MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 2

Total Repeats: 2450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013526	CTC	2	6	239598	239603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_013526	GCC	2	6	239632	239637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_013526	AGC	2	6	239638	239643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_013526	TCC	2	6	239669	239674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_013526	CGAT	2	8	239700	239707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_013526	AGCA	2	8	239708	239715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
507	NC_013526	TA	3	6	239722	239727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013526	TA	3	6	239732	239737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013526	AAT	2	6	240323	240328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013526	ATAA	2	8	240345	240352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013526	CCT	2	6	247361	247366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_013526	GCG	2	6	247512	247517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_013526	AT	4	8	247521	247528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013526	GT	3	6	247557	247562	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013526	CG	3	6	249942	249947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_013526	CTG	2	6	250122	250127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_013526	GCG	2	6	250134	250139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_013526	CGG	2	6	250175	250180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_013526	CAG	2	6	250313	250318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_013526	AGCT	2	8	252000	252007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
521	NC_013526	GGC	2	6	253029	253034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_013526	GGT	2	6	253036	253041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013526	GGC	2	6	253045	253050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_013526	CCAGCC	2	12	253094	253105	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_013526	GGCTGG	2	12	253116	253127	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
526	NC_013526	CGC	2	6	253159	253164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_013526	GCTC	2	8	256894	256901	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
528	NC_013526	CCT	2	6	257683	257688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_013526	TCCC	2	8	259702	259709	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
530	NC_013526	AGGG	2	8	259849	259856	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
531	NC_013526	ACCC	2	8	267255	267262	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
532	NC_013526	CGAT	2	8	267330	267337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
533	NC_013526	CCG	2	6	267385	267390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_013526	CG	3	6	267406	267411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_013526	GCCA	2	8	267483	267490	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
536	NC_013526	GC	3	6	267530	267535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_013526	G	6	6	267581	267586	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013526	TATGCC	2	12	267587	267598	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_013526	CCG	2	6	267619	267624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_013526	CCG	2	6	267630	267635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_013526	CCGC	3	12	267656	267667	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
542	NC_013526	CAG	2	6	267701	267706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_013526	TG	3	6	267741	267746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013526	TCGA	2	8	267759	267766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
545	NC_013526	CTAC	2	8	267793	267800	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_013526	CTG	2	6	267858	267863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_013526	CAG	2	6	267881	267886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_013526	GTA	2	6	267920	267925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013526	TCC	2	6	267951	267956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_013526	CAG	2	6	268064	268069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_013526	CCTA	2	8	268133	268140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_013526	GA	3	6	268176	268181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013526	CCA	2	6	268195	268200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_013526	CTGTG	2	10	268202	268211	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
555	NC_013526	CAG	2	6	268307	268312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_013526	CAC	2	6	268364	268369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_013526	AC	3	6	268375	268380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_013526	C	6	6	268425	268430	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
559	NC_013526	GGA	2	6	268502	268507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013526	G	6	6	268571	268576	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013526	CT	3	6	268651	268656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_013526	CAG	2	6	268697	268702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_013526	ATC	2	6	268728	268733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_013526	GCA	2	6	268789	268794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_013526	TCC	2	6	270419	270424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_013526	TG	3	6	270427	270432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_013526	CCT	2	6	270689	270694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_013526	CAT	2	6	270699	270704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_013526	AGC	2	6	270753	270758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_013526	GAGT	2	8	270764	270771	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013526	GGT	2	6	270777	270782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013526	CGG	2	6	270813	270818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_013526	TGGC	2	8	270884	270891	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
574	NC_013526	TCC	2	6	273922	273927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_013526	GTG	2	6	273930	273935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013526	TCT	2	6	274922	274927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_013526	TC	3	6	277927	277932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
578	NC_013526	TCCT	2	8	279359	279366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_013526	TCT	2	6	279388	279393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_013526	CCT	2	6	283394	283399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_013526	AGA	2	6	283401	283406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_013526	TA	3	6	284242	284247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_013526	AATC	2	8	284291	284298	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_013526	GCT	2	6	284323	284328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_013526	ACA	2	6	284363	284368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_013526	AGG	2	6	284369	284374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013526	G	6	6	284799	284804	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013526	TTTAT	2	10	284862	284871	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013526	AT	3	6	284883	284888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_013526	AACT	2	8	288464	288471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
591	NC_013526	CTAT	2	8	288472	288479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
592	NC_013526	GCC	2	6	291306	291311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_013526	TAGT	2	8	291389	291396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_013526	CAG	2	6	291402	291407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_013526	TGG	2	6	291426	291431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_013526	ATG	2	6	291482	291487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013526	CTT	2	6	291516	291521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_013526	GCAG	2	8	291536	291543	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
599	NC_013526	GCT	2	6	291557	291562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_013526	TGT	2	6	291603	291608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013526	AT	3	6	291610	291615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013526	CCT	2	6	296409	296414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_013526	CCGT	2	8	296445	296452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
604	NC_013526	CCT	2	6	298071	298076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_013526	GGT	2	6	298137	298142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013526	CGC	2	6	298191	298196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_013526	CCACCC	2	12	298197	298208	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
608	NC_013526	GGT	2	6	298214	298219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013526	AGT	2	6	298236	298241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013526	AAG	2	6	298255	298260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013526	AGGT	2	8	298291	298298	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013526	AGG	2	6	301792	301797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013526	AGT	2	6	302131	302136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013526	AGG	2	6	302735	302740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013526	AGCAC	2	10	302832	302841	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
616	NC_013526	GAC	2	6	302886	302891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_013526	GTC	2	6	302908	302913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_013526	TC	3	6	302930	302935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_013526	ATCG	2	8	302987	302994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
620	NC_013526	GTGC	2	8	303041	303048	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
621	NC_013526	TCCA	2	8	303105	303112	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_013526	TCC	2	6	306122	306127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_013526	ATC	2	6	306169	306174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_013526	CTC	2	6	306458	306463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_013526	GTGC	2	8	306472	306479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
626	NC_013526	TGC	2	6	306483	306488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_013526	CAG	2	6	306528	306533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013526	GGA	2	6	306596	306601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_013526	CCT	2	6	308160	308165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_013526	CCTA	2	8	308245	308252	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
631	NC_013526	CTT	2	6	309458	309463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_013526	AGC	2	6	309491	309496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_013526	ACG	2	6	310927	310932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_013526	GA	3	6	310958	310963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_013526	GC	3	6	310987	310992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
636	NC_013526	ACT	2	6	311020	311025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_013526	CGTG	2	8	311060	311067	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
638	NC_013526	CAA	2	6	311077	311082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_013526	G	7	7	311112	311118	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_013526	GC	3	6	312338	312343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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644	NC_013526	CCT	2	6	315042	315047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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646	NC_013526	CG	4	8	315205	315212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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773	NC_013526	CG	3	6	377787	377792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
774	NC_013526	TGA	2	6	377798	377803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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