MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 1

Total Repeats: 3292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_013525	ATC	2	6	1244971	1244976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_013525	ATA	2	6	1245122	1245127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_013525	TCA	2	6	1245136	1245141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_013525	CAG	2	6	1245215	1245220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_013525	TGTAG	2	10	1245287	1245296	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_013525	GGAG	2	8	1245348	1245355	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_013525	CTC	2	6	1245408	1245413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2008	NC_013525	AGCT	2	8	1245536	1245543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2009	NC_013525	TCT	2	6	1245597	1245602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_013525	GAT	2	6	1245620	1245625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_013525	CGA	2	6	1245637	1245642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2012	NC_013525	TGG	2	6	1245723	1245728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2013	NC_013525	CCT	2	6	1245765	1245770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2014	NC_013525	GCGG	2	8	1245779	1245786	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2015	NC_013525	AGG	2	6	1245825	1245830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_013525	CGCC	2	8	1245986	1245993	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2017	NC_013525	CTT	2	6	1246029	1246034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_013525	CGC	2	6	1246257	1246262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2019	NC_013525	AGA	2	6	1246265	1246270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_013525	ATGGT	2	10	1246279	1246288	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_013525	TC	3	6	1246336	1246341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2043	NC_013525	ACC	2	6	1247630	1247635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2044	NC_013525	GATGC	2	10	1247699	1247708	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2065	NC_013525	TCC	2	6	1249322	1249327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2093	NC_013525	TGG	2	6	1250404	1250409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2129	NC_013525	CCAG	2	8	1251498	1251505	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2130	NC_013525	CAG	2	6	1251565	1251570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2131	NC_013525	CAG	2	6	1251577	1251582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2132	NC_013525	GAG	2	6	1251628	1251633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_013525	CAGG	2	8	1251648	1251655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2134	NC_013525	ACC	2	6	1251710	1251715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2135	NC_013525	GCA	2	6	1251744	1251749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2136	NC_013525	ACT	2	6	1251798	1251803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2137	NC_013525	CCT	2	6	1251804	1251809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2138	NC_013525	CTCCC	2	10	1251859	1251868	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2139	NC_013525	CTC	2	6	1251880	1251885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2140	NC_013525	CTC	2	6	1251895	1251900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2141	NC_013525	CAC	2	6	1251901	1251906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2142	NC_013525	CCCA	2	8	1251912	1251919	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2143	NC_013525	TCC	2	6	1251980	1251985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2144	NC_013525	CCAGCA	2	12	1252058	1252069	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2145	NC_013525	GCAT	2	8	1252082	1252089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2146	NC_013525	CT	3	6	1252146	1252151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2147	NC_013525	C	6	6	1252204	1252209	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2148	NC_013525	CT	3	6	1252231	1252236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2149	NC_013525	CTC	2	6	1252326	1252331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2150	NC_013525	TGG	2	6	1252391	1252396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2151	NC_013525	CAG	3	9	1252410	1252418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2152	NC_013525	TGA	2	6	1252421	1252426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2153	NC_013525	TGG	2	6	1252427	1252432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2154	NC_013525	CCA	2	6	1252454	1252459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2155	NC_013525	AC	3	6	1252493	1252498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2156	NC_013525	CCTG	2	8	1252556	1252563	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2157	NC_013525	GCA	2	6	1252714	1252719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2158	NC_013525	ATC	2	6	1252813	1252818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2159	NC_013525	GCA	2	6	1252904	1252909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2160	NC_013525	CCT	2	6	1252915	1252920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2161	NC_013525	GCA	2	6	1253000	1253005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2162	NC_013525	CCT	2	6	1253049	1253054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2163	NC_013525	CAG	3	9	1253079	1253087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2164	NC_013525	CCA	2	6	1253168	1253173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2165	NC_013525	CG	3	6	1253211	1253216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2166	NC_013525	GTC	2	6	1253220	1253225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2170	NC_013525	GCC	2	6	1253509	1253514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2171	NC_013525	CAG	3	9	1253520	1253528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2173	NC_013525	CCA	2	6	1253543	1253548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2174	NC_013525	CTG	2	6	1253669	1253674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2176	NC_013525	CCT	2	6	1253949	1253954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2179	NC_013525	GGCT	2	8	1256868	1256875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2182	NC_013525	CAC	2	6	1256946	1256951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2200	NC_013525	TAT	2	6	1257823	1257828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2203	NC_013525	CTG	2	6	1260136	1260141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2208	NC_013525	CA	3	6	1260406	1260411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2209	NC_013525	AGT	2	6	1260523	1260528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2215	NC_013525	CTC	2	6	1260875	1260880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2218	NC_013525	AGCA	2	8	1260965	1260972	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2219	NC_013525	T	6	6	1265022	1265027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2220	NC_013525	TC	4	8	1268756	1268763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2221	NC_013525	TTTG	2	8	1268784	1268791	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2222	NC_013525	T	6	6	1268798	1268803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2223	