MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 2744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012804	AT	3	6	369012	369017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_012804	T	6	6	369022	369027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012804	T	6	6	369040	369045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012804	TAA	2	6	369048	369053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012804	A	6	6	369052	369057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_012804	CAC	2	6	370124	370129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_012804	TAA	2	6	370196	370201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012804	ACAG	2	8	370202	370209	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
509	NC_012804	TA	3	6	373255	373260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_012804	A	6	6	373322	373327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012804	CCA	2	6	375017	375022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_012804	AAGC	2	8	377942	377949	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
513	NC_012804	AG	3	6	382095	382100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012804	CT	3	6	382107	382112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_012804	TA	3	6	382183	382188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_012804	AAC	2	6	382201	382206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_012804	GAA	2	6	382258	382263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012804	CTG	2	6	382343	382348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_012804	TAA	2	6	382428	382433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_012804	TC	3	6	383755	383760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_012804	TTTC	2	8	386318	386325	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
522	NC_012804	T	6	6	386355	386360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012804	GAG	2	6	386400	386405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012804	CCT	2	6	386413	386418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_012804	GAT	2	6	386427	386432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_012804	GGT	2	6	386451	386456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012804	AAC	2	6	389222	389227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_012804	GTT	2	6	389228	389233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_012804	AGA	2	6	389306	389311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012804	T	6	6	389324	389329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012804	TTA	2	6	389353	389358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_012804	TGA	2	6	390908	390913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_012804	TCCAG	2	10	390914	390923	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
534	NC_012804	A	6	6	391015	391020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012804	ACCC	2	8	391051	391058	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
536	NC_012804	TGA	2	6	391093	391098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012804	GCTT	2	8	391130	391137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NC_012804	TGG	2	6	391152	391157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_012804	GGCG	2	8	391196	391203	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
540	NC_012804	CCGG	2	8	391247	391254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_012804	ACC	2	6	391307	391312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_012804	GAGG	2	8	391336	391343	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012804	CTT	2	6	394854	394859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_012804	AT	4	8	394861	394868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012804	GGT	2	6	394904	394909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_012804	T	6	6	398040	398045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012804	ATT	2	6	398071	398076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012804	AAT	2	6	398078	398083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012804	TGG	2	6	398117	398122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_012804	GGCC	2	8	398148	398155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_012804	A	6	6	398168	398173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012804	AGGT	2	8	398177	398184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_012804	AGT	2	6	398187	398192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_012804	CTTT	2	8	405309	405316	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
555	NC_012804	TCA	2	6	407451	407456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_012804	TTC	2	6	407699	407704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_012804	T	6	6	407717	407722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012804	ACC	2	6	408546	408551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_012804	GTTAAA	2	12	408567	408578	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_012804	TTC	2	6	408975	408980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_012804	TTA	2	6	408987	408992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_012804	TTG	2	6	410727	410732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012804	TTA	2	6	410740	410745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012804	ACC	3	9	414461	414469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_012804	GTG	2	6	415019	415024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_012804	A	6	6	418024	418029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_012804	AGA	2	6	419310	419315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_012804	CAC	3	9	420036	420044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_012804	AATAA	2	10	420052	420061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_012804	CTTA	2	8	420068	420075	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
571	NC_012804	TA	3	6	420164	420169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012804	CGG	2	6	420175	420180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_012804	TCA	2	6	421588	421593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_012804	GTT	2	6	421610	421615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_012804	TGT	2	6	424214	424219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_012804	CTT	2	6	424236	424241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_012804	AACT	2	8	424252	424259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_012804	CAC	2	6	425896	425901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_012804	CGT	2	6	425913	425918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_012804	AAT	2	6	425928	425933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_012804	T	6	6	425948	425953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_012804	TCA	2	6	425959	425964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_012804	AAGCTT	2	12	427354	427365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
584	NC_012804	GGT	2	6	429114	429119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_012804	TAA	2	6	430446	430451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012804	TGG	2	6	431751	431756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_012804	CGG	2	6	432445	432450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_012804	GGA	2	6	432470	432475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_012804	AAG	2	6	432476	432481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012804	CAG	2	6	440307	440312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_012804	AAG	2	6	440384	440389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_012804	CCT	2	6	442109	442114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_012804	TTC	2	6	442115	442120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_012804	C	6	6	443046	443051	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
595	NC_012804	GCTTT	2	10	443092	443101	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
596	NC_012804	GAG	2	6	443921	443926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_012804	CTC	2	6	443927	443932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_012804	CGG	2	6	443944	443949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_012804	GGA	2	6	443982	443987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_012804	GTT	2	6	448567	448572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012804	A	6	6	449438	449443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_012804	GATA	2	8	449444	449451	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012804	CAC	2	6	452096	452101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_012804	GTAAAA	2	12	452162	452173	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_012804	TA	3	6	452205	452210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012804	AAAG	2	8	452955	452962	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
607	NC_012804	ACC	2	6	454923	454928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_012804	TGGT	2	8	455003	455010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012804	GTC	2	6	456105	456110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_012804	CCG	2	6	456127	456132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_012804	GTG	2	6	456886	456891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_012804	GTT	2	6	456915	456920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_012804	GT	3	6	457436	457441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_012804	ATG	2	6	457577	457582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_012804	TTA	2	6	457599	457604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_012804	T	6	6	460918	460923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_012804	ACT	2	6	461319	461324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_012804	CT	3	6	461799	461804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_012804	T	7	7	463225	463231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_012804	GAATTT	2	12	463267	463278	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012804	TGGGG	2	10	463372	463381	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
622	NC_012804	TA	3	6	465390	465395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_012804	TAA	2	6	465716	465721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_012804	ATC	2	6	466419	466424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_012804	TGG	2	6	466445	466450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012804	CCCG	2	8	466489	466496	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
627	NC_012804	G	6	6	466512	466517	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012804	CGG	2	6	466578	466583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_012804	CCA	2	6	466586	466591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_012804	AT	3	6	466635	466640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_012804	CTT	2	6	468575	468580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_012804	T	6	6	468579	468584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_012804	AT	3	6	468590	468595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_012804	TA	3	6	470485	470490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_012804	AAGC	2	8	471702	471709	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
636	NC_012804	TGG	2	6	471923	471928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_012804	TC	3	6	472926	472931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
638	NC_012804	TTC	2	6	472986	472991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_012804	A	6	6	473007	473012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_012804	AGGG	2	8	473016	473023	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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