MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio sp. K90mix chromosome

Total Repeats: 5438

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013889	GCG	2	6	1320837	1320842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_013889	ATA	2	6	1320868	1320873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_013889	TAT	2	6	1320876	1320881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_013889	CGT	2	6	1320883	1320888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_013889	CGG	2	6	1321340	1321345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_013889	ACG	2	6	1321354	1321359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_013889	GGCA	2	8	1321407	1321414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2508	NC_013889	GGT	2	6	1321426	1321431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_013889	GTCG	2	8	1321448	1321455	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2510	NC_013889	ATCG	2	8	1321491	1321498	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2511	NC_013889	CGCCT	2	10	1321582	1321591	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2512	NC_013889	GCC	2	6	1321616	1321621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2513	NC_013889	TC	3	6	1322375	1322380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2514	NC_013889	TA	3	6	1322507	1322512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_013889	CTC	2	6	1323973	1323978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2516	NC_013889	AAG	2	6	1323988	1323993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_013889	C	6	6	1324085	1324090	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2518	NC_013889	TCT	2	6	1324091	1324096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_013889	TGC	2	6	1324108	1324113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_013889	AGG	2	6	1324119	1324124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_013889	TCCC	2	8	1325612	1325619	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2522	NC_013889	GC	4	8	1325661	1325668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2523	NC_013889	AACGA	2	10	1331766	1331775	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2524	NC_013889	AG	3	6	1331796	1331801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_013889	GGC	2	6	1332107	1332112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_013889	CG	3	6	1333954	1333959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2527	NC_013889	CGCC	2	8	1334009	1334016	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2528	NC_013889	TCC	2	6	1334018	1334023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2529	NC_013889	CG	3	6	1334094	1334099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2530	NC_013889	CCG	2	6	1338534	1338539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2531	NC_013889	GCG	2	6	1338568	1338573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_013889	CCAC	2	8	1340196	1340203	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2533	NC_013889	GAC	2	6	1344903	1344908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_013889	CTC	2	6	1348259	1348264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2535	NC_013889	TAT	2	6	1348287	1348292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_013889	GCC	2	6	1351902	1351907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2537	NC_013889	GTG	2	6	1351918	1351923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_013889	AAATG	2	10	1351958	1351967	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_013889	CA	3	6	1351993	1351998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2540	NC_013889	GATG	2	8	1352042	1352049	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_013889	CGTGC	2	10	1352130	1352139	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2542	NC_013889	G	7	7	1352165	1352171	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_013889	CCA	2	6	1352185	1352190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2544	NC_013889	GCC	2	6	1352217	1352222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2545	NC_013889	TGA	2	6	1352224	1352229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_013889	GGGC	2	8	1352273	1352280	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2547	NC_013889	CCG	2	6	1352330	1352335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2548	NC_013889	GGA	2	6	1352459	1352464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_013889	GCC	2	6	1352478	1352483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_013889	GGT	2	6	1352508	1352513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_013889	GCG	2	6	1352542	1352547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_013889	GCC	2	6	1352586	1352591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2553	NC_013889	GGC	2	6	1352610	1352615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_013889	CAT	2	6	1352630	1352635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_013889	CGC	2	6	1352666	1352671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2556	NC_013889	TCG	2	6	1352704	1352709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_013889	TGG	2	6	1352726	1352731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_013889	TCGATG	2	12	1352752	1352763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2559	NC_013889	CCG	2	6	1352780	1352785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2560	NC_013889	CTGG	3	12	1354170	1354181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2561	NC_013889	TTCCA	2	10	1354192	1354201	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2562	NC_013889	CGC	2	6	1354210	1354215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2563	NC_013889	C	6	6	1354226	1354231	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2564	NC_013889	CGG	2	6	1354295	1354300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_013889	TCC	2	6	1354424	1354429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2566	NC_013889	CGG	2	6	1354449	1354454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_013889	GCG	2	6	1354518	1354523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_013889	GCG	2	6	1354616	1354621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_013889	CGA	2	6	1354653	1354658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_013889	AG	3	6	1354678	1354683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_013889	GACG	2	8	1354799	1354806	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2572	NC_013889	CGC	2	6	1356921	1356926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2573	NC_013889	CTTGT	2	10	1359459	1359468	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2574	NC_013889	TGCG	2	8	1359470	1359477	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2575	NC_013889	GAAT	2	8	1359491	1359498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_013889	GCA	2	6	1360769	1360774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_013889	CGC	2	6	1360787	1360792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2578	NC_013889	TACCG	2	10	1360807	1360816	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2579	NC_013889	GC	3	6	1360821	1360826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2580	NC_013889	GCCT	2	8	1360902	1360909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2581	NC_013889	TGG	2	6	1363810	1363815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_013889	GCG	2	6	1365964	1365969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_013889	GCC	2	6	1366809	1366814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2584	NC_013889	T	6	6	1366826	1366831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_013889	T	6	6	1368145	1368150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_013889	CGA	2	6	1368238	1368243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2588	NC_013889	CTA	2	6	1378794	1378799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2591	NC_013889	T	6	6	1379380	1379385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_013889	ACG	2	6	1382637	1382642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_013889	CG	3	6	1382697	1382702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2594	NC_013889	GC	3	6	1384879	1384884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2595	NC_013889	GCC	2	6	1384901	1384906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2597	NC_013889	T	6	6	1385069	1385074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_013889	GCC	2	6	1385083	1385088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2599	NC_013889	CA	3	6	1385191	1385196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2600	NC_013889	GCTG	2	8	1385243	1385250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2601	NC_013889	TCC	2	6	1386714	1386719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2602	NC_013889	AAAC	2	8	1386866	1386873	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2603	NC_013889	TCA	2	6	1386948	1386953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_013889	AGT	2	6	1386961	1386966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_013889	T	6	6	1386969	1386974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_013889	CACC	2	8	1386975	1386982	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2607	NC_013889	GC	3	6	1386988	1386993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2608	NC_013889	A	6	6	1389655	1389660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_013889	CAA	2	6	1389668	1389673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_013889	TGG	2	6	1389674	1389679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_013889	CG	3	6	1389702	1389707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2612	NC_013889	TCA	2	6	1391350	1391355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_013889	AC	3	6	1391462	1391467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2614	NC_013889	A	6	6	1391492	1391497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_013889	CTT	2	6	1391523	1391528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_013889	CAAA	2	8	1393441	1393448	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2617	NC_013889	AGCC	2	8	1393538	1393545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2618	NC_013889	GCC	2	6	1393882	1393887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2621	NC_013889	CTT	2	6	1393965	1393970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_013889	TGA	2	6	1400840	1400845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2624	NC_013889	GGC	3	9	1400872	1400880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_013889	CG	3	6	1400884	1400889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2627	NC_013889	CG	3	6	1405230	1405235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2628	NC_013889	CCG	2	6	1405298	1405303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2629	NC_013889	CGCA	2	8	1410015	1410022	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2630	NC_013889	CCA	2	6	1410062	1410067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2631	NC_013889	GAG	2	6	1410069	1410074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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