NC_013525	GTA	2	6	1268859	1268864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2226	NC_013525	CCT	2	6	1273174	1273179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2227	NC_013525	AAC	2	6	1273180	1273185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2228	NC_013525	AT	3	6	1273198	1273203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2229	NC_013525	AGG	2	6	1275786	1275791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2230	NC_013525	CCT	2	6	1275817	1275822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2231	NC_013525	GAT	2	6	1275824	1275829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2232	NC_013525	TAG	2	6	1275836	1275841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2233	NC_013525	ATA	2	6	1277910	1277915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2235	NC_013525	TAA	2	6	1283908	1283913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2236	NC_013525	ATA	2	6	1283935	1283940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2237	NC_013525	TAC	2	6	1287582	1287587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2238	NC_013525	CCT	2	6	1288849	1288854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2239	NC_013525	CTTA	2	8	1288888	1288895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2240	NC_013525	AT	3	6	1288972	1288977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2241	NC_013525	AG	3	6	1288992	1288997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2242	NC_013525	GGAG	2	8	1289000	1289007	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2243	NC_013525	AG	3	6	1289145	1289150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2244	NC_013525	TCTTTG	2	12	1294633	1294644	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2245	NC_013525	GAT	2	6	1294677	1294682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2246	NC_013525	TA	3	6	1294700	1294705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2247	NC_013525	GCA	2	6	1294707	1294712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2248	NC_013525	GTA	2	6	1297024	1297029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2249	NC_013525	GAG	2	6	1297058	1297063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2250	NC_013525	AGA	2	6	1301452	1301457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2251	NC_013525	GAG	2	6	1301514	1301519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2252	NC_013525	CAG	2	6	1302432	1302437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2253	NC_013525	TCC	2	6	1303607	1303612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2254	NC_013525	TAA	2	6	1303613	1303618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2255	NC_013525	AAG	2	6	1303659	1303664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2256	NC_013525	TAA	2	6	1303686	1303691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2257	NC_013525	CCT	2	6	1305612	1305617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2258	NC_013525	TA	3	6	1305620	1305625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2259	NC_013525	AGA	2	6	1305641	1305646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2382	NC_013525	CCA	2	6	1413777	1413782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2387	NC_013525	TCC	2	6	1417738	1417743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2390	NC_013525	GATTT	2	10	1421089	1421098	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2391	NC_013525	CAA	2	6	1421106	1421111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2392	NC_013525	ATGGT	2	10	1422264	1422273	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2393	NC_013525	TCT	2	6	1422285	1422290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2394	NC_013525	ACTAT	2	10	1423290	1423299	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2395	NC_013525	TCT	2	6	1423345	1423350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2396	NC_013525	TTA	2	6	1423406	1423411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2397	NC_013525	TAA	2	6	1423943	1423948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2398	NC_013525	ATCT	2	8	1424033	1424040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2399	NC_013525	TGA	2	6	1424067	1424072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2400	NC_013525	CTT	3	9	1424086	1424094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2403	NC_013525	TAT	2	6	1425144	1425149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2404	NC_013525	AGT	2	6	1425179	1425184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2407	NC_013525	GTA	2	6	1425431	1425436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2415	NC_013525	ACT	2	6	1425791	1425796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2425	NC_013525	CAT	2	6	1430259	1430264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2428	NC_013525	TAT	3	9	1433134	1433142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2431	NC_013525	AC	3	6	1435864	1435869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2432	NC_013525	GAG	2	6	1436316	1436321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2438	NC_013525	AAGG	2	8	1442170	1442177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2450	NC_013525	CCTT	2	8	1446957	1446964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2451	NC_013525	GGT	2	6	1446966	1446971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2452	NC_013525	CA	3	6	1447027	1447032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2453	NC_013525	TGAG	2	8	1447074	1447081	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2454	NC_013525	CCA	2	6	1450883	1450888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2456	NC_013525	TAGG	2	8	1456159	1456166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2477	NC_013525	GAT	2	6	1497328	1497333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2481	NC_013525	AAGTA	2	10	1504171	1504180	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2482	NC_013525	AT	3	6	1504188	1504193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2483	NC_013525	CTG	2	6	1506239	1506244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2486	NC_013525	ATTAG	2	10	1509230	1509239	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2487	NC_013525	GA	3	6	1509261	1509266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2488	NC_013525	TC	3	6	1509274	1509279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2489	NC_013525	A	6	6	1509313	1509318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2490	NC_013525	AGGA	2	8	1509470	1509477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2491	NC_013525	TCT	2	6	1515259	1515264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2492	NC_013525	AT	3	6	1515362	1515367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2493	NC_013525	ACC	2	6	1517632	1517637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2494	NC_013525	TCA	2	6	1517858	1517863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2495	NC_013525	ATAG	2	8	1517910	1517917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2496	NC_013525	TTG	2	6	1518013	1518018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2497	NC_013525	C	6	6	1518044	1518049	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2498	NC_013525	GTA	2	6	1518067	1518072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2499	NC_013525	GCT	2	6	1518123	1518128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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