MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013522	TC	3	6	6356	6361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013522	TA	3	6	6766	6771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013522	AT	4	8	8479	8486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013522	AG	3	6	21548	21553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013522	GA	3	6	35555	35560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013522	CT	3	6	35574	35579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013522	TC	3	6	43922	43927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013522	GC	3	6	81510	81515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013522	GC	3	6	81538	81543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013522	GA	3	6	115493	115498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013522	AG	3	6	116275	116280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013522	TA	3	6	119736	119741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013522	GA	3	6	124613	124618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013522	TC	3	6	124810	124815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013522	AT	3	6	126546	126551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013522	AT	3	6	126580	126585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013522	AG	4	8	129335	129342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013522	CT	3	6	140226	140231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013522	CG	3	6	162560	162565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013522	TA	3	6	164629	164634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013522	AG	3	6	173234	173239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013522	GA	3	6	193159	193164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013522	AT	3	6	215354	215359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013522	AT	3	6	216581	216586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013522	CT	3	6	219862	219867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013522	TA	3	6	223179	223184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013522	GA	3	6	229068	229073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013522	AG	3	6	229077	229082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013522	GA	3	6	238618	238623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013522	AT	3	6	239946	239951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013522	TC	4	8	260347	260354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013522	CG	3	6	269038	269043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013522	CT	3	6	276450	276455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013522	GC	3	6	276571	276576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013522	CT	3	6	310119	310124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013522	GA	3	6	315381	315386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013522	TG	3	6	321360	321365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013522	CA	3	6	322034	322039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013522	GA	3	6	324923	324928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013522	TG	3	6	326788	326793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013522	AT	3	6	329642	329647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013522	AT	3	6	341266	341271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013522	AT	3	6	349714	349719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013522	GA	3	6	387402	387407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013522	CT	3	6	393130	393135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013522	AT	3	6	395167	395172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013522	AT	3	6	398786	398791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013522	AT	3	6	403987	403992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013522	TA	3	6	410473	410478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013522	CA	3	6	411444	411449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013522	GA	3	6	412168	412173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013522	AT	3	6	423701	423706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013522	TC	3	6	436863	436868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013522	GA	3	6	441677	441682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013522	GA	3	6	453651	453656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013522	AT	3	6	467187	467192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013522	TC	3	6	471162	471167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013522	AG	3	6	474895	474900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013522	AT	3	6	486153	486158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013522	CT	3	6	496861	496866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013522	AT	3	6	498526	498531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013522	AT	3	6	530518	530523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013522	GT	3	6	582885	582890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013522	TA	3	6	595298	595303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013522	TC	3	6	596797	596802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013522	GA	3	6	608461	608466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013522	CT	3	6	616260	616265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013522	GT	3	6	616401	616406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013522	GC	3	6	617484	617489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013522	TA	3	6	618246	618251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013522	TG	3	6	618421	618426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013522	TG	3	6	618437	618442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013522	GT	3	6	642972	642977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013522	CT	3	6	648885	648890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013522	TA	3	6	656074	656079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013522	AT	3	6	665995	666000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013522	TC	3	6	669381	669386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013522	TG	3	6	695426	695431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013522	GT	3	6	695510	695515	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013522	TC	3	6	697751	697756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013522	GA	3	6	726513	726518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013522	AG	3	6	744912	744917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013522	AT	4	8	745951	745958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013522	TA	3	6	746013	746018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013522	AT	3	6	746145	746150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013522	AC	3	6	746651	746656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013522	AT	3	6	746846	746851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013522	TA	3	6	750511	750516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013522	TC	3	6	750864	750869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013522	CT	3	6	755420	755425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013522	AT	3	6	767886	767891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013522	TA	3	6	769770	769775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013522	GT	3	6	771594	771599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013522	TA	3	6	773130	773135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013522	TG	3	6	806995	807000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013522	AG	3	6	825594	825599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013522	CT	3	6	829147	829152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013522	GA	3	6	829978	829983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013522	TC	3	6	834890	834895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_013522	AT	3	6	834909	834914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013522	GC	3	6	836223	836228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013522	GC	3	6	879603	879608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013522	GC	3	6	879789	879794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013522	AT	3	6	880000	880005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013522	AT	3	6	891001	891006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013522	AT	3	6	895942	895947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013522	AT	3	6	901658	901663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013522	GA	3	6	931209	931214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013522	AT	3	6	934383	934388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013522	TC	3	6	939465	939470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013522	CT	3	6	950486	950491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013522	GA	3	6	952461	952466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013522	GA	3	6	952901	952906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013522	CT	3	6	1002528	1002533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013522	AT	3	6	1002795	1002800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013522	AT	3	6	1003270	1003275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013522	TA	3	6	1003327	1003332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013522	AT	3	6	1003532	1003537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013522	TA	3	6	1004003	1004008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013522	TC	3	6	1004390	1004395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013522	TA	3	6	1004776	1004781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013522	TC	3	6	1005029	1005034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013522	TA	3	6	1007827	1007832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013522	CT	4	8	1007880	1007887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013522	TA	3	6	1007922	1007927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013522	TA	3	6	1012818	1012823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013522	TA	3	6	1024676	1024681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013522	TC	3	6	1041217	1041222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013522	CG	3	6	1096682	1096687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013522	TA	3	6	1101351	1101356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013522	CG	3	6	1102273	1102278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013522	CA	3	6	1103972	1103977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013522	CG	3	6	1104023	1104028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013522	CG	3	6	1104343	1104348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013522	CA	3	6	1104862	1104867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013522	GT	3	6	1105035	1105040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013522	GT	3	6	1105205	1105210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013522	CA	3	6	1105976	1105981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013522	TC	3	6	1113388	1113393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013522	GC	3	6	1134690	1134695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013522	GT	3	6	1142102	1142107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013522	TG	3	6	1182254	1182259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013522	CT	3	6	1188963	1188968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013522	GA	3	6	1198884	1198889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013522	CT	3	6	1198938	1198943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013522	TC	3	6	1200414	1200419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013522	AC	3	6	1228697	1228702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013522	CT	3	6	1252689	1252694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013522	CT	3	6	1291642	1291647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013522	AC	4	8	1307103	1307110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013522	AG	3	6	1405170	1405175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.