MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 2744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012804	CT	4	8	1177176	1177183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_012804	GAA	2	6	1178004	1178009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_012804	AAG	2	6	1178022	1178027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_012804	TCA	2	6	1178683	1178688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_012804	GTC	2	6	1178706	1178711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_012804	AT	3	6	1178737	1178742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_012804	GT	3	6	1181854	1181859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_012804	GAT	2	6	1188125	1188130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_012804	A	6	6	1188157	1188162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_012804	GAA	2	6	1188174	1188179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_012804	TG	3	6	1188216	1188221	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_012804	GTG	2	6	1188225	1188230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_012804	CT	3	6	1188998	1189003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_012804	GGT	2	6	1192591	1192596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_012804	TGG	2	6	1194670	1194675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_012804	CAC	3	9	1198477	1198485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_012804	GTCG	2	8	1198488	1198495	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_012804	AT	3	6	1198496	1198501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_012804	ACC	2	6	1200510	1200515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_012804	GGT	2	6	1200538	1200543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_012804	A	7	7	1200548	1200554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_012804	TCTA	2	8	1200575	1200582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_012804	ACA	2	6	1200611	1200616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_012804	AGG	2	6	1200634	1200639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_012804	CAAA	2	8	1203795	1203802	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_012804	TA	3	6	1206385	1206390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_012804	ATTAA	2	10	1206444	1206453	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_012804	CTA	2	6	1206477	1206482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_012804	GAT	2	6	1206489	1206494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_012804	A	7	7	1206510	1206516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_012804	GGAAA	2	10	1207569	1207578	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_012804	TTA	2	6	1208851	1208856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_012804	TTC	2	6	1210287	1210292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_012804	ACCATA	2	12	1210304	1210315	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_012804	ATT	2	6	1211155	1211160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_012804	CTT	2	6	1211191	1211196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_012804	TTA	2	6	1211222	1211227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_012804	AG	3	6	1211266	1211271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_012804	CTTTT	2	10	1211336	1211345	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1540	NC_012804	CAT	2	6	1211358	1211363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_012804	CCA	2	6	1213042	1213047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_012804	TAA	2	6	1213070	1213075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_012804	ACTTA	2	10	1213076	1213085	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1544	NC_012804	CCA	2	6	1220768	1220773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_012804	TTC	2	6	1220826	1220831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_012804	A	6	6	1220839	1220844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_012804	GAG	2	6	1220855	1220860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_012804	TGT	2	6	1220905	1220910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_012804	TTC	2	6	1220962	1220967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_012804	ATG	2	6	1221022	1221027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_012804	TCG	2	6	1221052	1221057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_012804	AGGA	2	8	1221119	1221126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_012804	TTC	2	6	1221127	1221132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_012804	CCA	2	6	1221136	1221141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_012804	CTT	2	6	1221192	1221197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_012804	AT	3	6	1221225	1221230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_012804	ACGG	2	8	1221258	1221265	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_012804	AAT	2	6	1221470	1221475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_012804	AGT	2	6	1221573	1221578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_012804	CTC	2	6	1221599	1221604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_012804	GTT	2	6	1221919	1221924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_012804	C	6	6	1221942	1221947	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1563	NC_012804	ACT	2	6	1221990	1221995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_012804	CA	3	6	1222005	1222010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_012804	TTG	2	6	1222150	1222155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_012804	TTC	2	6	1222182	1222187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_012804	TATT	2	8	1222195	1222202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_012804	ATT	2	6	1222213	1222218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_012804	AGA	2	6	1222314	1222319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_012804	A	6	6	1222385	1222390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_012804	TTG	2	6	1222417	1222422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_012804	GGT	2	6	1222461	1222466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_012804	GCC	2	6	1222471	1222476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_012804	CGG	2	6	1222526	1222531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_012804	AAT	2	6	1222656	1222661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_012804	TTATC	2	10	1222677	1222686	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1577	NC_012804	CCTA	2	8	1222785	1222792	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_012804	ATA	2	6	1222919	1222924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_012804	A	6	6	1222936	1222941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_012804	CTC	2	6	1226637	1226642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_012804	T	6	6	1226646	1226651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_012804	TTC	2	6	1226666	1226671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_012804	GTGG	2	8	1227658	1227665	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_012804	TAA	2	6	1227677	1227682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_012804	GT	3	6	1234085	1234090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_012804	TG	3	6	1234139	1234144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_012804	AAACG	2	10	1234145	1234154	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1588	NC_012804	GA	3	6	1234171	1234176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_012804	CAA	2	6	1234180	1234185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_012804	CGGGG	2	10	1234277	1234286	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1591	NC_012804	AAGG	2	8	1235193	1235200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_012804	CCGG	2	8	1235293	1235300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_012804	ATCC	2	8	1237720	1237727	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_012804	CGT	2	6	1240188	1240193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_012804	TC	3	6	1240234	1240239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_012804	TCGC	2	8	1240285	1240292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_012804	CA	3	6	1240380	1240385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_012804	CTTAAA	2	12	1240932	1240943	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1599	NC_012804	GTC	2	6	1240947	1240952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_012804	T	6	6	1243317	1243322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_012804	TAT	2	6	1245544	1245549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_012804	TTC	2	6	1245555	1245560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_012804	CAT	2	6	1245604	1245609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_012804	TAC	2	6	1245614	1245619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_012804	TC	3	6	1245622	1245627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_012804	GAC	2	6	1245640	1245645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_012804	AGG	3	9	1245678	1245686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_012804	TTC	2	6	1246935	1246940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_012804	T	6	6	1246976	1246981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_012804	TTCA	2	8	1246987	1246994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_012804	TTA	2	6	1248245	1248250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_012804	T	6	6	1248257	1248262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_012804	CGT	2	6	1248298	1248303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_012804	TTTC	2	8	1249613	1249620	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1615	NC_012804	TTC	2	6	1249626	1249631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_012804	TGG	2	6	1249713	1249718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_012804	C	6	6	1251439	1251444	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1618	NC_012804	ACC	2	6	1252500	1252505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1619	NC_012804	ATT	2	6	1252532	1252537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_012804	TAT	2	6	1252547	1252552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_012804	CGA	2	6	1253144	1253149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_012804	G	6	6	1253181	1253186	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_012804	C	6	6	1253201	1253206	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1624	NC_012804	T	7	7	1253234	1253240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_012804	CGC	2	6	1255208	1255213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_012804	ACC	2	6	1256801	1256806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_012804	GAAG	2	8	1260566	1260573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_012804	ACT	2	6	1263481	1263486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_012804	CCA	2	6	1263959	1263964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_012804	GTT	2	6	1263975	1263980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_012804	TAA	2	6	1265572	1265577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_012804	CCA	2	6	1267892	1267897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_012804	TGG	2	6	1270327	1270332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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