MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 2

Total Repeats: 2450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013526	GTG	2	6	519996	520001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_013526	TATG	2	8	520060	520067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_013526	ATG	2	6	520074	520079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_013526	TCC	2	6	525416	525421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_013526	GTC	2	6	525437	525442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_013526	CAG	2	6	527622	527627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_013526	TGG	2	6	527650	527655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_013526	AGG	2	6	527749	527754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_013526	GCT	2	6	528479	528484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_013526	TA	3	6	528491	528496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_013526	CAT	2	6	528501	528506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_013526	TCT	2	6	530174	530179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_013526	TGT	2	6	531119	531124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_013526	GGGA	2	8	531134	531141	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_013526	TC	3	6	531976	531981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_013526	AGC	2	6	534071	534076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_013526	AGC	2	6	535151	535156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_013526	CGTA	2	8	535809	535816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_013526	C	6	6	535839	535844	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1020	NC_013526	TC	3	6	535860	535865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_013526	GCAGG	2	10	535898	535907	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1022	NC_013526	AGT	2	6	536014	536019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_013526	TGCT	2	8	536761	536768	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_013526	CAG	2	6	536789	536794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_013526	TGA	2	6	538031	538036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_013526	CT	3	6	538072	538077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_013526	GC	3	6	538139	538144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_013526	CTT	2	6	538209	538214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_013526	GATA	2	8	538576	538583	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_013526	ACA	2	6	538595	538600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_013526	GTT	2	6	538605	538610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_013526	GCGA	2	8	538654	538661	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_013526	TTG	2	6	538705	538710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_013526	CCT	2	6	540122	540127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_013526	TGC	2	6	540173	540178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_013526	AGC	2	6	540204	540209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_013526	CAG	2	6	540210	540215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_013526	TCA	2	6	540227	540232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_013526	AT	3	6	540347	540352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_013526	GT	3	6	540432	540437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_013526	GGCA	2	8	540461	540468	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_013526	TGC	2	6	540490	540495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_013526	TGG	2	6	540520	540525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_013526	TGG	3	9	540535	540543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_013526	GGA	2	6	540592	540597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_013526	GCT	2	6	540617	540622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_013526	TGA	2	6	540679	540684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_013526	GCA	2	6	540755	540760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_013526	CCA	2	6	540765	540770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_013526	CA	3	6	540778	540783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_013526	CCT	2	6	541280	541285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_013526	TACAA	2	10	541286	541295	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1053	NC_013526	GATAT	2	10	541299	541308	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_013526	TG	4	8	541323	541330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_013526	TGC	2	6	541416	541421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_013526	CGA	2	6	541423	541428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_013526	C	6	6	541441	541446	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1058	NC_013526	AG	3	6	541456	541461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_013526	CCT	2	6	542976	542981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_013526	AT	3	6	543032	543037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_013526	AGG	2	6	543050	543055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_013526	TCCG	2	8	545319	545326	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_013526	ATC	2	6	545442	545447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_013526	TGG	2	6	545450	545455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_013526	GGC	2	6	545730	545735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_013526	CCT	2	6	546916	546921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_013526	TTG	2	6	546929	546934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013526	AT	3	6	546985	546990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_013526	TTA	2	6	547005	547010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_013526	CGA	2	6	547092	547097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_013526	GAA	2	6	547109	547114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_013526	AGG	2	6	547124	547129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_013526	CGA	2	6	547146	547151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_013526	GCA	2	6	547165	547170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_013526	TGGC	2	8	547178	547185	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_013526	ATC	2	6	547187	547192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_013526	GCA	2	6	547235	547240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_013526	TCC	2	6	547250	547255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_013526	TGC	2	6	547257	547262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_013526	CAT	2	6	547281	547286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_013526	CAT	2	6	547289	547294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_013526	AGG	2	6	547333	547338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_013526	CCT	2	6	547358	547363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_013526	GTGAT	2	10	547418	547427	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013526	TGC	2	6	547459	547464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_013526	TGT	2	6	547465	547470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_013526	GGC	2	6	547492	547497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_013526	GAG	2	6	547513	547518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_013526	