MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermocrinis albus DSM 14484 chromosome

Total Repeats: 1384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013894	TAT	2	6	510322	510327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_013894	AAC	2	6	512222	512227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_013894	CTC	2	6	513997	514002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_013894	CAG	2	6	514018	514023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_013894	GGT	2	6	523811	523816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013894	TAT	2	6	534732	534737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013894	GACC	2	8	534742	534749	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
508	NC_013894	TTA	2	6	536263	536268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013894	GGC	2	6	536341	536346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_013894	CCA	2	6	538111	538116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_013894	AAT	2	6	539982	539987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_013894	AGG	2	6	541756	541761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013894	TTC	2	6	542169	542174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_013894	TC	3	6	542196	542201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_013894	TAG	2	6	542206	542211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013894	CTT	2	6	542213	542218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_013894	CCT	2	6	552891	552896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_013894	CCT	2	6	556041	556046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_013894	GGAG	2	8	556062	556069	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013894	CG	3	6	556110	556115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_013894	ATT	2	6	567941	567946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_013894	TTATAT	2	12	568386	568397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013894	TTA	2	6	570129	570134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013894	A	6	6	570136	570141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013894	TA	3	6	570146	570151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013894	CTA	2	6	572918	572923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_013894	T	6	6	572927	572932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013894	CGG	2	6	576685	576690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_013894	TATT	2	8	576755	576762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_013894	CCT	2	6	578194	578199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_013894	AC	3	6	578244	578249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_013894	ATG	2	6	578252	578257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013894	CCT	2	6	583113	583118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_013894	CCT	2	6	588659	588664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_013894	TCC	2	6	591657	591662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_013894	TAT	2	6	600823	600828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013894	AAAGG	2	10	600829	600838	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013894	CCT	2	6	601870	601875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_013894	A	6	6	603044	603049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013894	GGA	2	6	603998	604003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013894	CCT	2	6	605457	605462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_013894	CTG	2	6	605588	605593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_013894	GCT	2	6	605605	605610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_013894	CCT	2	6	605719	605724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_013894	AATAT	2	10	605820	605829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013894	T	6	6	607129	607134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013894	CT	3	6	607186	607191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_013894	AGA	2	6	607226	607231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013894	T	6	6	607297	607302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013894	CCA	2	6	607345	607350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_013894	AAG	2	6	607402	607407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013894	TGC	2	6	607440	607445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_013894	GTAA	2	8	607467	607474	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
554	NC_013894	CCT	2	6	607506	607511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_013894	T	6	6	607514	607519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013894	ATATAA	2	12	607521	607532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_013894	TTC	2	6	607535	607540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_013894	CCT	2	6	607550	607555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_013894	TGG	2	6	607564	607569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013894	ATT	3	9	607578	607586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013894	CT	3	6	612205	612210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_013894	GGA	3	9	613338	613346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013894	AAG	2	6	616403	616408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_013894	CAGC	2	8	616420	616427	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
565	NC_013894	TAT	2	6	616431	616436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_013894	CCT	2	6	630128	630133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_013894	TGG	2	6	632158	632163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013894	TG	3	6	634181	634186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013894	CAGC	2	8	638027	638034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
570	NC_013894	TAAT	2	8	638083	638090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013894	AGG	2	6	638114	638119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013894	TCT	2	6	641670	641675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_013894	A	6	6	641724	641729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_013894	CTT	2	6	641832	641837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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576	NC_013894	T	6	6	641925	641930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013894	AAAT	2	8	641950	641957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013894	T	6	6	642006	642011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013894	GATA	2	8	642013	642020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013894	TAT	2	6	642092	642097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013894	TAT	2	6	644530	644535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_013894	TCT	2	6	644542	644547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_013894	AGG	2	6	644555	644560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_013894	TGG	2	6	644570	644575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013894	AGG	2	6	644604	644609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_013894	AGA	2	6	644610	644615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013894	AGG	2	6	645068	645073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013894	CCA	2	6	645098	645103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_013894	TTA	2	6	647340	647345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_013894	AGG	2	6	647382	647387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013894	AGTAGG	2	12	647409	647420	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013894	TCC	2	6	651233	651238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_013894	GAT	2	6	651258	651263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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595	NC_013894	CCT	2	6	653307	653312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_013894	CCT	2	6	655619	655624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_013894	AGGA	2	8	655664	655671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_013894	AGG	2	6	664682	664687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013894	GC	3	6	667926	667931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
600	NC_013894	G	6	6	667938	667943	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013894	A	6	6	667981	667986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013894	GGA	2	6	667987	667992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_013894	T	6	6	671987	671992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013894	GTGG	2	8	675813	675820	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013894	AG	3	6	678780	678785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013894	CCT	2	6	679103	679108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_013894	AT	6	12	679111	679122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013894	TC	3	6	679132	679137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_013894	TAT	2	6	679314	679319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013894	CCT	2	6	681888	681893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_013894	AGC	2	6	683008	683013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_013894	CCT	2	6	683015	683020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_013894	TAAAA	2	10	683064	683073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013894	TAGAG	2	10	683079	683088	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013894	TAA	2	6	683128	683133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013894	ATT	2	6	683189	683194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_013894	AGTA	2	8	683207	683214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013894	GCA	2	6	683237	683242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_013894	AT	3	6	683310	683315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_013894	ATT	2	6	683327	683332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013894	AG	3	6	683334	683339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_013894	CCT	2	6	688288	688293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_013894	CCT	2	6	688306	688311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_013894	AAC	2	6	688331	688336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_013894	ATT	2	6	688360	688365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013894	AAT	2	6	688367	688372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_013894	CAA	2	6	688382	688387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013894	ACAA	2	8	688487	688494	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
629	NC_013894	AGG	2	6	688529	688534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_013894	TA	3	6	691749	691754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_013894	TA	3	6	691761	691766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013894	AT	3	6	691767	691772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_013894	TTA	2	6	695853	695858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013894	CTG	2	6	695967	695972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_013894	A	7	7	696018	696024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_013894	GAGG	2	8	696621	696628	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
637	NC_013894	CTC	2	6	711026	711031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_013894	TAT	2	6	711044	711049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_013894	ATC	2	6	716793	716798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_013894	CTCAC	2	10	718099	718108	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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644	NC_013894	CCT	2	6	723721	723726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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663	NC_013894	AGG	2	6	745699	745704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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