MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacter italicus Ab9 chromosome

Total Repeats: 9534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013921	ATTT	2	8	974166	974173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_013921	AAG	2	6	974189	974194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_013921	AGG	2	6	980868	980873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_013921	AGG	2	6	982309	982314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_013921	TTC	2	6	982781	982786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_013921	GA	3	6	982819	982824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_013921	A	6	6	984263	984268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_013921	T	7	7	984285	984291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_013921	TATAA	2	10	984318	984327	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_013921	AAAG	2	8	984338	984345	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_013921	TAA	2	6	984385	984390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_013921	A	7	7	984410	984416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_013921	TA	3	6	984417	984422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_013921	A	7	7	984431	984437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_013921	GGA	2	6	984439	984444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_013921	AACGT	2	10	984471	984480	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4017	NC_013921	AAT	2	6	984490	984495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_013921	ATA	2	6	984531	984536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_013921	AG	3	6	984580	984585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_013921	TTGT	2	8	984646	984653	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_013921	GCA	2	6	988140	988145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_013921	TGC	2	6	988154	988159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_013921	T	8	8	988180	988187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_013921	GAG	2	6	988236	988241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_013921	TATAA	2	10	991004	991013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_013921	AC	3	6	991038	991043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_013921	AAG	2	6	991065	991070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_013921	CAGA	2	8	991649	991656	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_013921	CTG	2	6	991817	991822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_013921	CCA	2	6	991903	991908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_013921	AAAT	2	8	991910	991917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_013921	CCA	2	6	991990	991995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_013921	T	6	6	992039	992044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_013921	GGGAT	2	10	992086	992095	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_013921	ATTTCA	2	12	992096	992107	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4036	NC_013921	TTA	2	6	992119	992124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_013921	GTT	2	6	992184	992189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_013921	AAAT	2	8	992219	992226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_013921	TTC	2	6	992255	992260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_013921	GTG	2	6	992326	992331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_013921	A	8	8	992336	992343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_013921	AGA	2	6	992345	992350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_013921	TAC	2	6	992359	992364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_013921	GGA	2	6	992443	992448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_013921	AAGG	2	8	992452	992459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_013921	GTT	2	6	992533	992538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_013921	AG	3	6	992539	992544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_013921	AGAT	2	8	992639	992646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_013921	A	7	7	992660	992666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_013921	ATA	2	6	992694	992699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_013921	A	6	6	994012	994017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_013921	A	7	7	994019	994025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_013921	T	6	6	994035	994040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_013921	T	7	7	994042	994048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_013921	CTT	2	6	994139	994144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_013921	TCC	2	6	994186	994191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_013921	TGTT	2	8	994256	994263	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_013921	AAT	2	6	994283	994288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_013921	TTC	2	6	994298	994303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_013921	TAAA	2	8	994305	994312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_013921	ATT	2	6	994451	994456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_013921	TTG	2	6	994468	994473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_013921	AGA	2	6	994600	994605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_013921	GCAG	2	8	994672	994679	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_013921	AAAT	2	8	994707	994714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_013921	AGG	2	6	994770	994775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_013921	A	7	7	994827	994833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_013921	GCA	2	6	994866	994871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_013921	CTA	2	6	994875	994880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_013921	TTAA	2	8	994881	994888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_013921	TTA	2	6	994924	994929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_013921	CT	3	6	994936	994941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_013921	ACA	2	6	994994	994999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_013921	AGG	2	6	995080	995085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4076	NC_013921	T	7	7	1002319	1002325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_013921	GCCC	2	8	1002332	1002339	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4078	NC_013921	ATG	2	6	1002359	1002364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4080	NC_013921	TAG	2	6	1002396	1002401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_013921	T	6	6	1002439	1002444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_013921	T	6	6	1002449	1002454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_013921	ATG	2	6	1002559	1002564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_013921	CAG	2	6	1002621	1002626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4087	NC_013921	TCC	2	6	1002687	1002692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_013921	GA	3	6	1002750	1002755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_013921	ATT	2	6	1002793	1002798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_013921	TAA	2	6	1002818	1002823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_013921	TAA	2	6	1002827	1002832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_013921	T	6	6	1002835	1002840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_013921	GTT	2	6	1002859	1002864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4098	NC_013921	AGA	2	6	1003056	1003061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_013921	T	6	6	1003108	1003113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_013921	T	6	6	1003136	1003141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_013921	GTACA	2	10	1003224	1003233	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4102	NC_013921	AATTC	2	10	1003261	1003270	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4103	NC_013921	A	6	6	1003281	1003286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_013921	AGA	2	6	1003329	1003334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_013921	GAA	2	6	1003363	1003368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_013921	T	6	6	1003373	1003378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_013921	CTTTT	2	10	1003423	1003432	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4108	NC_013921	A	6	6	1003439	1003444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_013921	CAG	2	6	1003590	1003595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4112	NC_013921	GGA	2	6	1003661	1003666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_013921	AGG	2	6	1003674	1003679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_013921	GAG	2	6	1003680	1003685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_013921	TA	3	6	1003731	1003736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_013921	GAA	2	6	1003740	1003745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_013921	AG	3	6	1003775	1003780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_013921	TGA	2	6	1003829	1003834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_013921	A	6	6	1003863	1003868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_013921	GA	3	6	1003977	1003982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_013921	T	6	6	1003992	1003997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_013921	A	6	6	1004014	1004019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_013921	CCA	2	6	1004058	1004063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_013921	TTA	2	6	1004095	1004100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_013921	T	6	6	1004111	1004116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_013921	GTT	2	6	1004127	1004132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_013921	ACA	2	6	1004236	1004241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_013921	TTTTA	2	10	1004243	1004252	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_013921	AAT	2	6	1006642	1006647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_013921	ATA	2	6	1006655	1006660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_013921	TAAT	2	8	1006675	1006682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_013921	T	6	6	1006695	1006700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_013921	TTG	2	6	1006725	1006730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_013921	GAAA	2	8	1006756	1006763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4136	NC_013921	TTA	2	6	1007505	1007510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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