MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 370

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013522	GAGG	2	8	7953	7960	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013522	ATCG	2	8	8381	8388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013522	TTAA	2	8	10371	10378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013522	GATA	2	8	16112	16119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013522	GGTT	2	8	17134	17141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013522	GGAT	2	8	21524	21531	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013522	GGAA	2	8	21725	21732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013522	TATC	2	8	22861	22868	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013522	AAAG	2	8	22870	22877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013522	AGGG	2	8	25108	25115	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013522	GAAA	2	8	34005	34012	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013522	TAGA	2	8	35538	35545	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013522	CGGT	2	8	39913	39920	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013522	CCAT	2	8	43684	43691	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013522	CTGG	2	8	43791	43798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013522	GCCC	2	8	65524	65531	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_013522	CCGG	2	8	65557	65564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013522	CTGG	2	8	65569	65576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013522	GGGA	2	8	70891	70898	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013522	GAAG	2	8	78974	78981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013522	GGGT	2	8	81147	81154	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013522	GAGG	2	8	84575	84582	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013522	GTAG	2	8	86589	86596	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013522	GATC	2	8	89377	89384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013522	GGGA	2	8	96065	96072	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013522	AAAC	2	8	97045	97052	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013522	TAAA	2	8	111782	111789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013522	CGGG	2	8	111814	111821	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013522	CTCC	2	8	112353	112360	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_013522	CCCT	2	8	112419	112426	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_013522	CGGT	2	8	119621	119628	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013522	TTCC	2	8	119635	119642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013522	TTTC	2	8	124782	124789	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013522	TGTC	2	8	124849	124856	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013522	GGGA	2	8	138055	138062	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013522	GGTG	2	8	140277	140284	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013522	AGGA	2	8	150218	150225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013522	GAAG	2	8	157812	157819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013522	GGAG	2	8	162577	162584	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013522	CGGG	2	8	166896	166903	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013522	GGAG	2	8	193284	193291	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013522	GGGC	2	8	199740	199747	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013522	GTAG	2	8	216633	216640	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013522	TCCC	2	8	218311	218318	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_013522	TCGA	2	8	221954	221961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013522	CCAG	2	8	232227	232234	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013522	CAAT	2	8	232248	232255	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013522	CTCC	2	8	233172	233179	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_013522	TCCT	2	8	233621	233628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013522	CCCG	2	8	234943	234950	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_013522	CCGG	2	8	259246	259253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013522	AGGA	2	8	259526	259533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013522	GGCT	2	8	261231	261238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013522	CCCT	2	8	268782	268789	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_013522	AGGG	2	8	270941	270948	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013522	GGGC	2	8	278123	278130	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013522	CCTT	2	8	278912	278919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013522	CCGG	2	8	279420	279427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013522	TGGG	2	8	280133	280140	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013522	CGGC	2	8	281257	281264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013522	CCTT	2	8	283385	283392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013522	GAGG	2	8	305385	305392	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013522	AGGG	2	8	312505	312512	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013522	GAGG	2	8	316997	317004	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013522	GGAG	3	12	325002	325013	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013522	CCCT	2	8	325017	325024	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_013522	AAAC	2	8	326755	326762	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013522	TGAT	2	8	333679	333686	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013522	GGTT	2	8	341373	341380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013522	GGGA	2	8	344750	344757	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013522	GGGC	2	8	347346	347353	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013522	CGAT	2	8	349514	349521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013522	GGAT	2	8	363242	363249	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013522	GTTT	2	8	363258	363265	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013522	GGGT	2	8	374455	374462	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013522	GGGA	2	8	389341	389348	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013522	CTTC	2	8	410428	410435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013522	AGGG	2	8	411456	411463	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013522	TCCA	2	8	411603	411610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013522	CCCT	2	8	412629	412636	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_013522	CGGC	2	8	412853	412860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013522	TCAT	2	8	413933	413940	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013522	CGGG	2	8	427940	427947	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013522	TCCG	2	8	430948	430955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013522	AGGG	2	8	435575	435582	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013522	TAAA	2	8	436869	436876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013522	CTAT	2	8	441590	441597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013522	CCTT	2	8	444433	444440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013522	GGTT	2	8	471575	471582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013522	GTTT	2	8	474708	474715	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013522	GCCC	2	8	474971	474978	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_013522	GGGT	2	8	475012	475019	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013522	GCCC	2	8	476315	476322	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_013522	GGGA	2	8	487204	487211	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013522	TGGA	2	8	487689	487696	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013522	CCTG	2	8	497018	497025	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013522	GGCT	2	8	530603	530610	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013522	CCTT	2	8	541206	541213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013522	CGAT	2	8	551720	551727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013522	GGTG	2	8	572409	572416	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013522	