MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 1

Total Repeats: 443

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013525	AGCA	2	8	2269	2276	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013525	GTAC	2	8	14762	14769	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013525	AGGT	2	8	16218	16225	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013525	GAGG	2	8	16230	16237	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013525	ATTA	2	8	18752	18759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013525	AGCT	2	8	32216	32223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013525	CATA	2	8	42199	42206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013525	CCTG	2	8	49044	49051	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013525	AAGG	2	8	52789	52796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013525	AGGA	2	8	57299	57306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013525	ATCT	2	8	70789	70796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013525	GGAG	2	8	80888	80895	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013525	CAAA	2	8	99831	99838	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013525	GAGC	2	8	100130	100137	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013525	TGGG	2	8	103398	103405	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013525	CCTA	2	8	109821	109828	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013525	GTTT	2	8	113809	113816	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013525	GCTA	2	8	122537	122544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013525	GAGC	2	8	122654	122661	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013525	GTGG	2	8	122906	122913	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013525	AATC	2	8	124862	124869	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013525	TGCC	2	8	134127	134134	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013525	CATC	2	8	138578	138585	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013525	AAGT	2	8	138601	138608	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013525	AGGA	2	8	141529	141536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013525	AGAA	2	8	147802	147809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013525	TACA	2	8	152886	152893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013525	TGGG	2	8	164955	164962	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013525	CCAA	2	8	169639	169646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013525	GAAA	2	8	175535	175542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013525	GATT	2	8	177135	177142	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013525	GCTA	2	8	186198	186205	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013525	TCCA	2	8	187827	187834	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013525	CTAA	2	8	188082	188089	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013525	AAGG	2	8	188174	188181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013525	CCAA	2	8	196931	196938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013525	AAAC	2	8	198956	198963	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013525	TCCA	2	8	213426	213433	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013525	CTAC	2	8	222253	222260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013525	AATA	2	8	237611	237618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013525	TTTG	2	8	244603	244610	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013525	AGCT	2	8	249988	249995	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013525	GATC	2	8	280911	280918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013525	AAAG	2	8	280944	280951	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013525	CCTT	2	8	286295	286302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013525	ATTG	2	8	290147	290154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013525	GTAC	2	8	293146	293153	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013525	TTTC	2	8	293165	293172	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013525	GAGG	2	8	312481	312488	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013525	AATA	2	8	314315	314322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013525	TTTC	2	8	314328	314335	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013525	GCTT	2	8	316471	316478	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013525	CTTT	2	8	318655	318662	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013525	AAAG	2	8	320179	320186	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013525	GCGG	2	8	326593	326600	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013525	TGGT	2	8	336749	336756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013525	TGGC	2	8	360651	360658	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013525	CCTA	2	8	364847	364854	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013525	TAAA	2	8	368767	368774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013525	CTCC	2	8	370466	370473	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_013525	CTAT	2	8	370555	370562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013525	GGAA	2	8	372808	372815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013525	GATT	2	8	372831	372838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013525	TAGG	2	8	373213	373220	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013525	CTTA	2	8	373906	373913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013525	AAGA	2	8	405376	405383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013525	AGGG	2	8	405893	405900	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013525	AGCT	2	8	408864	408871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013525	ATAG	2	8	411446	411453	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013525	TGAT	2	8	411515	411522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013525	CGGA	2	8	425767	425774	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013525	TTAT	2	8	433694	433701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013525	ATCT	2	8	445582	445589	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013525	CTGT	2	8	445616	445623	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013525	CCGA	2	8	445892	445899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013525	CGGT	2	8	445922	445929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013525	TACA	2	8	446238	446245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013525	ATCG	2	8	446598	446605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013525	CGAT	2	8	446707	446714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013525	TATC	2	8	446999	447006	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013525	CCTA	2	8	458205	458212	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013525	AGTA	3	12	461008	461019	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013525	CCCT	2	8	468860	468867	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_013525	CTAA	2	8	475053	475060	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013525	CTAA	2	8	476188	476195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013525	ATGA	2	8	476198	476205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013525	CAGA	2	8	476215	476222	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013525	TAAA	2	8	476362	476369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013525	GTAC	2	8	477506	477513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013525	GGTA	2	8	484597	484604	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013525	CTTT	2	8	491009	491016	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013525	GCTA	2	8	491386	491393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013525	AAGA	2	8	491547	491554	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013525	TTTC	2	8	491609	491616	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013525	AGAC	2	8	491638	491645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013525	AAGT	2	8	499604	499611	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013525	GTCT	2	8	504323	504330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013525	TAAG	2	8	504490	504497	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013525	TATC	2	8	517300	517307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013525	AGGC	2	8	518487	518494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013525	CAAG	2	8	518498	518505	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013525	CCTC	2	8	530065	530072	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_013525	TAGA	2	8	530112	530119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013525	GCTG	2	8	533476	533483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013525	TTTA	2	8	536623	536630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013525	CTCC	2	8	536634	536641	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_013525	ATTA	2	8	536727	536734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013525	TGGA	2	8	536745	536752	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013525	TCCT	2	8	536873	536880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013525	ATCC	2	8	538486	538493	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013525	ACGT	2	8	538542	538549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013525	TACC	2	8	539538	539545	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013525	AATT	2	8	539767	539774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013525	ATAA	2	8	540163	540170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013525	TCAG	2	8	540214	540221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013525	TATT	2	8	543047	543054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013525	CAGG	2	8	553008	553015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013525	CCTG	2	8	553033	553040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013525	TGAG	2	8	555393	555400	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013525	CTTT	2	8	555510	555517	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013525	CTTT	2	8	567590	567597	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013525	TTTG	2	8	567627	567634	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013525	GGCA	2	8	569572	569579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013525	GTAT	2	8	569603	569610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013525	TTGG	2	8	570762	570769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013525	ATGC	2	8	574154	574161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013525	GAGG	2	8	578471	578478	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013525	GGGA	2	8	578811	578818	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013525	CACC	2	8	578901	578908	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_013525	CATG	2	8	579763	579770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013525	TGCC	2	8	579862	579869	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013525	GGAG	2	8	579977	579984	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013525	CCAT	2	8	581149	581156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013525	CACC	2	8	582367	582374	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
135	NC_013525	GCCA	2	8	583020	583027	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013525	CCCT	2	8	583200	583207	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_013525	CTGA	2	8	584029	584036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013525	CCCG	2	8	584749	584756	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_013525	GCGG	2	8	584799	584806	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013525	TCCC	2	8	585249	585256	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_013525	GCCG	2	8	598148	598155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013525	CAGA	2	8	602434	602441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013525	GCCG	2	8	602480	602487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013525	TATC	2	8	603842	603849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013525	ATCC	2	8	607932	607939	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013525	AACC	2	8	614057	614064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013525	TGTT	2	8	618101	618108	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013525	TTTA	2	8	619011	619018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013525	CGAT	2	8	620126	620133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_013525	AGGA	2	8	624605	624612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_013525	CTAC	2	8	2017269	2017276	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
440	NC_013525	TACA	2	8	2018716	2018723	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
441	NC_013525	TAGT	2	8	2018979	2018986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
442	NC_013525	GAAA	2	8	2018987	2018994	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
443	NC_013525	AGAA	2	8	2019005	2019012	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.