MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 275

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012804	AG	3	6	43	48	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012804	TC	3	6	139	144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012804	CA	3	6	5271	5276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012804	TC	3	6	5370	5375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012804	CT	3	6	28458	28463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012804	GA	3	6	60293	60298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012804	TA	3	6	67349	67354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012804	AT	3	6	71835	71840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012804	TA	3	6	77336	77341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012804	CA	3	6	79502	79507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012804	GA	3	6	89500	89505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012804	TC	3	6	91195	91200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012804	TC	3	6	91502	91507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012804	TA	3	6	105765	105770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012804	TA	3	6	107707	107712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012804	TG	3	6	112081	112086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012804	AC	3	6	116728	116733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012804	AG	3	6	117309	117314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012804	AG	3	6	117666	117671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012804	CT	3	6	127571	127576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012804	GA	3	6	148148	148153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012804	AT	3	6	153172	153177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012804	TC	4	8	156693	156700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012804	GA	3	6	161580	161585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012804	TA	3	6	167473	167478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012804	TA	3	6	170040	170045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012804	TA	3	6	173046	173051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012804	TA	3	6	195848	195853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012804	TA	3	6	204353	204358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012804	GA	3	6	205824	205829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012804	TA	3	6	210854	210859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012804	AG	3	6	214094	214099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012804	TA	4	8	217498	217505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012804	TA	3	6	253533	253538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012804	GT	3	6	256833	256838	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012804	AG	3	6	266829	266834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012804	TA	3	6	282759	282764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012804	CT	3	6	283003	283008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012804	TA	3	6	285899	285904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012804	GC	3	6	300386	300391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012804	TC	3	6	300421	300426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012804	AC	3	6	300432	300437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012804	AG	3	6	300454	300459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012804	TC	3	6	306836	306841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012804	TC	3	6	333539	333544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012804	CT	3	6	334412	334417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012804	GC	3	6	337491	337496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012804	TA	3	6	337823	337828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012804	TA	3	6	342085	342090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012804	GT	3	6	348009	348014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012804	AT	3	6	369012	369017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012804	TA	3	6	373255	373260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012804	AG	3	6	382095	382100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012804	CT	3	6	382107	382112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012804	TA	3	6	382183	382188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012804	TC	3	6	383755	383760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012804	AT	4	8	394861	394868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012804	TA	3	6	420164	420169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012804	TA	3	6	452205	452210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012804	GT	3	6	457436	457441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012804	CT	3	6	461799	461804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012804	TA	3	6	465390	465395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012804	AT	3	6	466635	466640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012804	AT	3	6	468590	468595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012804	TA	3	6	470485	470490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012804	TC	3	6	472926	472931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012804	AT	4	8	477615	477622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012804	GA	3	6	493843	493848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012804	GA	4	8	508083	508090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012804	TA	3	6	518833	518838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012804	TC	3	6	518980	518985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012804	TA	3	6	521620	521625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012804	TG	4	8	521730	521737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012804	TC	3	6	534845	534850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012804	TA	3	6	542118	542123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012804	AT	4	8	543910	543917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012804	CT	3	6	556691	556696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012804	AG	3	6	556784	556789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012804	TA	3	6	556953	556958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012804	TC	3	6	557624	557629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012804	TA	3	6	560947	560952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012804	TA	4	8	566868	566875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012804	TA	3	6	578586	578591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012804	TA	3	6	603551	603556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012804	AG	3	6	613527	613532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012804	AG	3	6	619993	619998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012804	GA	3	6	620312	620317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012804	CT	3	6	622902	622907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012804	CT	3	6	623062	623067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012804	AG	3	6	623168	623173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012804	CA	4	8	636487	636494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012804	TG	3	6	637083	637088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012804	TA	3	6	637187	637192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012804	AG	3	6	640434	640439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012804	CA	3	6	641266	641271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012804	AT	3	6	641383	641388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012804	CG	3	6	642280	642285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012804	TC	3	6	642341	642346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012804	AG	3	6	642505	642510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012804	AT	3	6	645206	645211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012804	CT	3	6	659215	659220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012804	AC	3	6	679773	679778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012804	TA	3	6	679801	679806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012804	AT	3	6	691278	691283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012804	AG	3	6	693831	693836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012804	TC	3	6	693851	693856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_012804	CT	3	6	713224	713229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012804	AG	3	6	713345	713350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012804	CT	3	6	723588	723593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012804	GA	3	6	735828	735833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012804	TA	3	6	742057	742062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012804	AC	3	6	751570	751575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_012804	AG	3	6	756418	756423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012804	TA	3	6	775458	775463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012804	GA	3	6	778096	778101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012804	CT	3	6	793464	793469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012804	GT	3	6	801410	801415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012804	AG	3	6	805918	805923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012804	GA	3	6	807072	807077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012804	CT	3	6	819145	819150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012804	TC	3	6	824672	824677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012804	GA	3	6	838370	838375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012804	AT	3	6	843305	843310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012804	AG	3	6	846252	846257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012804	TG	3	6	848903	848908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012804	TC	3	6	852806	852811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_012804	TA	3	6	867982	867987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012804	TA	3	6	889366	889371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012804	AT	4	8	896799	896806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012804	GA	3	6	949450	949455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012804	TA	3	6	961720	961725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012804	TC	3	6	971783	971788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_012804	AG	3	6	995885	995890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012804	TC	3	6	1004501	1004506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_012804	AG	3	6	1017094	1017099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012804	GA	3	6	1022041	1022046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012804	GA	3	6	1029107	1029112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012804	GT	3	6	1039286	1039291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012804	AC	3	6	1046044	1046049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_012804	TA	3	6	1050821	1050826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012804	TA	3	6	1063174	1063179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012804	GA	3	6	1079522	1079527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012804	GT	3	6	1079929	1079934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012804	CT	3	6	1085571	1085576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_012804	TA	3	6	1085583	1085588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012804	TC	3	6	1095623	1095628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_012804	GC	3	6	1097471	1097476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_012804	AT	3	6	1115810	1115815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012804	TC	3	6	1117665	1117670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_012804	AG	3	6	1135343	1135348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012804	CA	3	6	1151721	1151726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_012804	GA	3	6	1154866	1154871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012804	TC	3	6	1160391	1160396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.