MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 1603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012804	GGA	2	6	125	130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012804	TGA	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012804	GAA	2	6	160	165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012804	TGA	2	6	176	181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012804	ATG	2	6	188	193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012804	CTG	2	6	196	201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012804	AGG	2	6	211	216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012804	TCA	2	6	5267	5272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012804	ATT	2	6	5325	5330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012804	TAT	2	6	5521	5526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012804	ATA	2	6	5537	5542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012804	ATT	2	6	5589	5594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012804	AGG	2	6	6908	6913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012804	TTA	2	6	6929	6934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012804	TGC	2	6	6941	6946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012804	TTG	2	6	7023	7028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012804	GAA	2	6	7148	7153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012804	TCT	2	6	7201	7206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012804	GAA	2	6	18245	18250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012804	CAA	2	6	19264	19269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012804	GGT	2	6	19308	19313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012804	TAA	2	6	22491	22496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012804	TGG	2	6	22516	22521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012804	TTC	2	6	23509	23514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012804	ATA	2	6	24774	24779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012804	AAC	2	6	25850	25855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012804	TGA	2	6	28401	28406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012804	GGA	2	6	32159	32164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012804	CCA	2	6	32180	32185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_012804	GGT	2	6	32220	32225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012804	ACC	2	6	33153	33158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_012804	CTC	2	6	37660	37665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_012804	CAA	2	6	37746	37751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012804	ACC	2	6	43240	43245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012804	AAG	2	6	43365	43370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012804	TCA	2	6	60180	60185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012804	TTC	2	6	60217	60222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012804	ACA	2	6	60364	60369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012804	CCA	2	6	63230	63235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_012804	TTG	2	6	65279	65284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012804	ATC	2	6	67322	67327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012804	ACT	2	6	67688	67693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012804	GGT	2	6	67734	67739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012804	CAC	2	6	71798	71803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_012804	TAT	2	6	77309	77314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012804	GGA	2	6	77343	77348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012804	GGT	2	6	77505	77510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012804	GGT	2	6	78513	78518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012804	AGA	2	6	81749	81754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012804	CAG	2	6	81803	81808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012804	TGG	2	6	82909	82914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012804	CCG	2	6	82958	82963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_012804	GAA	2	6	83651	83656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012804	TCT	2	6	84746	84751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012804	TCC	2	6	88308	88313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_012804	TGG	2	6	89199	89204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012804	GAT	2	6	89268	89273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012804	TCA	2	6	89451	89456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012804	CAA	2	6	89458	89463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012804	GGA	3	9	89512	89520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012804	AAC	2	6	89564	89569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012804	GTT	2	6	89587	89592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012804	AAG	2	6	89614	89619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012804	TTA	2	6	89667	89672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012804	AGA	2	6	89726	89731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012804	TAT	2	6	89805	89810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012804	TCA	2	6	90076	90081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012804	TTG	2	6	90173	90178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012804	AGA	2	6	90217	90222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012804	ACC	2	6	90376	90381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_012804	GCC	2	6	91779	91784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_012804	AGG	2	6	92027	92032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012804	TGA	2	6	93298	93303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012804	CAG	2	6	93413	93418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012804	TCA	2	6	93620	93625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012804	CAT	2	6	93647	93652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012804	GAA	2	6	94089	94094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012804	GAA	2	6	105780	105785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012804	CCG	2	6	107763	107768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_012804	TTC	2	6	109029	109034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012804	TCT	2	6	109035	109040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012804	AGA	2	6	112047	112052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012804	ACC	2	6	113401	113406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_012804	ACC	2	6	116669	116674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_012804	CCG	2	6	116717	116722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_012804	TAA	2	6	117045	117050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012804	GTG	2	6	117108	117113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012804	CAT	2	6	117124	117129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012804	CCA	2	6	117236	117241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_012804	AAG	2	6	117354	117359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012804	GAT	2	6	117376	117381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012804	TAT	2	6	117406	117411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012804	CTT	2	6	117459	117464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012804	TCA	2	6	117524	117529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012804	AAG	2	6	117662	117667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012804	CTA	2	6	117766	117771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012804	GTT	2	6	117826	117831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012804	ACC	2	6	117884	117889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_012804	ACC	2	6	117928	117933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_012804	TGA	2	6	117971	117976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012804	CCG	2	6	118009	118014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_012804	GAA	2	6	118239	118244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012804	GGA	2	6	118299	118304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012804	TGA	2	6	118317	118322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012804	CAG	2	6	118332	118337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012804	ATT	2	6	126754	126759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012804	CAT	2	6	126777	126782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012804	TCA	2	6	127082	127087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012804	TTC	2	6	127209	127214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012804	GAA	2	6	127314	127319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012804	GTG	2	6	127549	127554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012804	TCT	2	6	128717	128722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012804	ACC	2	6	131025	131030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_012804	ACC	2	6	131762	131767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_012804	TTA	2	6	131792	131797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012804	GAA	2	6	131817	131822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012804	GCC	2	6	133144	133149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_012804	TGA	2	6	133276	133281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012804	GGT	2	6	134062	134067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012804	TCA	2	6	134107	134112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012804	CAC	2	6	137279	137284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_012804	ATT	2	6	137287	137292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012804	GGA	2	6	140206	140211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012804	GGT	2	6	145398	145403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012804	TCC	2	6	146073	146078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_012804	TGG	2	6	146081	146086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012804	GAA	2	6	151256	151261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012804	CAC	2	6	152246	152251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_012804	TAT	2	6	153039	153044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012804	TGT	2	6	153110	153115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012804	GAT	2	6	153143	153148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012804	AAC	2	6	153190	153195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012804	TCC	2	6	156660	156665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_012804	GAC	2	6	156948	156953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012804	ACC	2	6	159543	159548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_012804	AGG	2	6	161498	161503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012804	TAT	2	6	161535	161540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012804	ACC	2	6	161550	161555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_012804	AGA	2	6	163298	163303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012804	CCT	2	6	163599	163604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_012804	GGT	2	6	163807	163812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012804	TCA	2	6	163882	163887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_012804	ATC	2	6	163911	163916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_012804	ACC	2	6	164996	165001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_012804	TCA	2	6	165526	165531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012804	ACT	2	6	167502	167507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_012804	ATG	2	6	173064	173069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_012804	ACC	2	6	175941	175946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_012804	CTC	2	6	177135	177140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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155	NC_012804	TCC	2	6	183647	183652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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158	NC_012804	TAA	2	6	201085	201090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012804	GAA	2	6	203023	203028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012804	AGA	2	6	204231	204236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_012804	ACC	2	6	204263	204268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_012804	AGG	2	6	208167	208172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012804	TAT	2	6	208178	208183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_012804	GAG	2	6	208187	208192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_012804	AGG	2	6	208239	208244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012804	AGG	2	6	208248	208253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_012804	CGG	2	6	208877	208882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_012804	TCT	2	6	208891	208896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_012804	GAA	2	6	208967	208972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_012804	GTC	2	6	209228	209233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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180	NC_012804	ACC	2	6	210825	210830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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