MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 5438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013889	CGAT	2	8	1750270	1750277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_013889	GAT	2	6	1750319	1750324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_013889	AT	3	6	1750422	1750427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_013889	AAC	2	6	1750461	1750466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_013889	GA	3	6	1750477	1750482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_013889	ATT	2	6	1750523	1750528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_013889	ATG	2	6	1750540	1750545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_013889	ATC	2	6	1750599	1750604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_013889	CAGTG	2	10	1750607	1750616	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3510	NC_013889	AAAG	2	8	1750641	1750648	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_013889	GAT	2	6	1750680	1750685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_013889	GAA	2	6	1750707	1750712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_013889	CAT	2	6	1750744	1750749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_013889	CGAAG	2	10	1750775	1750784	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3515	NC_013889	A	7	7	1750853	1750859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_013889	CG	3	6	1750860	1750865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_013889	CTT	2	6	1750952	1750957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_013889	CTA	2	6	1751034	1751039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_013889	TTC	2	6	1751098	1751103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_013889	TCG	2	6	1751137	1751142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_013889	GAG	3	9	1751178	1751186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_013889	CTG	2	6	1751204	1751209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_013889	AAGA	2	8	1751241	1751248	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_013889	TAA	2	6	1751297	1751302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_013889	GCC	2	6	1751358	1751363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_013889	C	7	7	1751405	1751411	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3527	NC_013889	GTT	2	6	1751441	1751446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_013889	GGA	2	6	1751483	1751488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_013889	GA	3	6	1751605	1751610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_013889	GAA	2	6	1751623	1751628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_013889	T	6	6	1751642	1751647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_013889	TCG	2	6	1751703	1751708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_013889	CCA	2	6	1751758	1751763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_013889	TTTCC	2	10	1751791	1751800	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3535	NC_013889	CGA	2	6	1751806	1751811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_013889	GC	3	6	1752207	1752212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_013889	GCG	2	6	1752224	1752229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_013889	AG	3	6	1758477	1758482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_013889	CG	3	6	1758514	1758519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_013889	AC	3	6	1758532	1758537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_013889	GACC	2	8	1758577	1758584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_013889	G	6	6	1759316	1759321	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_013889	CGC	2	6	1759322	1759327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_013889	AAG	2	6	1759384	1759389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_013889	CTT	2	6	1759401	1759406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_013889	CG	3	6	1760234	1760239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_013889	GAA	2	6	1760264	1760269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_013889	CCT	2	6	1760278	1760283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_013889	CCT	2	6	1760771	1760776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_013889	GAT	2	6	1760819	1760824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013889	CTGCC	2	10	1760826	1760835	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3552	NC_013889	ATC	2	6	1760867	1760872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_013889	AGG	2	6	1760932	1760937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_013889	CGGG	2	8	1761435	1761442	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_013889	C	6	6	1761465	1761470	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3556	NC_013889	TGCA	2	8	1761485	1761492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3557	NC_013889	TCGC	2	8	1761495	1761502	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_013889	GCC	2	6	1761505	1761510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_013889	AC	3	6	1763053	1763058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3560	NC_013889	CTT	2	6	1763060	1763065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_013889	CCG	2	6	1763089	1763094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_013889	GC	3	6	1763177	1763182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_013889	TCC	2	6	1764301	1764306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_013889	CCA	2	6	1764382	1764387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_013889	GAC	2	6	1765016	1765021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_013889	ACC	2	6	1765026	1765031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_013889	CGG	2	6	1765065	1765070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_013889	CGCA	2	8	1765071	1765078	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_013889	CGT	2	6	1765087	1765092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_013889	GGCA	2	8	1765109	1765116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_013889	GCC	2	6	1765141	1765146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_013889	TGC	2	6	1769201	1769206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3574	NC_013889	GCCA	2	8	1769260	1769267	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_013889	T	7	7	1769763	1769769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_013889	ACAG	2	8	1769806	1769813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3577	NC_013889	ACG	2	6	1769833	1769838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_013889	CTT	2	6	1769889	1769894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_013889	CA	3	6	1770337	1770342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_013889	GGCA	2	8	1770366	1770373	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3581	NC_013889	CAT	2	6	1770374	1770379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_013889	CCGG	2	8	1770380	1770387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3583	NC_013889	TGC	2	6	1770403	1770408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_013889	CTTCGT	2	12	1770411	1770422	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_013889	GCC	2	6	1770456	1770461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_013889	CCG	2	6	1770815	1770820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3587	NC_013889	CGG	2	6	1771186	1771191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_013889	CG	3	6	1771243	1771248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3589	NC_013889	CG	4	8	1771276	1771283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_013889	CCG	2	6	1771414	1771419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_013889	GCC	2	6	1771428	1771433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_013889	CCA	2	6	1771784	1771789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3594	NC_013889	TG	3	6	1773288	1773293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_013889	CCA	2	6	1773439	1773444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_013889	CTT	2	6	1773477	1773482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_013889	GGGCAT	2	12	1773503	1773514	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3598	NC_013889	TCA	2	6	1774718	1774723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_013889	CCA	2	6	1774742	1774747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_013889	CAT	2	6	1774762	1774767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_013889	GAG	2	6	1774769	1774774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_013889	CGC	2	6	1775175	1775180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_013889	TGT	2	6	1776517	1776522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_013889	GCCCA	2	10	1776592	1776601	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3605	NC_013889	ACC	2	6	1776617	1776622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_013889	CG	3	6	1778233	1778238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_013889	GGCCCG	2	12	1778243	1778254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_013889	CG	3	6	1778253	1778258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_013889	CA	3	6	1778267	1778272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_013889	GCC	2	6	1778282	1778287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3612	NC_013889	CTGCG	2	10	1778375	1778384	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3613	NC_013889	CGG	2	6	1778408	1778413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3617	NC_013889	A	6	6	1779143	1779148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3621	NC_013889	C	7	7	1779696	1779702	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3622	NC_013889	G	6	6	1779761	1779766	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_013889	GCC	2	6	1781283	1781288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_013889	AGT	2	6	1781346	1781351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3626	NC_013889	GGGC	2	8	1781534	1781541	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3627	NC_013889	CGC	2	6	1781573	1781578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3629	NC_013889	GC	3	6	1782278	1782283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3630	NC_013889	CAA	2	6	1782303	1782308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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