GGGA	2	8	572928	572935	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013522	TCGG	2	8	574244	574251	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013522	CCCG	2	8	582857	582864	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_013522	CCTG	2	8	587598	587605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013522	CCCG	2	8	592404	592411	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_013522	GGGC	2	8	600153	600160	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013522	GATC	2	8	604674	604681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013522	TATT	2	8	616351	616358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013522	CCCT	2	8	617352	617359	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_013522	AGGG	2	8	617511	617518	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013522	TGGC	2	8	618252	618259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013522	GGGA	2	8	622285	622292	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013522	GGGA	2	8	634699	634706	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013522	CCTT	3	12	639778	639789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013522	CGCA	2	8	642502	642509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013522	CGGG	2	8	665817	665824	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013522	GGCC	2	8	677651	677658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013522	ATGT	2	8	686808	686815	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013522	AGGG	2	8	687672	687679	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013522	TGAA	2	8	693737	693744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013522	TGGT	2	8	694980	694987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013522	TCCC	2	8	710133	710140	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_013522	TGGT	2	8	710160	710167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013522	GGTA	2	8	719227	719234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013522	GCTA	2	8	719748	719755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013522	CCTC	2	8	725188	725195	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_013522	TCCC	2	8	732341	732348	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_013522	CAAG	2	8	744312	744319	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013522	AAGG	2	8	744712	744719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013522	GCTT	2	8	744780	744787	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013522	GAAT	2	8	745582	745589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013522	CTTT	2	8	745665	745672	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013522	CTTC	2	8	745714	745721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013522	ATAG	2	8	745930	745937	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013522	AGTT	2	8	746070	746077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013522	TATG	2	8	746382	746389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013522	CCAT	2	8	746548	746555	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013522	TGCT	2	8	746827	746834	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013522	ATCG	2	8	746873	746880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013522	CCAG	2	8	753679	753686	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013522	AGCA	2	8	757618	757625	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013522	GGAT	2	8	769877	769884	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013522	GGCG	2	8	771257	771264	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013522	ATTT	2	8	771403	771410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013522	TTGA	2	8	771421	771428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013522	TCTG	2	8	771485	771492	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013522	TTGC	2	8	771547	771554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013522	TCCC	2	8	772045	772052	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_013522	CCGC	2	8	772114	772121	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_013522	GGAA	2	8	772196	772203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013522	CCCG	2	8	772249	772256	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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295	NC_013522	CTCG	2	8	1546596	1546603	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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297	NC_013522	GATC	2	8	1549764	1549771	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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321	NC_013522	AGGG	2	8	1604589	1604596	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
322	NC_013522	TTCG	2	8	1608639	1608646	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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324	NC_013522	CGGG	2	8	1620623	1620630	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
325	NC_013522	AAAG	2	8	1620667	1620674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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330	NC_013522	GCCC	2	8	1623827	1623834	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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334	NC_013522	ATGA	2	8	1656660	1656667	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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337	NC_013522	GACC	2	8	1667555	1667562	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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340	NC_013522	GAGC	2	8	1696422	1696429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
341	NC_013522	CACC	2	8	1696814	1696821	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
342	NC_013522	AATC	2	8	1697225	1697232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
343	NC_013522	AATC	2	8	1699609	1699616	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
344	NC_013522	TTTG	2	8	1701405	1701412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
345	NC_013522	CCCT	2	8	1709237	1709244	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
346	NC_013522	GGGA	2	8	1719908	1719915	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
347	NC_013522	TCCA	2	8	1724907	1724914	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
348	NC_013522	CTAT	2	8	1725311	1725318	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
349	NC_013522	TTAA	2	8	1726365	1726372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
350	NC_013522	TACC	2	8	1726655	1726662	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
351	NC_013522	GCCC	2	8	1727901	1727908	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
352	NC_013522	GCCC	2	8	1728055	1728062	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
353	NC_013522	CATC	2	8	1729049	1729056	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
354	NC_013522	CCCG	2	8	1741130	1741137	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
355	NC_013522	CCCG	2	8	1746871	1746878	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
356	NC_013522	ATCC	2	8	1765629	1765636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
357	NC_013522	GTAT	2	8	1791663	1791670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
358	NC_013522	AGGG	2	8	1791789	1791796	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
359	NC_013522	GCCC	2	8	1796016	1796023	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
360	NC_013522	AAGG	2	8	1805654	1805661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
361	NC_013522	GGGA	2	8	1810897	1810904	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
362	NC_013522	AGCG	2	8	1811443	1811450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
363	NC_013522	GGAG	2	8	1811516	1811523	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
364	NC_013522	CGCT	2	8	1811746	1811753	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
365	NC_013522	GCAG	2	8	1811930	1811937	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
366	NC_013522	GGTA	2	8	1826426	1826433	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
367	NC_013522	CATA	2	8	1841396	1841403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
368	NC_013522	GGAT	2	8	1841449	1841456	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
369	NC_013522	GAGG	2	8	1841531	1841538	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
370	NC_013522	CCTT	2	8	1848220	1848227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.