013921	GGT	2	6	47463	47468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013921	GTC	2	6	47477	47482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013921	GGA	2	6	47582	47587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013921	GGA	2	6	47591	47596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013921	ATC	2	6	47615	47620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013921	CAC	2	6	47826	47831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013921	GAA	2	6	47896	47901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013921	AGA	2	6	47902	47907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013921	CCT	2	6	48015	48020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_013921	GCG	2	6	48168	48173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013921	GCG	2	6	48350	48355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013921	GAG	2	6	48366	48371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013921	AGG	2	6	48390	48395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013921	GTA	2	6	48460	48465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013921	AGG	2	6	48585	48590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013921	ACC	2	6	48595	48600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_013921	TAC	2	6	48614	48619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013921	AGT	2	6	48781	48786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013921	GAT	2	6	48819	48824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013921	TGC	2	6	48929	48934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013921	TGG	2	6	48991	48996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013921	AGG	2	6	49158	49163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013921	AGC	2	6	49338	49343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013921	CCG	2	6	49558	49563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_013921	AGG	2	6	49695	49700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013921	AGC	2	6	49812	49817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013921	GAG	2	6	49894	49899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013921	CGG	2	6	50158	50163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013921	TGA	2	6	50252	50257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013921	GTA	2	6	50274	50279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013921	CGG	2	6	50417	50422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013921	ACC	2	6	50429	50434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_013921	ACT	2	6	50440	50445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013921	GAG	2	6	50465	50470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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