GGC	2	6	547639	547644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_013526	GGAGTA	2	12	547680	547691	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_013526	TCC	3	9	550533	550541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_013526	CAG	2	6	550555	550560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_013526	CCA	2	6	550679	550684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_013526	GCA	2	6	550694	550699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_013526	TGG	2	6	550721	550726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_013526	CCA	2	6	550735	550740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_013526	TAA	2	6	551927	551932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_013526	TCCT	2	8	551967	551974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_013526	GCC	2	6	552000	552005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_013526	GTG	2	6	552095	552100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_013526	GGT	2	6	552108	552113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_013526	GCT	2	6	552140	552145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_013526	GTA	2	6	552378	552383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_013526	C	6	6	552389	552394	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1105	NC_013526	TGCT	2	8	553277	553284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_013526	ATATT	2	10	553293	553302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_013526	CAT	2	6	553334	553339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_013526	TGC	2	6	553366	553371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_013526	TCCT	2	8	557667	557674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_013526	TTG	2	6	557792	557797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013526	TAT	2	6	557798	557803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013526	GCAA	2	8	557810	557817	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_013526	CAA	2	6	558574	558579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_013526	ATA	2	6	558615	558620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_013526	CTT	2	6	558636	558641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_013526	TTG	2	6	558661	558666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_013526	AGG	2	6	558677	558682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_013526	CACG	2	8	558872	558879	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_013526	TCC	2	6	559035	559040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_013526	TGGCT	2	10	559080	559089	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1121	NC_013526	GTT	2	6	559097	559102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_013526	AGGA	2	8	559146	559153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013526	TCTCC	2	10	562647	562656	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1124	NC_013526	AG	3	6	563946	563951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013526	CCCT	2	8	564947	564954	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1126	NC_013526	GAG	3	9	565018	565026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_013526	CTC	2	6	566995	567000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_013526	GTC	2	6	567015	567020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_013526	CTG	2	6	567059	567064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_013526	CG	3	6	567093	567098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_013526	GGT	2	6	567107	567112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_013526	CGG	2	6	567137	567142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_013526	TGA	2	6	567265	567270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_013526	CGT	2	6	567275	567280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_013526	TGG	2	6	567409	567414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_013526	ACG	2	6	567444	567449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_013526	CTC	2	6	567752	567757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1138	NC_013526	TGC	2	6	568294	568299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_013526	CAC	2	6	568352	568357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1142	NC_013526	ATA	2	6	568422	568427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1144	NC_013526	GGTG	2	8	570907	570914	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_013526	CTGG	2	8	572731	572738	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1148	NC_013526	GTTG	2	8	581557	581564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_013526	GGC	2	6	581608	581613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1150	NC_013526	GCAA	2	8	582765	582772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1151	NC_013526	GC	3	6	582777	582782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1152	NC_013526	CCT	2	6	582799	582804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1153	NC_013526	CTG	2	6	582835	582840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1156	NC_013526	AACCG	2	10	582882	582891	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1157	NC_013526	GGT	2	6	582920	582925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1161	NC_013526	CG	3	6	583112	583117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1162	NC_013526	TGA	2	6	583138	583143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1165	NC_013526	CTC	2	6	583244	583249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1166	NC_013526	CT	3	6	583256	583261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1171	NC_013526	CCG	2	6	583478	583483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1172	NC_013526	CGG	2	6	583514	583519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1173	NC_013526	CG	3	6	583549	583554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1250	NC_013526	GCT	2	6	631373	631378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1253	NC_013526	GCA	2	6	631525	631530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1255	NC_013526	G	6	6	631545	631550	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_013526	AGG	2	6	632586	632591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_013526	AG	3	6	632602	632607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_013526	AGGT	2	8	632619	632626	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_013526	CTC	2	6	632664	632669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1260	NC_013526	GGA	2	6	632674	632679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1261	NC_013526	GC	3	6	632709	632714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1262	NC_013526	TG	3	6	632752	632757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_013526	CCGC	2	8	632769	632776	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1264	NC_013526	GCCA	2	8	632864	632871	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1265	NC_013526	CGG	2	6	633091	633096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1266	NC_013526	CCG	2	6	633117	633122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1267	NC_013526	GTG	2	6	633191	633196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1269	NC_013526	GGC	2	6	633288	633293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1478	NC_013526	AG	3	6	741726	741731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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